血浆载脂蛋白A1（apoA1）和B（apoB）水平升高分别是动脉粥样硬化和冠心病的重要保护因素和危险因素。众所周知，apoA1和apoB都显示出很强的家族聚集性。我们的目标是调查外生变量是否影响这些关联。我们使用平均值和关联结构的边际回归模型（广义估计方程2；GEE2）来分析Donolo-Tel Aviv三代后代研究中469个不同规模家庭中1435名家庭成员的数据。通常的稳健方差矩阵是通过将方差的折刀估计推广到GEE2模型来近似的。使用这种方法，可以在具有非常复杂的相关结构的模型中估计标准误差。使用菜单驱动的独立软件工具进行边际回归建模，可以轻松进行所有分析。我们证明，通过为关联结构建模回归矩阵，可以使用Wald统计检验各种假设。我们发现，父母与孩子之间的apoB相关性随着年龄差异的减小而增加，并且同一性别的个体与不同性别的个体相比，其apoA1水平更相似。不同亲属对之间的联系并不完全符合亲属系数差异的预期。使用GEE2模型进行的分析揭示了其他模型无法检测到的结构，因此除了传统的家庭数据分析方法外，还应使用这些结构。GEE2应被视为调查家族聚集性的标准方法。[发表于：《医学统计》第19期第24期，3345-3357]