基因型与环境相互作用主成分分析的重抽样检验

作者

  • 约翰内斯·福克曼 瑞典农业科学大学作物生产生态学系,信箱7043,750 07乌普萨拉

内政部:

https://doi.org/10.12697/ACUTM.2015.19.03

关键词:

降维、主成分分析、重采样方法、奇异值分解

摘要

在作物科学中,经常使用“基因型主效应和基因型环境相互作用效应”(GGE)模型来研究基因型与环境的相互作用。利用该模型,对具有主要环境影响的线性模型拟合的残差矩阵进行奇异值分解。假设误差是独立的、正态分布的和同方差的,则可以使用重采样方法测试GGE模型乘法项的重要性。GGE方法与主成分分析(PCA)密切相关。本文件描述了)GGE模型,)用于测试乘性基因型-环境相互作用项的简单参数bootstrap方法,以及)如何使用这种重采样方法测试主成分。

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出版

2015-06-09

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