Supra­molecular inter­actions in carboxyl­ate and sulfonate salts of 2,6-di­amino-4-chloro­pyrimidinium

Mohana, M.; Thomas Muthiah, P.; Butcher, R.J.

doi:10.1107/S2053229617008798

2,6-二氨基-4-氯嘧啶羧酸盐和磺酸盐的超分子相互作用

莫哈纳（M.Mohana），托马斯·穆提亚和R.J.布彻

两种新盐，即2,6-二氨基-4-氯嘧啶-2-羧氧基-3-硝基苯甲酸盐，C₄H（H）₆氯离子₄⁺·C类₈H（H）₄不₆⁻、（I）和2,6-二氨基-4-氯嘧啶第页-甲苯磺酸盐一水合物₄H（H）₆氯离子₄⁺·C类₇H（H）₇O（运行）_三S公司⁻·H（H）₂O、合成了（II），并用单晶X射线衍射进行了表征。在这两种晶体结构中，嘧啶环1位的N原子被质子化。在盐（I）中，嘧啶阳离子的质子化N原子和氨基通过N-H与阴离子的羧酸基相互作用

O氢键与R（右）₂²（8）环形图案。在水合盐（II）中，水分子的存在防止了常见的R（右）₂²（8）戒指图案。相反，一个扩展环[即 R（右）_三²（8） ]由磺酸盐基团、嘧啶阳离子和水分子组成。两种盐都形成超分子同合子[R（右）₂²（8）环图案]至N-H

N氢键。分子结构通过π–π堆积进一步稳定，C=O

π、 C-H公司

O和C-H

Cl相互作用。

关键词：氢键;环形图案;异突触;超分子同源突触;π–π叠加相互作用;晶体结构.

阅读文章类似文章

支持信息

	结晶信息文件（CIF）https://doi.org/10.107/S2053229617008798/ku3199sup1.cif 包含数据块I、II
	结构系数文件（CIF格式）https://doi.org/10.107/S2053229617008798/ku3199Isup2.hkl 包含数据块I
	结构系数文件（CIF格式）https://doi.org/10.107/S2053229617008798/ku3199IIsup3.hkl 包含数据块II

CCDC参考：1555811;1555810

计算详细信息顶部

对于这两种化合物，数据收集：CrysAlis专业（安捷伦，2012）；单元格细化：CrysAlis专业（安捷伦，2012）；数据缩减：CrysAlis专业（安捷伦，2012）；用于求解结构的程序：SHELXT（Sheldrick，2015a）；用于细化结构的程序：SHELXL2016表（谢尔德里克，2015b）；分子图形：铂（斯佩克，2009），水银（麦克雷等。（2008）和POVRay（Cason，2004）；用于准备出版材料的软件：铂（斯佩克，2009）和公共CIF（Westrip，2010）。

（一） 2,6-二氨基-4-氯嘧啶-2-羧基-3-硝基苯甲酸盐顶部

水晶数据顶部

C类₄H（H）₆氯离子₄⁺·C类₈H（H）₄不₆⁻	Z轴= 2
M（M）_第页= 355.70	F类(000) = 364
三联诊所，P（P）1	D类_x个=1.710毫克⁻^三
一=7.1403（4）Å	钼K（K）α辐射，λ= 0.71073 Å
b= 8.6745 (6) Å	8897次反射的单元参数
c（c）= 11.5730 (7) Å	θ= 2.9–41.1°
α= 93.721 (5)°	µ=0.32毫米⁻¹
β= 93.714 (4)°	T型=120 K
γ= 104.230 (5)°	棱镜，无色
V（V）= 690.94 (8) Å^三	0.51×0.18×0.15毫米

数据收集顶部

超级新星CCD 衍射仪	8897独立反射
辐射源：SuperNova（Mo）X射线源	6381次反射我> 2σ(我)
探测器分辨率：10.6501像素mm^-1	R（右）_整数= 0.035
ω扫描	θ_最大值= 41.2°,θ_最小值= 2.9°
吸收校正：多扫描（CrysAlis PRO；安捷伦，2012）	小时=−12→13
T型_最小值= 0.853,T型_最大值= 0.953	k个=−15→15
17128次测量反射	我=−21→19

精炼顶部

优化于F类²	0个约束
最小二乘矩阵：完整	氢站点位置：混合
R（右）[F类²> 2σ(F类²)] = 0.046	用独立和约束精化的混合物处理H原子
水风险(F类²) = 0.128	w个= 1/[σ²(F类_o个²) + (0.0479P（P）)²+ 0.0574P（P）] 哪里P（P）= (F类_o个²+ 2F类_c（c）²)/3
S公司= 1.08	(Δ/σ)_最大值= 0.001
8897次反射	Δρ_最大值=0.65埃⁻^三
237个参数	Δρ_最小值=−0.47埃⁻^三

