本文提出了一种从基因表达模式的观测时间序列数据推断大规模遗传网络S系统模型的新方法。该方法采用一种技术将遗传网络推理问题分解为多个子问题。通过求解这些分解的子问题来估计S系统参数。此外，该方法估计了基因表达的初始水平。当给定噪声时间序列数据时，需要估计初始基因表达水平。通过遗传网络推理问题验证了该方法的有效性。