Domain closure and action of uracil DNA glycosylase (UDG): structures of new crystal forms containing the Escherichia coli enzyme and a comparative study of the known structures involving UDG

Bidya Sagar, M.; Handa, P.; Purnapatre, K.; Ravishankar, R.; Roy, S.; Saikrishnan, K.; Varshney, U.; Vijayan, M.

doi:10.1107/S0907444902009599

尿嘧啶DNA糖基化酶（UDG）的结构域闭合和作用：含有大肠杆菌酶和UDG已知结构的比较研究

K.赛克里希南,M.Bidya Sagar先生,R.拉维桑卡,S.罗伊,K.Purnapatre公司,P.汉达,U.瓦什尼和M.维贾扬

一种新的自由晶型的结构大肠杆菌测定了不对称单元中含有四个分子的尿嘧啶DNA糖基化酶（UDG）及其与蛋白抑制剂Ugi的两种形式的复合物，包括两种和四种晶体独立的复合物。对这些结构和含有UDG的已知晶体结构的比较表明，酶可以被视为由两个独立移动的结构实体或结构域组成。对游离和DNA结合人类酶的详细研究加强了这一结论。这些结构域在与含尿嘧啶的DNA结合时闭合，而在与Ugi结合时似乎不会闭合。比较研究还表明，分子的迁移性涉及域内柔性叠加的域的刚体运动。

关键词：尿嘧啶DNA糖基化酶.

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PDB参考：UDG、1lqj、r1lqjsf;UDG–Ugi，形式I，1lqg，r1lqgsf;UDG–Ugi，形式II，1lqm，r1lqmsf

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