Automated tracing of electron-density maps of proteins

Oldfield, T.J.

doi:10.1107/S0907444902023570

蛋白质电子密度图的自动追踪

T.J.奥尔德菲尔德

蛋白质晶体学领域中实验电子图谱的追踪不是结构解释的速率限制步骤，但确实代表了需要最专业知识和用户时间的过程。本文提出了一种自动追踪蛋白质电子密度图的方法，该方法可以可靠地生成C^α蛋白质图谱的追踪，数据分辨率在1.5–4º之间。C的数量^α放置的原子和原子放置的精度取决于地图的质量，但即使地图质量较差（FOM≃0.5），与传统的解释方法相比，该算法也可以显著节省时间。以不同的分辨率和相位误差水平对六幅实验图进行了解释；这些数据表明，FOM为0.7或更高的数据可以在无需用户干预的情况下完全跟踪。

关键词：电子密度图;自动跟踪.

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