Critical transitions in a model of a genetic regulatory system

Jesse Berwald; Marian Gidea; Jesse Berwald; Marian Gidea

doi:10.3934/mbe.2014.11.723

数学生物科学与工程

2014,第11卷, 第4版: 723-740. 数字对象标识：10.3934/mbe.2014.11.723

遗传调控系统模型中的临界转变

1
明尼苏达州明尼阿波利斯数学及其应用研究所55455
2
耶什瓦大学数学科学系，纽约州纽约市，邮编：10016

收到：2013年1月1日 认可的：2018年6月29日 出版：2014年3月1日
MSC公司：一次：92D10、34C23、55N99；次要：34F05、57M99。

我们考虑了遗传系统中基于随机微分方程和缓慢演化的外部信号的子状态完全振荡模型。我们证明了系统中存在临界跃迁。我们采用两种方法对系统生成的合成时间序列进行了数值测试，以确定关键转变的早期指标：一种是去趋势波动分析方法，另一种是基于拓扑数据分析的新方法（持久性图）。
- 临界转变,
- 持久性图表。,
- 基因调控网络,
- 随机微分方程
引用：杰西·贝尔瓦尔德，玛丽安·吉迪亚。遗传调控系统模型中的临界转变[J]。数学生物科学与工程，2014，11（4）：723-740。doi:10.3934/mbe.2014.11.723

相关论文：

摘要

我们考虑了遗传系统中基于随机微分方程和缓慢演化的外部信号的子状态完全振荡模型。我们证明了系统中存在临界跃迁。我们采用两种方法对系统生成的合成时间序列进行了数值测试，以确定关键转变的早期指标：一种是去趋势波动分析方法，另一种是基于拓扑数据分析的新方法（持久性图）。

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