标题文本2012年12月17日3ZGCKEAP1-NEH2配合物的晶体结构压缩机模具ID:1;化合物2分子:类KELCH ECH相关蛋白1;压缩机3链条:A、B;化合物4碎片:人类KEAP1的KELCH域,残留物321-609;化合物5异名:NRF2、INRF2、KELCH样蛋白19的细胞溶质抑制剂;COMPND 6工程:是的;COMPND 7突变:是;COMPND 8摩尔ID:2;COMPND 9分子:核因子红系2相关因子2;压缩机10链条:C;化合物11碎片:残留物76-82;化合物12同义词:NF-E2-相关因子2、NFE2-相关因子2和HEBP1,合成13核因子,红细胞衍生2,如2,新H2衍生肽;压缩机14工程:是源MOL_ID:1;来源2 ORGANISM_SCIENTIFIC:HOMO SAPIENS;来源3有机物常见:人类;来源4 ORGANISM_TAXID:9606;来源5表达_系统:大肠杆菌;来源6 EXPRESSION_SYSTEM_TAXID:469008;来源7 EXPRESSION_SYSTEM_STRAIN:BL21(DE3);来源8表达式系统变量:PLYSS;来源9 EXPRESSION_SYSTEM_VECTOR_TYPE:血浆;来源10 EXPRESSION_SYSTEM_VECTOR:PET15B;来源11 MOL_ID:2;来源12合成:是;来源13 ORGANISM_SCIENTIFIC:HOMO SAPIENS;来源14 ORGANISM_TAXID:9606KEYWDS转录,蛋白质-肽复合物EXPDTA X射线衍射作者S.HOERE、D.REINERT、K.OSTMANN、Y.HOEVELS、H.NAR修订版3 2013年12月20日3ZGC 1备注修订版2 2018年6月20日3ZGC 1备注链接修订版1 2013年6月12日3ZGC 0JRNL AUTH S.HORR、D.REINERT、K.OSTMANN、Y.HOEVELS、H.NARJRNL TITL晶体接触工程获得JRNL TITL 2人体KEAP1的KELCH域适用于连体浸泡JRNL TITL 3实验。JRNL参考ACTA晶体。,第节。2013财年69 592JRNL参考ESSN 1744-3091JRNL PMID 23722832号JRNL DOI电话:10.1107/S174430911301124X备注2备注2决议。2.20埃。备注3备注3精炼。备注3程序:BUSTER 2.11.2备注3作者:BRICOGNE、BLANC、BRANDL、FLENSBURG、KELLER、,备注3:PACIOREK、ROVERSI、SHARFF、SMART、VONRHEIN、,备注3:WOMACK、MATTHEWS、TEN EYCK、TRONRUD备注3备注3精炼中使用的数据。备注3分辨率范围高(安):2.20备注3分辨率范围低(安):40.00备注3数据截止(SIGMA(F)):0.000备注3范围完整性(%):99.8备注3反射次数:61947备注3备注3与精炼中使用的数据相匹配。备注3交叉验证方法:通关备注3自由R值测试集选择:随机备注3 R值(工作+测试集):0.173备注3 R值(工作集):0.172备注3自由R值:0.188备注3自由R值测试集大小(%):5.000备注3自由R值测试集计数:3097备注3自由R值的估计误差:空备注3在最高分辨率的箱子中备注3。备注3使用的箱子总数:20备注3箱子分辨率范围高(安):2.20备注3箱子分辨率范围低(角度):2.26备注3箱子完整性(工作+测试)(%):99.81备注3箱子中的反射(工作+测试集):4536备注3 BIN R值(工作+测试集):0.2215备注3箱子中的反射(工作装置):4309备注3 BIN R值(工作集):0.2211备注3无箱R值:0.2275备注3仓位自由R值测试集大小(%):5.00备注3无箱R值测试集计数:227备注3 BIN FREE R值估计误差:NULL备注3备注3炼油中使用的非氢原子数量。备注3蛋白质原子:4422备注3核酸原子:0备注3异质原子:40备注3溶剂原子:550备注3记下3 B值。威尔逊地块备注3:44.60备注3平均B值(总体,A**2):40.64备注3总体各向异性B值。备注3 B11(A**2):-4.41140备注3 B22(A**2):3.63120备注3 B33(A**2):0.78020备注3 B12(A**2):0.00000备注3 B13(A**2):0.00000备注3 B23(A**2):0.00000备注3备注3估计坐标误差。备注3 LUZZATI地块ESD(A):0.239基于R值(A)的备注3 DPI(爆炸当量-10):0.140基于自由R值(A)的备注3 DPI(爆炸当量-9):0.122基于R值(A)的备注3 DPI(CRUICKSHANK):0.131基于自由R值(A)的备注3 DPI(CRUICKSHANK):0.118备注3备注3参考文献:BLOW,D.(2002)ACTA CRYST D58,792-797备注3 CRUICKSHANK,D.W.J.(1999)ACTA CRYST D55,583-601备注3备注3相关系数。