大卫·J·沃恩。,露丝·E·贝克。,&马修·辛普森。(2016)生化反应网络的计算效率推理方法。在第十届欧洲数学与理论生物学会议和SMB年会(ECMTB/SMB2016), 2016-07-11 - 2016-07-15. (未发布)
当某些化学物种的小种群相关时,或当系统动力学严重依赖于噪声的存在时,用于模拟生化反应网络的随机方法通常比确定性方法更真实地描述生物过程。由于解析解的难解性,分析模型行为通常需要计算昂贵的数值方法。当考虑反应速率参数的统计推断时,计算要求大大复杂化。这个计算瓶颈严重限制了可以推断的未知反应速率的数量。我们研究了用于参数推断问题的新技术,目的是在不影响参数估计准确性的情况下最小化计算开销。我们使用与系统生物学中各种应用相关的各种离散状态、连续时间马尔可夫模型来演示我们的方法。
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