总管氧化还原酶97年4月12日1AH3标题与托勒司他抑制剂复合的醛糖还原酶压缩机模具ID:1;化合物2分子:醛糖还原酶;压缩机3链条:A;压缩机4 EC:1.1.1.21源MOL_ID:1;来源2 ORGANISM_SCIENTIFIC:SUS SCROFA;来源3 ORGANISM_COMMON:猪;来源4 ORGANISM_TAXID:9823;来源5器官:眼睛;来源6组织:晶状体KEYWDS氧化还原酶、醛糖还原酶、抑制、糖尿病EXPDTA X射线衍射作者D.MORAS,A.PODJARNY修订版5 4月3日-24 1AH3 1备注修订版4 1月31日至24日1AH3 1备注链接修订版3 2009年2月24日1AH3 1版本修订版2 01-APR-03 1AH3 1 JRNL修订版1 1998年4月15日1AH3 0JRNL AUTH A.URZHUMTSEV、F.TETE-FAVIER、A.MITSCHLER、J.BARBANTON、P.BARTH、,JRNL授权2 L.URZHUMTSEVA,J.F.BIELLMANN,A.PODJARNY,D.MORASJRNL标题A从晶体结构推断的“特异性”口袋醛糖还原酶与JRNL TITL 3药物重要抑制剂JRNL TITL 4索比尼尔。JRNL参考结构V.5 601 1997JRNL参考ISSN 0969-2126JRNL电话:9195881JRNL内政部10.1016/S0969-2126(97)00216-5备注2备注2决议。2.30安氏硬度。备注3备注3精炼。备注3程序:X-PLOR 3.1备注3作者:布鲁格备注3备注3精炼中使用的数据。备注3分辨率范围高(安):2.30备注3分辨率范围低(安):6.00备注3数据截止(SIGMA(F)):2.000备注3数据截止高(ABS(F)):1000000.000备注3数据切断低(ABS(F)):0.0010备注3完成率(工作+测试)(%):91.0备注3反射次数:14456备注3备注3与精炼中使用的数据相匹配。备注3交叉验证方法:后验备注3自由R值测试集选择:随机备注3 R值(工作集):0.207备注3自由R值:0.290备注3自由R值测试集大小(%):10.000备注3自由R值测试集计数:空备注3自由R值的估计误差:空备注3在最高分辨率的箱子中备注3。备注3使用的箱子总数:8备注3箱子分辨率范围高(A):2.30备注3箱子分辨率范围低(A):2.40备注3箱子完整性(工作+测试)(%):66.00备注3箱子中的反射(工作装置):1192备注3 BIN R值(工作集):0.3270备注3无箱R值:0.4030备注3无箱R值测试集大小(%):6.00备注3无箱R值测试集计数:空备注3 BIN FREE R值估计误差:NULL备注3备注3炼油中使用的非氢原子数量。备注3蛋白质原子:2523备注3核酸原子:0备注3异质原子:72备注3溶剂原子:150备注3记下3 B值。威尔逊地块备注3(A**2):空备注3平均B值(总体,A**2):36.20备注3总体各向异性B值。备注3 B11(A**2):空备注3 B22(A**2):空备注3 B33(A**2):空备注3 B12(A**2):空备注3 B13(A**2):空备注3 B23(A**2):空备注3备注3估计坐标误差。备注3 LUZZATI地块ESD(A):空SIGMAA(A)的备注3 ESD:无效备注3低分辨率截止(A):空备注3备注3交叉验证估计坐标误差。备注3 C-V LUZZATI地块ESD(A):空备注3 C-V SIGMAA(A)的ESD:空备注3记下理想值的3个RMS偏差。备注3粘结长度(A):0.011备注3结合角(度):2.800备注3双向角(度):25.10备注3不正确的角度(度):1.170备注3备注3各向异性热模型:受限备注3备注3各向异性热因子限制。RMS SIGMA公司备注3主链键(A**2):为空;无效的备注3主链角(A**2):空;无效的备注3侧链键(A**2):空;无效的备注3侧链角(A**2):空;无效的备注3备注3 NCS模型:空备注3备注3 NCS约束。RMS SIGMA/重量备注3第1组位置(A):空;无效的备注3第1组B系数(A**2):空;无效的备注3备注3参数文件1:PARAM19X。赞成的意见备注3参数文件2:PARAM.NADP备注3参数文件3:PARAM11.WAT备注3参数文件4:PARAMTERM.PRO备注3参数文件5:空备注3拓扑文件1:TOPH19X。赞成的意见备注3拓扑文件2:拓扑。NADP公司备注3拓扑文件3:TOPH11.WAT备注3拓扑文件4:TOPOTERM.PRO备注3拓扑文件5:NULL备注3备注3其他精炼备注:2879.PAR,2879.TOP备注4备注4 1AH3符合格式V.3.30,2011年7月13日备注100备注100本条目已由BNL处理。备注100存款ID为D_1000170807。