备注3相关系数FO-FC:0.955备注3相关系数FO-FC FREE:0.949备注3备注3定义的几何函数项数量:15备注3术语配重功能。备注3保函长度:4562;2.000 ; 和声备注3粘结角度:6202;2.000 ; 和声备注3扭转角:1498;2.000 ; 正弦形备注3三角碳平面:102;2.000 ; 和声备注3总图:702;5.000 ; 和声备注3各向同性热因子:4562;20.000 ; 和声备注3不良非绑定联系人:空;无效的;无效的备注3:扭力不当:空;无效的;无效的备注3伪旋转角度:空;无效的;无效的备注3手部不正确扭转:564;5.000 ; 半哈密顿语备注3占用总量:空;无效的;无效的备注3公用设施距离:空;无效的;无效的备注3公用设施角度:空;无效的;无效的备注3实用扭力:零;无效的;无效的备注3理想距离接触术语:5310;4.000 ; 半哈密顿语备注3记下理想值的3个RMS偏差。备注3粘结长度(A):0.008备注3结合角(度):1.02备注3肽欧米茄扭转角度(度):3.68备注3其他扭转角(度):16.16备注3备注3 TLS详细信息备注3 TLS组数:空备注3备注3其他精炼备注:空备注4备注4 ZGC符合格式V.3.30,2011年7月13日备注100备注100本条目已由PDBE于2012年12月17日处理。备注100存款ID为D_1290055155。备注200备注200实验细节备注200实验类型:X射线衍射备注200数据收集日期:2007年11月26日备注200温度(开尔文):100备注200 PH:5备注200使用的晶体数量:1备注200备注200同步器(是/否):是备注200辐射源:SLS备注200梁线:X06SA备注200 X射线发生器型号:空备注200单色或LAUE(M/L):M备注200波长或范围(A):0.979备注200单色仪:空备注200光学器件:空备注200备注200探测器类型:CCD备注200探测器制造商:MARRESEARCHREMARK 200强度集成软件:XDS备注200数据缩放软件:SCALA备注200备注200独特反射次数:61950备注200分辨率范围高(A):2.200备注200分辨率范围低(A):76.880备注200拒绝标准(SIGMA(I)):2.000备注200总体评论200。备注200范围(%)的完整性:99.8备注200数据冗余:4.000备注200 R合并(I):0.10000备注200 R SYM(I):空备注200数据集:14.1000备注200在最高分辨率外壳中备注200。备注200最高分辨率外壳,范围高(A):2.20备注200最高分辨率外壳,范围低(A):2.27备注200外壳完整性(%):99.9在外壳中备注200数据冗余:4.10备注200 R壳体合并(I):0.50000壳体注释200 R SYM(I):空备注200对于壳体:2.900备注200备注200衍射协议:单波长备注200用于确定结构的方法:分子替换备注200使用的软件:PHASER备注200启动型号:PDB ENTRY 1U6D备注200备注200备注:无备注280备注280晶体备注280溶剂含量VS(%):72.00备注280马修斯系数,VM(埃**3/DA):4.40备注280备注280结晶条件:4.0 M乙酸铵,0.1 M钠备注280乙酸三水合物PH 4.6,PH 5备注290备注290晶体对称性备注290空间群的对称算子:P 21 21 21备注290备注290对称性备注290 NNNMMM操作员备注290 1555 X、Y、Z备注290 2555-X+1/2,-Y,Z+1/2备注290 3555-X,Y+1/2,-Z+1/2备注290 4555 X+1/2,-Y+1/2,-Z备注290备注290,其中NNN->操作员编号备注290 MMM->翻译向量备注290备注290晶体对称变换备注290以下变换作用于原子/混合体在本条目中备注290条记录,以制作结晶备注290个相关分子。备注290 SMTRY1 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 0.00000备注290 SMTRY2 1 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000备注290 SMTRY3 1 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000备注290 SMTRY1 2-1.00000000.000000 0.000000 38.05150备注290 SMTRY2 2 0.000000-1.000000.000000 0.00000备注290 SMTRY3 2 0.000000 0.000000 1.000000 103.77050备注290 SMTRY1 3-1.00000000.000000 0.000000 0.00000备注290 SMTRY2 3 0.000000 1.000000 0.000000 38.03200备注290 SMTRY3 3 0.000000 0.000000-1.000000 103.77050备注290 SMTRY1 4 1.0000000.000000 0.000000 38.05150备注290 SMTRY2 4 0.000000-1.000000.00000 38.03200备注290 SMTRY3 4 0.000000 0.000000-1.000000 0.00000备注290备注290备注:空备注300备注300生物分子:1、2备注300关于所提供的作者和/或程序,请参见备注350备注300中生成的结构装配信息备注300这个条目。