{“@context”:“https:\/\/schema.org\/”,“@type”:“ScholarlyArticle”,“@id”:“#article14124”,“name”:“Linked-Reads的图形理论条形码排序模型”,“抽象”:“考虑实线上的一组间隔,间隔图将这些间隔记录为节点,其交点记录为边。识别(即合并)区间图中的节点对产生多区间图。在不知道底层间隔的情况下,只给出了多间隔图的节点和边,我们对以下问题感兴趣。可以确定每个节点对应的间隔数吗?可以计算反映原始区间顺序的多个区间图节点上的遍历吗?这些问题与链接读取DNA测序密切相关,其中条形码被分配给长分子,其交集图形成区间图。每个条形码可以对应于多个分子,这使下游分析复杂化,并且对应于对应区间图的节点的识别。通过实现条形码到分子的概念性分离,并通过分子顺序提供准确组装基因组的骨架,解决上述图形理论问题将有助于分析链接读码测序数据。在这里,我们提出了一个框架,该框架将任意交集图(例如条形码重叠图)作为输入,并构造原始区间顺序的启发式近似。“,”keywords“:[”DNA测序“,”graph algorithms“,”linked-reads“,”interval graph“,”cliques“],”author“:[{”@type“:”Person“,”name“:”Dufresne,Yoan“,”givenName“:”Yoann“,”familyName“:“Dufresen”,”email“:”mailto:“yoann.dufresne@pastur.fr“,”sameAs“:”https:\/\/orcid.org\/00000-0002-0930-8920“,”affiliation“:”计算生物学系,C3BI USR 3756 CNRS,Institute 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