集管单元粘合剂08年8月01日2VZGαC端钙蛋白同源结构域的晶体结构-标题2帕文与PAXILLIN LD2主题的复合压缩机模具ID：1；化合物2分子：PAXILLIN；压缩机3链条：A；化合物4碎片：PAXILLIN LD1主题，残留物141-160；压缩机5工程：是；压缩机6 MOL_ID:2；化合物7分子：α-PARVIN；压缩机8链条：B；化合物9片段：C-末端钙蛋白同源域，残基242-372；COMPND 10同义词：ACTOPAXIN，CH-ILKBP，钙蛋白酶样整合素连接激酶-合成11结合蛋白，基质重塑相关蛋白2；COMPND 12工程：是的源MOL_ID:1；来源2 ORGANISM_SCIENTIFIC:HOMO SAPIENS；来源3 ORGANISM_COMMON：人类；来源4 ORGANISM_TAXID:9606；来源5基因：PXN；来源6表达_系统：大肠杆菌；来源7 EXPRESSION_SYSTEM_TAXID:511693；来源8 EXPRESSION_SYSTEM_STRAIN:BL21；来源9 EXPRESSION_SYSTEM_PLASMID：PGEX-6P1；来源10 MOL_ID:2；资料来源11 ORGANISM_SCIENTIFIC:HOMO SAPIENS；资料来源12有机物通用：人类；来源13 ORGANISM_TAXID:9606；来源14基因：帕尔瓦，MXRA2；来源15表达_系统：大肠杆菌BL21；来源16 EXPRESSION_SYSTEM_TAXID:511693KEYWDS钙蛋白同源域，细胞膜，细胞粘附，金属KEYWDS 2结合、细胞骨架、细胞连接、肌动蛋白结合、膜、LD2KEYWDS 3基序，LIM域，磷蛋白EXPDTA X射线衍射作者S.LORENZ、I.VAKONAKIS、E.D.LOWE、I.D.CAMPBELL、M.E.M.NOBLE、M.K.HOELLERRER修订版7 13-DEC-23 2VZG 1备注修订版6 2019年7月10日VZG 1备注版本5 2019年4月24日2VZG 1压缩源JRNL备注修订版5 2 1 DBREF修订版4 2012年5月30日VZG作者JRNL REMARK HETSYN版本3 2011年7月13日VZG版本修订版2 2009年2月24日2VZG 1版本修订版1 28-OCT-08 2VZG 0JRNL AUTH S.LORENZ、I.VAKONAKIS、E.D.LOWE、I.D.CAMPBELL、M.E.NOBLE、，JRNL授权2 M.K.HOELLERRPAXILLIN LD相互作用的JRNL标题结构分析JRNL TITL 2动机和阿尔法-帕文。JRNL参考结构V.16 1521 2008JRNL参考ISSN 0969-2126JRNL PMID 18940607年JRNL DOI 10.1016/J.STR.2008.08.007备注2备注2决议。1.80角度。备注3备注3精炼。备注3程序：REFMAC 5.2.0019备注3作者：穆舒多夫、斯库巴克、勒贝德夫、潘努、斯坦纳，备注3:NICHOLLS、WINN、LONG、VAGIN备注3备注3精炼目标：最大可能性备注3备注3精炼中使用的数据。备注3分辨率范围高（安）：1.80备注3分辨率范围低（安）：58.22备注3数据截止（SIGMA（F））：空备注3范围完整性（%）：99.4备注3反射次数：13218备注3备注3与精炼中使用的数据相匹配。备注3交叉验证方法：通关备注3自由R值测试集选择：随机备注3 R值（工作+测试集）：0.187备注3 R值（工作集）：0.186备注3自由R值：0.221备注3自由R值测试集大小（%）：5.000备注3自由R值测试集计数：690备注3在最高分辨率的箱子中备注3。备注3使用的箱子总数：20备注3箱子分辨率范围高（A）：1.80备注3箱子分辨率范围低（A）：1.85备注3箱子中的反射（工作装置）：965备注3箱子完整性（工作+测试）（%）：空备注3 BIN R值（工作设置）：0.2550备注3无箱R值设置计数：53备注3无箱R值：0.3470备注3备注3炼油中使用的非氢原子数量。备注3个蛋白质原子：1149备注3核酸原子：0备注3异质原子：43备注3溶剂原子数：65备注3记下3 B值。备注3 B值类型：可能剩余威尔逊地块备注3（A**2）：空备注3平均B值（总体，A**2）：25.44备注3总体各向异性B值。备注3 B11（A**2）：1.11000备注3 B22（A**2）：-0.84000备注3 B33（A**2）：-0.28000备注3 B12（A**2）:0.00000备注3 B13（A**2）:0.00000备注3 B23（A**2）：0.00000备注3备注3估计总体坐标误差。备注3基于R值的ESU（A）:0.153备注3基于自由R值的ESU（A）:0.136备注3基于最大似然（A）的ESU：0.097备注3基于最大似然的B值ESU（A**2）：6.158备注3备注3相关系数。