备注还可以提供以下信息备注300埋地面积。备注350记下代表已知的完整乘数的350个坐标备注350生物意义上的齐聚状态备注350应用生物转化可以生成分子记住下面给出的350。非晶态和备注:给出了350个晶体分析操作。备注350备注350生物分子:1备注350作者确定的生物单位:DIMERIC备注350软件确定的四元结构:DIMERIC备注350使用的软件:PISA备注350总埋地面积:1550安**2备注复合体的350表面积:11970安**2备注350无溶剂能量变化:-2.1 KCAL/MOL备注350将以下内容应用于链条:A、C备注350生物1 1.0000000.000000 0.000000 0.00000 0.00000备注350 BIOMT2 1 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000备注350生物3 1 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000备注350备注350生物分子:2备注350作者确定的生物单位:单体备注350软件确定的四元结构:单数备注350使用的软件:PISA备注350将以下内容应用于链条:B备注350生物1 1.0000000.000000 0.000000 0.00000 0.00000备注350 BIOMT2 1 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000备注350生物3 1 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000备注465备注465缺失残留物备注465以下残留物不在备注465实验。(M=型号;RES=剩余名称;C=链条备注465标识符;SSSEQ=序列号;I=插入代码。)备注465备注465 M RES C SSSEQI备注465 MET A 300备注465 GLY A 301备注465 SER A 302备注465 SER A 303备注465 HIS A 304备注465 HIS A 305备注465 HIS A 306备注465 HIS A 307备注465 HIS A 308备注465 HIS A 309备注465 SER A 310备注465 SER A 311备注465 GLY A 312备注465 LEU A 313备注465 VAL A 314备注465 PRO A 315备注465 ARG A 316备注465 GLY A 317备注465 SER A 318备注465 HIS A 319备注465 MET A 320备注465 ALA A 321备注465 PRO A 322备注465 LYS A 323备注465 VAL A 324备注465 MET B 300备注465 GLY B 301备注465 SER B 302备注465 SER B 303备注465 HIS B 304备注465 HIS B 305备注465 HIS B 306备注465 HIS B 307备注465他的B 308备注465 HIS B 309备注465用户B 310备注465用户B 311备注465 GLY B 312备注465 LEU B 313备注465 VAL B 314备注465 PRO B 315备注465 ARG B 316备注465 GLY B 317备注465 SER B 318备注465 HIS B 319备注465 MET B 320备注465 ALA B 321备注465 PRO B 322备注465 LYS B 323备注465 VAL B 324备注500评论500几何学和立体化学备注500子主题:同一非对称单元中的紧密接触备注500备注500以下原子紧密接触。备注500备注500 ATM1 RES C SSEQI ATM2 RES S C SSEQUI距离备注500 N GLY C 76 C GLU C 82 1.34备注500备注500备注:空备注500评论500几何学和立体化学备注500主题:扭转角备注500在预期的拉马钱德兰区域外标注500个扭转角:备注500(M=型号;RES=剩余名称;C=链标识符;备注500 SSEQ=序列号;I=插入代码)。备注500备注500标准表:备注500格式:(10X,I3,1X,A3,1X,A1,I4,A1,4X,F7.2,3X,F7.2)备注500备注500个预期值:GJ KLEYWEGT和TA JONES(1996)。φ/磅/平方英寸-评论500 CHOLOGY:再次访问拉马钱德兰。