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ERG3(ETS-related gene,ETS相关基因)是ETS(红细胞转化特异性)转录因子家族的成员,其中包含高度保守的DNA结合域。ETS家族转录因子与启动子DNA序列的结合不同,其DNA序列识别机制尚不清楚。在当前的研究中,ETSi结构域(ERG3的ETS结构域包含CID基序)在空间群中的晶体P(P)41212及其与E74 DNA序列(DNA9)在空间组中C类2221得到了它们的结构。ETSi结构域及其与DNA复合物的比较结构分析9空间群中ERGi结构域(包含抑制基序的ERG的ETS结构域)的预先确定结构P(P)65212和ERGi–DNA12空间群中的复数P(P)4121进行了2次。ETSi结构域在溶液中以及在晶体不对称单元中被观察到为同二聚体。ETSi结构域的结构与ERGi结构域结构的重叠显示出C末端DNA-结合自抑制(CID)基序的主要构象变化,而ETSi域结构的环区则出现了微小变化。ETSi–DNA9空间群中的复数C类2221形成与ERG–DNA结构非常相似的结构12空间群中的复数P(P)41212.复合物叠加后,在DNA的5′端和3′端观察到主要构象变化9而核心GGA核苷酸的构象非常保守。ETSi–DNA的比较9ETS 1类蛋白-DNA复合物的结构与已知结构显示了1类ETS蛋白在启动子-DNA结合和特异性方面的相似性和差异性。

支持信息

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可移植文档格式(PDF)文件https://doi.org/10.1107/S20533230X1801110X/or5009sup1.pdf
补充表格和图表。

PDB参考:原生ETSi域,5ybc;ETSi–DNA9复杂,5ybd


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