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酮合酶(KSs)通过两步乒乓反应机制催化脂肪酸生物合成中的必需碳-碳键形成反应。大肠杆菌,有两个具有重叠底物选择性的同二聚体伸长KSs,FabB和FabF。然而,FabB对于在缺乏外源性UFA的情况下细胞生存所需的不饱和脂肪酸(UFA)的生物合成至关重要。此外,FabB对长于12个C原子的底物的活性降低,而FabF有效地催化饱和C14和不饱和C16:1酰基-酰基载体蛋白(ACP)复合物的延伸。在本研究中,解决了FabB与ACPs配合物中的两种交联晶体结构,ACPs与近似催化步骤的长链脂肪酸交联探针进行了官能化。两种同二聚体结构都具有不对称的底物结合囊,这表明当与C14和C16酰基链结合时,两种FabB单体之间存在合作关系。此外,这些结构捕获了一种不寻常的活性位点门控残基旋转异构体Phe392,它可能代表底物释放前的催化状态。这些结构证明了基于机械的交联方法在捕获和阐明KS介导的近原子分辨率催化伴随的构象跃迁方面的实用性。

支持信息

pdf格式

可移植文档格式(PDF)文件https://doi.org/10.1107/S2059798322007434/jb5047sup1.pdf
补充图和交联探针的合成。

英里4

运动图像专家组(MP4)视频文件https://doi.org/10.107/S2059798322007434/jb5047sup2.mp4
补充电影S1。

PDB参考:FabB与C14-ACP交联,7sqi;FabB与C16:1-ACP交联,7sz9


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