备注3相关系数FO-FC:0.953备注3相关系数FO-FC FREE：0.937备注3备注3 RMS与理想值的偏差计算RMS权重备注3精炼原子的键长（A）:1456；0.010 ; 0.022备注3债券长度其他（A）：空；无效的；无效的备注3精炼原子的键角（度）：1983；1.225 ; 2.023备注3键角其他（度）：空；无效的；无效的备注3扭转角，周期1（度）：188；4.401；5备注3扭转角，周期2（度）：65；33.433 ;25.231备注3扭转角，周期3（度）：278；12.536 ;15备注3扭转角，周期4（度）：6；24.915 ;15备注3手心约束（A**3）：225；0.086 ; 0.200备注3精炼原子总平面图（A）：1103；0.005 ; 0.020备注3总平面其他（A）：空；无效的；无效的备注3精炼原子的非结合接触（A）:691；0.214 ; 0.200备注3非粘结触点其他（A）：空；无效的；无效的备注3非键合扭转精炼原子（A）：1017；0.301 ; 0.200备注3非粘结扭转其他（A）：空；无效的；无效的备注3氢键（X…Y）精炼原子（A）:69；0.181；0.200备注3-氢键（X…Y）其他（A）：无效；无效的；无效的备注3潜在的金属离子精炼原子（A）：零；无效的；无效的备注3潜在金属离子其他（A）：空；无效的；无效的备注3对称VDW精炼原子（A）：83；0.239 ; 0.200备注3对称VDW其他（A）：空；无效的；无效的备注3对称氢键精炼原子（A）：21；0.142 ; 0.200备注3对称氢键其他（A）：空；无效的；无效的备注3对称金属离子精炼原子（A）：空；无效的；无效的备注3对称金属离子其他（A）：空；无效的；无效的备注3备注3各向异性热因子限制。计算RMS重量备注3主链键精炼原子（A**2）：886；0.557 ; 1.500备注3主链键其他原子（A**2）：空；无效的；无效的备注3主链角精细原子（A**2）:1423；0.930 ; 2备注3其他原子的主链角（A**2）：空；无效的；无效的备注3侧链键精炼原子（A**2）：625；1.560 ; 3备注3侧链键其他原子（A**2）：空；无效的；无效的备注3精炼原子侧链角（A**2）：554；2.222 ; 4.500备注3其他原子的侧链角（A**2）：空；无效的；无效的备注3长程B精炼原子（A**2）：空；无效的；无效的备注3远程B其他原子（A**2）：空；无效的；无效的备注3备注3各向异性热因子约束。计算RMS重量备注3刚性约束（A**2）：空；无效的；无效的备注3球性；自由原子（A**2）：空；无效的；无效的备注3球性；结合原子（A**2）：空；无效的；无效的备注3备注3 NCS约束统计备注3不同NCS组的数量：空备注3备注3 TLS详细信息备注3 TLS组的数量：2备注3备注3 TLS组：1备注3组件组数量：1备注3组件C SSSEQI至C SSSEQ备注3剩余范围：B 247 B 372备注3组起源（A）：-12.7320-13.6270-0.3300备注3 T张力备注3 T11:-0.1653 T22:-0.1499备注3 T33:-0.1427 T12:-0.0110备注3 T13:0.0005 T23:-0.0006备注3 L张力备注3 L11:2.1438 L22:1.3746备注3 L33:3.6838 L12:0.1230备注3 L13:-0.1617 L23:-0.0659备注3s张量备注3 S11:-0.0089 S12:-0.0696 S13:-0.0801备注3 S21:0.0197 S22:-0.0223 S23:0.0817备注3 S31:-0.0681 S32:-0.1492 S33:0.0311备注3备注3 TLS组：2备注3组件组数量：1备注3组件C SSSEQI至C SSSEQ备注3剩余范围：A 5 A 15备注3组起源（A）：-18.9420-13.1230 18.0920备注3 T张力备注3 T11:0.0217 T22:-0.1212备注3 T33:-0.0200 T12:-0.0379备注3 T13:0.0143 T23:-0.0001备注3 L张力备注3 L11:42.6540 L22:12.0463备注3 L33:9.7081 L12:-8.4201备注3 L13:4.2478 L23:-2.4440备注3s张量备注3 S11:0.5851 S12:-0.5105 S13:-1.4844备注3 S21:0.8002 S22:-0.1831 S23:0.6299备注3 S31:-0.1433 S32:0.2189 S33:-0.4020备注3备注3本体溶剂建模。备注3使用的方法：面罩备注3遮罩计算参数备注3 VDW探头半径：1.40备注3离子探针半径：0.80备注3收缩半径：0.80备注3备注3其他炼油备注：骑行中添加了氢气记下3个位置。备注4备注4 VZG符合2011年7月13日第3.30版格式备注100备注100本条目已由PDBE于2008年8月1日处理。备注100存款ID为D_129037095。