结构4,1395-1400备注500备注500 M RES CSSEQI PSI PHI备注500 ARG A 336-40.47 74.62备注500 HIS A 575-42.55-140.61备注500 ARG B 336-39.09 73.45备注500 THR B 481-54.23-120.04备注500 GLN B 528-57.71-124.41备注500 HIS B 575-43.23-141.14备注500备注500备注:空备注525备注525溶剂备注525备注525溶剂分子的链标识符备注525表示聚合物链,其中聚合物链最多备注525密切相关。备注列出了所有溶剂请记住525个分子,它们与备注525最近的聚合物链(M=型号;备注525 RES=剩余名称;C=链标识符;SSEQ=序列备注525编号;I=插入代码):备注525备注525 M RES CSSEGI备注525 B2199距离=5.94安备注525 HOH C2003距离=7.83安备注525HOH C2004距离=6.06安备注800备注800站点备注800站点标识符:AC1备注800证据_代码:软件REMARK 800 sitedescription:剩余动作B的绑定位点1610备注800备注800站点标识符:AC2备注800证据代码:软件备注800场地_说明:《1610年剩余物绑定场地法》备注800备注800站点标识符:AC3备注800证据_代码:软件备注800场地_说明:《1611年剩余物绑定场地法案》备注800备注800站点标识符:AC4备注800证据_代码:软件备注800场地_说明:《1611年剩余物绑定场地法》备注800备注800站点标识符:AC5备注800证据_代码:软件备注800场地_说明:《1612年剩余物绑定场地法案》备注800备注800站点标识符:AC6备注800证据_代码:软件备注800场地_说明:《1612年剩余物绑定场地法》备注800备注800站点标识符:AC7备注800证据_代码:软件备注800场地_说明:《1613年剩余物绑定场地法案》备注800备注800站点标识符:AC8备注800证据_代码:软件备注800场地_说明:《1613年剩余物绑定场地法》备注800备注800站点标识符:AC9备注800证据_代码:软件备注800场地_说明:《1614年剩余物绑定场地法案》备注800备注800站点标识符:BC1备注800证据_代码:软件备注800场地_说明:《1615年剩余物绑定场地法案》备注900备注900个相关条目备注900相关ID:3ZGD相关DB:PDB一个KEAP1突变体的remark900晶体结构备注999备注999序列备注999 E540A E542A备注999链C通过甘氨酸76循环DBREF 3ZGC A 321 609 UNP Q14145 KEAP1_HUMAN 321 608号DBREF 3ZGC B 321 609 UNP Q14145 KEAP1_HUMAN 321 608号数据库参考号3ZGC C 76 82 UNP Q16236 NF2L2_HUMAN 76 82SEQADV 3ZGC MET A 300 UNP Q14145表达标签SEQADV 3ZGC GLY A 301 UNP Q14145表达标签SEQADV 3ZGC SER A 302 UNP Q14145表达标签SEQADV 3ZGC SER A 303 UNP Q14145表达标签SEQADV 3ZGC HIS A 304 UNP Q14145表达标签SEQADV 3ZGC HIS A 305 UNP Q14145表达标签SEQADV 3ZGC HIS A 306 UNP Q14145表达标签SEQADV 3ZGC HIS A 307 UNP Q14145表达标签SEQADV 3ZGC HIS A 308 UNP Q14145表达标签SEQADV 3ZGC HIS A 309 UNP Q14145表达标签SEQADV 3ZGC SER A 310 UNP Q14145表达标签SEQADV 3ZGC SER A 311 UNP Q14145表达标签SEQADV 3ZGC GLY A 312 UNP Q14145表达标签SEQADV 3ZGC LEU A 313 UNP Q14145表达标签SEQADV 3ZGC VAL A 314 UNP Q14145表达标签SEQADV 3ZGC PRO A 315 UNP Q14145表达标签SEQADV 3ZGC ARG A 316 UNP Q14145表达标签SEQADV 3ZGC GLY A 317 UNP Q14145表达标签SEQADV 3ZGC SER A 318 UNP Q14145表达标签SEQADV 3ZGC HIS A 319 UNP Q14145表达标签SEQADV 3ZGC MET A 320 UNP Q14145表达标签SEQADV 3ZGC ALA A 540 UNP Q14145 GLU 540工程突变SEQADV 3ZGC ALA A 542 UNP Q14145 GLU 542基因工程突变SEQADV 3ZGC MET B 300 UNP Q14145表达标签SEQADV 3ZGC GLY B 301 UNP Q14145表达标签SEQADV 3ZGC SER B 302 UNP Q14145表达标签SEQADV 3ZGC SER B 303 UNP Q14145表达标签SEQADV 3ZGC HIS B 304 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