备注200备注200实验细节备注200实验类型:X射线衍射备注200数据收集日期:1994年7月备注200温度(开尔文):273备注200 PH:6.2备注200使用的晶体数量:1备注200备注200同步器(是/否):是备注200辐射源:LURE备注200梁线:DW32备注200 X射线发生器型号:空备注200单色或LAUE(M/L):M备注200波长或范围(A):0.91备注200单色仪:空备注200光学器件:空备注200备注200探测器类型:图像板备注200探测器制造商:MARREACH备注200强度集成软件:XDS备注200数据缩放软件:MARSCALE备注200备注200独特反射次数:15449备注200分辨率范围高(A):2.300备注200分辨率范围低(A):15.000备注200拒绝标准(SIGMA(I)):3.000备注200总体评论200。备注200范围(%)的完整性:92.0备注200数据冗余:5.000备注200合并(I):空备注200 R SYM(I):0.04500备注200对于数据集:42.5000备注200在最高分辨率外壳中备注200。备注200最高分辨率外壳,范围高(A):2.30备注200最高分辨率外壳,范围低(A):2.40备注200外壳的完整性(%):66.0在外壳中备注200数据冗余:2.10备注200 R壳体合并(I):空壳体(I)备注200 R SYM:0.16900备注200对于壳体:8.700备注200备注200衍射协议:空备注200用于确定结构的方法:分子替换备注200使用的软件:X-PLOR 3.1备注200启动型号:1AH4备注200备注200备注:空备注280备注280晶体备注280溶剂含量VS(%):51.00备注280马修斯系数,VM(角度**3/DA):2.60备注280备注280结晶条件:6 MG/ML AR,2.5%PEG 6000,25 MM MESPH备注280 6.2(滴落),20%PEG 6000,25 MM MESPH 6.2(水库)备注290备注290晶体对称性备注290空间群的对称算子:P 43 21 2备注290备注290对称性备注290 NNNMMM操作员备注290 1555 X、Y、Z备注290 2555-X,-Y,Z+1/2备注290 3555-Y+1/2、X+1/2、Z+3/4备注290 4555 Y+1/2,-X+1/2,Z+1/4备注290 5555-X+1/2,Y+1/2,-Z+3/4备注290 6555 X+1/2,-Y+1/2,-Z+1/4备注290 7555 Y、X、-Z备注290 8555-Y、-X、-Z+1/2备注290备注290,其中NNN->操作员编号备注290 MMM->翻译向量备注290备注290晶体对称变换备注290以下变换作用于原子/混合体在本条目中备注290条记录,以制作结晶备注290个相关分子。备注290 SMTRY1 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 0.00000备注290 SMTRY2 1 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000备注290 SMTRY3 1 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000备注290 SMTRY1 2-1.00000000.000000 0.000000 0.00000备注290 SMTRY2 2 0.000000-1.000000.000000 0.00000备注290 SMTRY3 2 0.000000 0.000000 1.000000 76.78000备注290 SMTRY1 3 0.000000-1.000000.000000 34.21000备注290 SMTRY2 3 1.0000000.000000 0.000000 34.21000备注290 SMTRY3 3 0.000000 0.000000 1.000000 115.17000备注290 SMTRY1 4 0.000000 1.0000000.000000 34.21000备注290 SMTRY2 4-1.00000000.000000 0.000000 34.21000备注290 SMTRY3 4 0.000000 0.000000 1.00000038.39000备注290 SMTRY1 5-1.00000000.000000 0.000000 34.21000备注290 SMTRY2 5 0.000000 1.000000 0.000000 34.21000备注290 SMTRY3 5 0.000000 0.000000-1.00000 115.17000备注290 SMTRY1 6 1.0000000.000000 0.000000 34.21000备注290 SMTRY2 6 0.000000-1.000000.000000 34.21000备注290平方米3 6 0.000000 0.000000-1.000000 38.39000备注290 SMTRY1 7 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000 0.00000备注290 SMTRY2 7 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.00000备注290 SMTRY3 7 0.000000 0.000000-1.000000 0.00000备注290 SMTRY1 8 0.000000-1.000000.000000 0.00000备注290 SMTRY2 8-1.0000000 0.000000 0.000000 0.00000备注290 SMTRY3 8 0.000000 0.000000-1.000000 76.78000备注290备注290备注:空备注300备注300生物分子:1备注300有关作者提供的和/或程序,请参阅备注350备注300中生成的结构装配信息备注300此条目。