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得到许可的 未获得许可 需要身份验证 发布人:德古意特出版社 2004年10月31日

MergeMaid:R用于基因表达数据合并和交叉研究验证的工具

  • 莱斯利·科普 , 钟晓刚 , 加勒特 乔瓦尼·帕尔米吉亚尼

基因表达调查的交叉研究验证在基因组分析中至关重要。我们开发了一个R包和相关的对象定义来合并和可视化多个基因表达数据集。我们的合并函数使用任意字符ID并生成可以有效支持各种联合分析的对象。可视化工具支持数据的探索和交叉研究验证,而无需跨平台标准化。工具包括“综合相关性”图,即一项研究中所有成对相关性与另一项研究相应成对相关性的散点图,包括单个基因和所有组合基因。基因特异性图可用于识别其变化在研究中得到可靠测量的基因。可视化还包括使用线性、逻辑和Cox回归量化表达和感兴趣表型之间关系的基因特异性统计散点图。

在线发布:2004-10-31

©2011 Walter de Gruyter GmbH&Co.KG,柏林/波士顿

2024年6月5日从下载https://www.degruyter.com/document/doi/10.2202/1544-6115.1046/html
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