统计学及其接口
第10卷（2017年）
数字4
多种生物条件下基因表达阈值的检测
页：643 – 655
内政部：https://dx.doi.org/10.4310/SII.2017.v10.n4.a9
作者
邓殿良（加拿大萨斯喀彻温省里贾纳大学数学与统计系）
洪斌芳（美国哥伦比亚特区华盛顿乔治敦大学医学中心生物统计学系）
Kian Razeghi Jahromi（加拿大萨斯喀彻温省里贾纳大学数学与统计系）
宋九洲（美国马里兰州帕克学院马里兰大学动物与鸟类科学系）
Ming Tan（美国哥伦比亚特区华盛顿乔治敦大学医学中心生物统计学系）
摘要
时间基因表达数据在基因功能分类中具有重要意义，并广泛用于生物医学研究，如癌症诊断。然而，由于时间基因表达随时间而变化，在初始时间段之后，许多基因表现出某种稳定性，这意味着在这些时间点之后，基因表达保持不变或略有波动。因此，该阈值是研究基因表达行为的关键，可用于确定测量时间段和区分基因表达。本文提出了三种检测基因表达阈值的方法。特别是，一阶和二阶变化率用于构建检测阈值点的测试统计量。仿真研究表明，该方法对阈值点的检测具有良好的性能。使用一个包含21个铜绿假单胞菌基因在24种生物条件下表达的真实数据集来说明所提出的方法。
关键词
相对变化率、时间基因表达、经验分布、高维数据、阈值
2010年数学学科分类
初级62G20、62H15。次要62P10。
2017年5月30日出版