备注还可能提供有关备注300埋地面积。备注350注释350表示已知的完整多聚体的坐标备注350生物意义上的齐聚状态备注350应用生物转化可以生成分子记住下面给出的350。非晶态和备注:给出了350个晶体分析操作。备注350备注350生物分子:1备注350作者确定的生物单位:单体备注350将以下内容应用于链条:A备注350生物1 1.0000000.000000 0.000000 0.00000 0.00000备注350 BIOMT2 1 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000备注350生物3 1 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000备注500评论500几何学和立体化学备注500子主题:同等保函长度备注500备注500以下残留物的立体化学参数备注500的值与预期值相差更多备注500大于6*RMSD(M=型号;RES=剩余名称;C=链条备注500标识符;SSEQ=序列号;I=插入代码)。备注500备注500标准表:备注500格式:(10X,I3,1X,2(A3,1X,A1,I4,A1,1X,A4,3X),1X,F6.3)备注500备注500预期值蛋白质:ENGH和HUBER,1999备注500预期值核酸:CLOWNEY等人,1996年备注500备注500米RES CSSEQI ATM1 RES CSEQI ATM2偏差备注500 HIS A 3 NE2 HIS A 3CD2-0.069备注500 HIS A 41 NE2 HIS A 41CD2-0.069备注500 HIS A 46 NE2 HIS A 46CD2-0.068备注500 HIS A 83 NE2 HIS A 83CD2-0.070备注500 HIS A 110 NE2 HIS A 110CD2-0.072备注500 HIS A 163 NE2 HIS A 167 CD2-0.072备注500 HIS A 187 NE2 HIS A 87 CD2-0.071备注500他的A 306 NE2他的A 306 CD2-0.073备注500 HIS A 312 NE2 HIS A 322 CD2-0.069备注500备注500备注:空备注500评论500几何学和立体化学备注500子主题:等效结合角备注500备注500以下残留物的立体化学参数备注500的值与预期值相差更多备注500大于6*RMSD(M=型号;RES=剩余名称;C=链条备注500标识符;SSEQ=序列号;I=插入代码)。备注500备注500标准表:备注500格式:(10X,I3,1X,A3,1X,A1,I4,A1,3(1X,A4,2X),12X,F5.1)备注500备注500预期值蛋白质:ENGH和HUBER,1999备注500预期值核酸:CLOWNEY等人,1996年备注500备注500米分辨率CSSEQI ATM1 ATM2 ATM3备注500 TRP A 79 CD1-CG-CD2角度。偏差=6.8度备注500 TRP A 79 CE2-CD2-CG角度。偏差=-6.4度备注500 TRP A 79 CG-CD2-CE3 ANGL。偏差=5.6度备注500 TRP A 111 CD1-CG-CD2角度。偏差=5.4度备注500 TRP A 111 CE2-CD2-CG角度。偏差=-5.7度备注500 TRP A 141 CD1-CG-CD2角度。偏差=6.4度备注500 TRP A 141 CE2-CD2-CG角度。偏差=-5.7度备注500 TRP A 219 CD1-CG-CD2 ANGL。偏差=6.2度备注500 TRP A 219 CE2-CD2-CG ANGL。偏差=-5.7度备注500 ARG A 296 NE-CZ-NH1 ANGL。偏差=4.1度备注500 ARG A 296 NE-CZ-NH2 ANGL。偏差=-3.4度备注500备注500备注:空备注500评论500几何学和立体化学备注500主题:扭转角备注500在预期的拉马钱德兰区域外标注500个扭转角:备注500(M=型号;RES=剩余名称;C=链标识符;备注500 SSEQ=序列号;I=插入代码)。备注500备注500标准表:备注500格式:(10X,I3,1X,A3,1X,A1,I4,A1,4X,F7.2,3X,F7.2)备注500备注500个预期值:GJ KLEYWEGT和TA JONES(1996)。φ/磅/平方英寸-记下500首合唱:拉马钱德朗重温。