备注200备注200实验细节备注200实验类型：X射线衍射备注200数据收集日期：2007年8月2日备注200温度（开尔文）：100备注200 PH:4.5备注200使用的晶体数量：1备注200备注200同步器（是/否）：是备注200辐射源：钻石备注200梁线：I04备注200 X射线发生器型号：空备注200单色或LAUE（M/L）：M备注200波长或范围（A）：0.968备注200单色仪：DCM备注200光学：镜子备注200备注200探测器类型：CCD备注200探测器制造商：ADSC CCDREMARK 200强度集成软件：MOSFLM备注200数据缩放软件：SCALA备注200备注200独特反射次数：13920备注200分辨率范围高（A）：1.800备注200分辨率范围低（A）：27.710备注200拒绝标准（SIGMA（I））：2.000备注200总体评论200。备注200范围（%）的完整性：99.6备注200数据冗余：3.400备注200 R合并（I）:0.07000备注200 R SYM（I）：空备注200数据集：13.2000备注200在最高分辨率外壳中备注200。备注200最高分辨率外壳，范围高（A）：1.80备注200最高分辨率外壳，范围低（A）：1.90备注200壳体完整性（%）：100.0在外壳中备注200数据冗余：3.50备注200 R壳体合并（I）：0.35000壳体注释200 R SYM（I）：空备注200对于壳体：3.200备注200备注200衍射协议：单波长备注200用于确定结构的方法：分子替换备注200使用的软件：PHASER备注200启动型号：PDB ENTRY 2VZC备注200备注200备注：无备注280备注280晶体备注280溶剂含量VS（%）：43.00备注280马修斯系数，VM（角**3/DA）：2.20备注280备注280结晶条件：40%（W/V）PEG200，0.1 M柠檬酸盐PH值备注280 4.5，蒸汽扩散，静滴，温度286K备注290备注290晶体对称性备注290空间群的对称算子：C 2 2 21备注290注释290对称性备注290 NNNMMM操作员备注290 1555 X、Y、Z备注290 2555-X，-Y，Z+1/2备注290 3555-X、Y、-Z+1/2备注290 4555 X，-Y，-Z备注290 5555 X+1/2，Y+1/2，Z备注290 6555-X+1/2，-Y+1/2，Z+1/2备注290 7555-X+1/2，Y+1/2，-Z+1/2备注290 8555 X+1/2，-Y+1/2，-Z备注290备注290，其中NNN->操作员编号备注290 MMM->翻译向量备注290备注290晶体对称变换备注290以下变换作用于原子/混合体在本条目中备注290条记录，以制作结晶备注290个相关分子。备注290 SMTRY1 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 0.00000备注290 SMTRY2 1 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000备注290 SMTRY3 1 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000备注290 SMTRY1 2-1.00000000.000000 0.000000 0.00000备注290 SMTRY2 2 0.000000-1.000000.000000 0.00000备注290 SMTRY3 2 0.000000 0.000000 1.00000020.92050备注290 SMTRY1 3-1.00000000.000000 0.000000 0.00000备注290 SMTRY2 3 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000备注290 SMTRY3 3 0.000000 0.000000-1.000000 20.92050备注290 SMTRY14 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 0.00000备注290 SMTRY2 4 0.000000-1.000000.000000 0.00000备注290 SMTRY3 4 0.000000 0.000000-1.000000 0.00000备注290 SMTRY1 5 1.0000000.000000 0.000000 37.00400备注290 SMTRY2 5 0.000000 1.000000 0.000000 47.21100备注290 SMTRY3 5 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000备注290平方米1-10000000.000000 0.000000 37.00400备注290 SMTRY2 6 0.000000-1.000000.00000 47.21100备注290平方米3 6 0.000000 0.000000 1.000000 20.92050备注290 SMTRY1 7-1.00000000.000000 0.000000 37.00400备注290 SMTRY2 7 0.000000 1.000000 0.000000 47.21100备注290 SMTRY3 7 0.000000 0.000000-1.000000 20.92050备注290 SMTRY1 8 1.0000000.000000 0.000000 37.00400备注290 SMTRY2 8 0.000000-1.000000.00000 47.21100备注290 SMTRY3 8 0.000000 0.000000-1.000000 0.00000备注290备注290备注：空备注300备注300生物分子：1备注300有关作者提供的和/或程序，请参阅备注350备注300中生成的结构装配信息备注300此条目。