我们描述了迭代骨架化（PRISM）相位细化的进一步发展，PRISM是最近引入的一种相位细化策略[Wilson&Agard（1993）]。《水晶学报》。A类49, 97-104]它利用蛋白质由相连的线性原子链组成的信息。初始电子密度图是由部分结构或同晶置换产生的不准确相产生的。然后，使用修改后的Greer算法从地图中构建线性连接骨架[Greer（1985）]。方法酶制剂。 115，206-226]，并从骨架创建新地图。将这个“骨架化”映射进行傅里叶变换，得到新的相位，这些相位与任何起始相位信息和实验结构因子振幅相结合，生成新的映射。迭代该过程，直到达到收敛。本文描述了对该方法的重大改进，因为这是一个具有挑战性的分子置换测试案例，其中初始相是根据仅包含完整蛋白质三分之一原子的模型计算的。应用骨架化程序可以生成易于解释的地图。相反，溶剂压平的应用并没有显著改善起始图。迭代骨架化过程在存在随机噪声和缺失数据的情况下表现良好，但要求傅里叶数据至少达到3.0º。事实证明，线性和连通性的约束足够强大，不仅可以恢复丢失的相位信息，还可以恢复缺失的振幅。这使得可以使用强大的统计测试，类似于“free”R（右）传统精炼的因素[Brünger（1992）]。自然(伦敦),355，472-474]，用于优化骨架化过程的性能。在随附的论文中，我们描述了该方法在求解与胰蛋白酶结合的蛋白酶抑制剂ecotin的结构和单个同晶替换问题中的应用。