结构4,1395-1400备注500备注500 M RES CSSEQI PSI PHI备注500 SER A 2-36.59-130.31备注500 LYS A 21-0.81 71.15备注500 ASP A 133-168.39-126.91备注500 GLU A 134 57.38-99.40备注500 LEU A 190 82.12-161.67备注500 GLN A 192 19.21 55.06备注500 ALA A 220 94.83-67.84备注500 GLU A 223 57.37-113.65备注500 PHE A 276 36.94-81.67备注500 ASP A 277 12.89-140.06备注500 ASN A 292 107.74-53.03备注500 CYS A 298 76.39-109.04备注500备注500备注:空备注615备注615零占用原子备注615以下残留物的原子模型为零备注615占用。这些原子的位置和性质备注615可能不可靠。(M=型号;RES=剩余名称;备注615 C=链标识符;SSEQ=序列号;I=插入代码):备注615 M RES C SSEQI备注615 HOH A 587备注800备注800站点备注800站点标识符:AC1备注800证据_代码:软件备注800场地_描述:残NAP A 318的结合场地备注800备注800站点标识符:AC2备注800证据_代码:软件备注800场地_描述:剩余TOL A 320的结合场地DBREF 1AH3 A 2 315取消P80276 ALDR_PIG 2 315序列1 A 315 AYA SER HIS LEU VAL LEU TYR THR GLY ALA LYS MET PRO序列2 A 315 ILE LEU GLY LEU GLY-THR TRP LYS SER PRO GLY LYS序列3 A 315 VAL THR GLU ALA VAL LYS VAL ALA ILE ASP LEU GLY TYR序列4 A 315 ARG HIS ILE ASP CYS ALA HIS VAL TYR GLN ASN GLU ASN序列5 A 315 GLU VAL GLY LEU GLY LEY GLN GLU LYS LEU GLN GLY GLN序列6 A 315 VAL VAL LYS ARG GLU ASP LEU PHEILE VAL SER LYS LEU序列7 A 315 TRP CYS THR ASP HIS GLU LYS ASN LEU VAL LYS GLY ALA序列8 A 315 CYS GLN THR LEU ARG ASP LEU LYS LEU ASP TYR LEU序列9 A 315 ASP LEU TYR LEU ILE HIS TRP PRO THR GLY PHE LYS PRO序列10 A 315 GLY LYS ASP PRO PHE PRO LEU ASP GLY ASP GLY ASN VAL序列11 A 315 VAL PRO ASP GLU SER ASP PHE VAL GLU THR TRP GLU ALA序列12 A 315 MET GLU GLU LEU VAL ASP GLU GLY LEU VAL-LYS ALA ILE序列13 A 315 GLY VAL SER ASN PHE ASN HIS LEU GLN VAL GLU LYS ILE序列14 A 315 LEU ASN LYS PRO GLY LEU LYS TYR LYS PRO ALA VAL ASNSEQRES 15 A 315 GLN ILE GLU VAL他的亲TYR LEU THR GLN GLU LYS LEU序列16 A 315 ILE GLU TYR CYS LYS SER LYS GLY ILE VAL THR ALA序列17 A 315轮胎专业SER LEU GLY SER PRO ASP ARG专业TRP ALA LYS序列18 A 315 PRO GLU ASP PRO SER LEU LEU GLU ASP-PRO ARG ILE LYS序列19 A 315 ALA ILE ALA ALA LYS TYR ASN LYS THR ALA GLN VAL序列20 A 315 LEU ILE ARG PHE PRO MET GLN ARG ASN LEU ILE VAL ILE序列21 A 315 PRO LYS SER VAL THR PRO GLU ARG ILE ALA GLU ASN PHE序列22 A 315 GLN VAL PHE ASP PHE GLU LEU SER PRO GLU ASP MET ASN序列23 A 315 THR LEU LEU SER TYR ASN ARG ASN TRP ARG VAL CYS ALA序列24 A 315 LEU遇见SER CYS ALA SER HIS LYS ASP TYR PRO PHE HIS序列25 A 315 GLU GLU轮胎MODRES 1AH3 AYA A 1丙氨酸N-乙酰丙氨酸HET AYA A 19号机组HET NAP A 318 55号HET工具A 320 24HETNAM AYA N-乙酰丙氨酸HETNAM NADP烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸盐HETNAM TOL TOLRESTAT公司海森NAP 2'-单磷酸腺苷5'-二磷酸核糖配方1 AYA C5 H9 N