生化反应网络的计算效率推理方法

,露丝·E·贝克。,&(2016)生化反应网络的计算效率推理方法。第十届欧洲数学与理论生物学会议和SMB年会(ECMTB/SMB2016), 2016-07-11 - 2016-07-15. (未发布)

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描述

当某些化学物种的小种群相关时,或当系统动力学严重依赖于噪声的存在时,用于模拟生化反应网络的随机方法通常比确定性方法更真实地描述生物过程。由于解析解的难解性,分析模型行为通常需要计算昂贵的数值方法。当考虑反应速率参数的统计推断时,计算要求大大复杂化。这个计算瓶颈严重限制了可以推断的未知反应速率的数量。我们研究了用于参数推断问题的新技术,目的是在不影响参数估计准确性的情况下最小化计算开销。我们使用与系统生物学中各种应用相关的各种离散状态、连续时间马尔可夫模型来演示我们的方法。

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ID代码: 111773
项目类型: 对会议的贡献(论文/演讲)
推荐人:
ORCID标识:
大卫·J·沃恩。orcid.org/0000-0002-9225-175X
马修·辛普森。orcid.org/0000-0001-6254-313X
纯ID: 57303771
部门: 过去>研究所>健康与生物医学创新研究所
过去>昆士兰理工学院
当前>学校>数学科学学院
过去>昆士兰理工学院和部门>技术、信息和图书馆服务部门
当前>研究中心>澳大利亚航空航天自动化研究中心
当前>研究中心>高性能计算和研究支持
版权所有人: 版权2016[请咨询作者]
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存款日期: 2017年9月26日23:03
上次修改时间: 2024年3月3日07:47