备注还可能提供有关备注300埋地面积。备注350记下代表已知的完整乘数的350个坐标备注350生物意义上的齐聚状态备注350应用生物转化可以生成分子记住下面给出的350。非晶态和备注：给出了350个晶体分析操作。备注350备注350生物分子：1备注350作者确定的生物单位：DIMERIC备注350软件确定的四元结构：DIMERIC备注350使用的软件：PQS备注350总埋地面积：1170安**2备注复合体的350表面积：10400安**2备注350无溶剂能量变化：-11.2 KCAL/MOL备注350将以下内容应用于链条：A、B备注350生物1 1.0000000.000000 0.000000 0.00000 0.00000备注350 BIOMT2 1 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000备注350生物3 1 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000备注375备注375特殊位置备注375发现以下原子在0.15安以内与对称性有关的原子的注释375，并且被假设为在特殊原子上备注375个位置。备注375备注375原子RES CSSEQI请记住375 B2023是如何处于特殊位置的。备注465备注465缺失残留物备注465以下残留物不在备注465实验。（M=型号；RES=剩余名称；C=链条备注465标识符；SSSEQ=序列号；I=插入代码。）备注465备注465 M RES C SSSEQI备注465 GLN A 16备注465 HIS A 17备注465 ASN A 18备注465 PRO A 19备注465 PRO A 20备注465 SER B 242备注465 GLY B 243备注465 ARG B 244备注465 HIS B 245备注465 GLU B 246备注500评论500几何学和立体化学备注500子主题：同一非对称单元中的紧密接触备注500备注500以下原子紧密接触。备注500备注500 ATM1 RES C SSEQI ATM2 RES S C SSEQUI距离备注500 SG CYS B 352 O1 EDO B 1377 2.13备注500备注500备注：空备注500评论500几何学和立体化学备注500主题：扭转角备注500在预期的拉马钱德兰区域外标注500个扭转角：备注500（M=型号；RES=剩余名称；C=链标识符；备注500 SSEQ=序列号；I=插入代码）。备注500备注500标准表：备注500格式：（10X，I3,1X，A3,1X，A1，I4，A1,4X，F7.2,3X，F7.2）备注500备注500个预期值：GJ KLEYWEGT和TA JONES（1996）。PHI/PSI-记下500首合唱：拉马钱德朗重审。结构4，1395-1400备注500备注500 M RES CSSEQI PSI PHI备注500 ALA B 257 46.23-145.60备注500 LYS B 341 127.19-34.77备注500备注500备注：空备注800备注800站点备注800站点标识符：AC1备注800证据_代码：软件备注800场地_说明：残留物PG4 B 1373的结合场地备注800备注800站点标识符：AC2备注800证据_代码：软件备注800位置_描述：残留物PGE B 1374的粘合位置备注800备注800站点标识符：AC3备注800证据_代码：软件备注800场地_描述：残留物EDO B 1375的结合场地备注800备注800站点标识符：AC4备注800证据_代码：软件备注800场地_描述：残留物EDO B 1376的结合场地备注800备注800站点标识符：AC5备注800证据_代码：软件备注800场地_描述：残留物EDO B 1377的结合场地备注800备注800站点标识符：AC6备注800证据_代码：软件备注800场地_描述：残留物EDO B 1378的结合场地备注800备注800站点标识符：AC7备注800证据_代码：软件备注800场地_描述：残留物EDO B 1379的结合场地备注900备注900个相关条目备注900相关ID:2VZI相关DB:PDB重温900的C端钙调素同源畴的晶体结构用PAXILLIN LD4主题复述900α-精氨酸备注900相关ID:2VZD相关DB:PDB重温900的C端钙调素同源畴的晶体结构用PAXILLIN