O3配方2 NAP C21 H28 N7 O17 P3甲醛3醇C16 H14 F3 N O3 S配方4 HOH*150(H2 O)螺旋1 1 PRO A 24 LEU A 37 1 14螺旋2 2 HIS A 46 TYR A 48 5 3螺旋3 3 GLU A 51 GLN A 63 1 13螺旋4 4 ARG A 69 ASP A 71 5 3螺旋5 5 CYS A 80 ASP A 82 5 3螺旋6 6 LYS A 85 LEU A 99 5 15螺旋7 7 PHE A 137 ASP A 149 1 13螺旋8 8 HIS A 163 LEU A 170 1 8螺旋9 9 GLU A 193 LYS A 202 1 10螺旋10 10 PRO A 231 TYR A 240 1 10螺旋11 11 THR A 244 GLN A 254 1 11螺旋12 12 PRO A 266 PHE A 273 1 8螺旋13 13 PRO A 282 TYR A 291 1 10螺旋14 14满足A 301 CYS A 303 5 3螺旋15 15 PRO A 310 HIS A 312 5 3表1 A 2 HIS A 3 VAL A 5 0表2 A 2 LYS A 11 PRO A 13-1 N MET A 12 O LEU A 4表1 B 4 HIS A 41 ASP A 43 0表2 B 4 PHE A 73 LEU A 78 1 N PHE A 73O ILE A 42表3 B 4 LEU A 106 ILE A 109 1 N LEU A 106O SER A 76表4 B 4 ILE A 156 VAL A 158 1 N GLY A 157 O TYR A 107表1 C 2 VAL A 181 GLU A 1850表2 C 2 VAL A 205 TYR A 209 1 N VAL A 202 O ASN A 182链路C AYA A 1 N SER A 2 1555 1555 1.33站点1 AC1 34 GLY A 18 THR A 19 TRP A 20 LYS A 21站点2 AC1 34 ASP A 43 TYR A 48 HIS A 110 TRP A 111站点3 AC1 34 SER A 159 ASN A 160 GLN A 183 TYR A 209站点4 AC1 34 SER A 210 PRO A 211 LEU A 212 GLY A 213站点5 AC1 34 SER A 214 PRO A 215 ASP A 216 LEU A 228站点6 AC1 34 ALA 245 ILE A 260 PRO A 261 LYS A 262站点7 AC1 34 SER A 263 VAL A 264 THR A 265 ARG A 268站点8 AC1 34 GLU A 271 ASN A 272 TOL A 320 HOH A 483站点9 AC1 34 HOH A 586 HOH A 626站点1 AC2 14 TRP A 20 TYR A 48 TRP A 79 HIS A 110站点2 AC2 14 TRP A 111 THR A 113 PHE A 115 PHE A 122站点3 AC2 14 VAL A 130 TRP A 219 LEU A 300 SER A 302站点4 AC2 14 CYS A 303小睡A 318晶体1 68.420 68.420 153.560 90.00 90.00 90.00P 43 21 2 8原始1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.00000ORIGX2 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000 0.00000ORIGX3 0.000000 0.000000 1.0000000.00000比例尺1 0.014616 0.000000 0.000000 0.00000比例尺2 0.000000 0.014616 0.000000 0.00000比例尺3 0.000000 0.000000 0.006512 0.00000赫塔姆1 N AYA A 1 45.002 34.062 107.942 1.00 77.73 N加利福尼亚州赫塔姆2 AYA A 1 44.310 32.796 108.026 1.00 76.58 C赫塔姆3 CB AYA A 1 43.007 32.944 108.797 1.00 77.71 C赫塔姆4 C AYA A 1 43.993 32.353 106.614 1.00 74.78 C赫塔姆5 O AYA A 1 44.296 31.228 106.214 1.00 76.88 O赫塔姆6 CT AYA A 1 45.995 34.266 108.792 1.00 83.32 C赫塔姆7 OT AYA A 1 47.067 33.709 108.568 1.00 85.35 O赫塔姆8 CM AYA A 1 45.910 35.617 109.485 1.00 75.49 C赫塔姆9 H AYA A 1 45.235 34.356 107.040 1.00 20.00 H