LD1主题复述900阿尔法帕文备注900相关ID:1KL0相关DB:PDBREMARK 900焦点粘着激酶脂肪结构域的理论模型备注900与PAXILLIN LD2主题复杂备注900相关ID:2VZC相关DB:PDB重温900的C端钙调素同源畴的晶体结构备注900阿尔法·帕文备注900相关ID:1KKY相关DB:PDBREMARK 900焦点粘着激酶脂肪结构域的理论模型备注900与PAXILLIN LD2主题复杂DBREF 2VZG A 1 20 UNP P49023巴基斯坦胡曼8 27DBREF 2VZG B 242 372 UNP Q9NVD7帕瓦胡曼242 373序列1 A 20 ASN LEU SER GLU LEU ASP ARG LEU LEU LEU GLU LEO ASN序列2 A 20 ALA VAL GLN HIS ASN PRO PRO序列1 B 131 SER GLY ARG HIS GLU ARG ASP ALA PHE ASP THR LEU PHE序列2 B 131 ASP HIS ALA PRO ASP LYS LEU ASN VAL LYS THR序列3 B 131 LEU ILE THR PHE VAL ASN LYS HIS LEU ASN LYS LEU ASN序列4 B 131 LEU GLU VAL THR GLU LEU GLU-THR GLN PHE ALA ASP GLY序列5 B 131 VAL TYR LEU VAL LEU LEU MET GLY LEU GLU GLY TYRSEQRES 6 B 131 PHE VAL亲LEU HIS SER PHE PHE LEU THR亲ASP SER序列7 B 131 PHE GLU GLN LYS VAL LEU ASN VAL SER PHE ALA PHE GLGSEQRES 8 B 131 LEU遇到GLN ASP GLY LEU GLU LYS PRO LYS PRO ARG序列9 B 131 PRO GLU ASP ILE VAL ASN CYS ASP LEU LYS SER THR LEU序列10 B 131 ARG VAL LEU TYR ASN LEU PHE THR LYS TYR ARG ASN VALSEQRES 11 B 131葡萄糖HET PG4 B1373 13号机组HET PGE B1374 10型HET EDO B1375 4号机组HET EDO B1376 4号机组HET EDO B1377 4号机组HET EDO B1378 4号机组HET EDO B1379 4号机组HETNAM PG4四乙二醇HETNAM PGE三乙烯二醇HETNAM EDO 1,2-乙二醇HETSYN EDO乙二醇配方3 PG4 C8 H18 O5配方4 PGE C6 H14 O4配方5 EDO 5（C2 H6 O2）配方10 HOH*65（H2 O）螺旋1 1 SER A 3 VAL A 15 1 13螺旋2 2 ASP B 248 ALA B 257 1 10螺旋3 3 LYS B 260 ASN B 277 1 18螺旋4 4 LYS B 278 ASN B 280 5 3螺旋5 5 GLY B 293 GLY B 305 1 13螺旋6 6 PRO B 309 PHE B 313 5 5螺旋7 7 SER B 319 GLY B 337 1 19螺旋8 8 ARG B 345 ASN B 351 1 7螺旋9 9 ASP B 353 ARG B 369 1 17站点1 AC1 6 ASN B 262 LYS B 265 ALA B 291 ASP B 318场地2 AC1 6 LYS B 323 VAL B 350场地1 AC2 2 TYR B 306 TYR B362站点1 AC3 2 ASP B 292 HOH B2056现场1 AC4 2 ASN B 280 HOH B2057场地1 AC5 7 LEU B 261 LYS B 265 GLU B 287 ASN B 351现场2 AC5 7 CYS B 352 LEU B 354 HOH B2036现场1 AC6 2 LEU B 325 GLU B 332地点1 AC7 3 LEU B 298 VAL B 308 HOH B2021晶体1 74.008 94.422 41.841 90.00 90.00 90.00C 2 21 8原始1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.00000ORIGX2 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000 0.00000ORIGX3 0.000000 0.000000 1.0000000.00000比例尺1 0.013512 0.000000 0.000000 0.000000 0.00000比例尺2 0.000000 0.010591 0.000000 0.00000比例尺3 0.000000 0.000000 0.023900 0.00000