特殊细节顶部

几何图形.所有esd（两个l.s.平面之间二面角中的esd除外）使用全协方差矩阵进行估计在估计距离、角度的esd时单独考虑和扭转角；细胞参数中esd之间的相关性仅为当它们由晶体对称性定义时使用。近似（各向同性）细胞esd的处理用于估计涉及l.s.平面的esd。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数²) 顶部

	x个	年	z（z）	U型_{国际标准化组织}*/U型_等式
第1类	0.63993 (4)	1.04519 (3)	0.25190 (2)	0.01979 (6)
N1型	0.55013 (12)	0.74600（11）	0.54072 (7)	0.01316 (14)
上半年	0.538045	0.687385	0.600379	0.016*
指挥与控制	0.72602 (13)	0.84096 (12)	0.52499 (8)	0.01331 (15)
N3号机组	0.75477（12）	0.93419（11）	0.43716 (7)	0.01410 (14)
氮气	0.87159 (13)	0.84139 (13)	0.60229 (8)	0.01999 (18)
4号机组	0.22454 (13)	0.64581 (13)	0.49137 (8)	0.01789 (17)
补体第四成份	0.59860 (14)	0.92422 (12)	0.36472 (8)	0.01331 (15)
C5级	0.41551 (15)	0.83130 (13)	0.37218 (8)	0.01498 (16)
H5型	0.311152	0.829800	0.316505	0.018*
C6级	0.39221 (14)	0.73863 (12)	0.46726 (8)	0.01292（15）
O1公司	0.75260 (10)	0.56282 (10)	0.74864 (6)	0.01537 (13)
氧气	0.45818 (10)	0.60234 (10)	0.72180 (7)	0.01692 (14)
臭氧	0.10958 (11)	0.36711 (11)	0.67139（6）	0.01820（15）
O4号机组	0.06161 (10)	0.49596 (9)	0.83689 (6)	0.01432 (13)
O5公司	−0.08265 (11)	0.14856 (11)	0.85169 (8)	0.02178 (17)
O6公司	−0.03231 (11)	0.15588 (11)	1.03837 (7)	0.01980 (15)
5号机组	0.02342 (12)	0.17979 (11)	0.94195 (8)	0.01452 (14)
C7	0.49496 (12)	0.40920 (11)	0.84769 (8)	0.01049 (14)
抄送8	0.29398 (13)	0.35047 (11)	0.85034 (8)	0.01082 (14)
C9级	0.23120 (13)	0.24587（12）	0.93408 (8)	0.01163 (14)
C10号机组	0.35520 (13)	0.19628 (12)	1.01241 (8)	0.01305 (15)
H10型	0.305859	0.125158	1.068602	0.016*
C11号机组	0.55244（13）	0.25326（13）	1.00635 (8)	0.01357 (16)
H11型	0.641024	0.220092	1.057965	0.016*
第12项	0.62066 (13)	0.35864 (12)	0.92504 (8)	0.01193 (15)
H12型	0.756591	0.397529	0.921848	0.014*
第13页	0.57611 (13)	0.53260 (12)	0.76673 (8)	0.01135 (14)
第14项	0.14689 (13)	0.40599 (12)	0.77419 (8)	0.01242 (15)
过氧化氢	0.852 (3)	0.773 (2)	0.6594（15）	0.035 (5)*
硫化氢	0.991 (3)	0.907 (2)	0.5925 (14)	0.034 (5)*
H4A型	0.123 (2)	0.631 (2)	0.4418 (14)	0.030 (4)*
H4B型	0.217 (3)	0.594（2）	0.5501（15）	0.036 (5)*
H4型	−0.045 (3)	0.512 (3)	0.7962 (16)	0.045 (5)*

原子位移参数（²) 顶部

	U型¹¹	U型²²	U型³³	U型¹²	U型¹³	U型²³
第1类	0.02833 (13)	0.01828 (12)	0.01351 (10)	0.00545 (9)	0.00237 (8)	0.00795 (8)
N1型	0.0119 (3)	0.0150 (4)	0.0121 (3)	0.0017 (3)	−0.0001 (2)	0.0061 (3)
指挥与控制	0.0119 (3)	0.0140 (4)	0.0142 (4)	0.0024 (3)	0.0015 (3)	0.0055 (3)
N3号机组	0.0149 (3)	0.0145 (4)	0.0134 (3)	0.0036（3）	0.0018 (3)	0.0052 (3)
氮气	0.0124 (3)	0.0259 (5)	0.0204 (4)	0.0004 (3)	−0.0020 (3)	0.0132 (4)
4号机组	0.0126 (3)	0.0224 (5)	0.0159 (4)	−0.0012（3）	−0.0026（3）	0.0066 (3)
补体第四成份	0.0185 (4)	0.0125 (4)	0.0102 (3)	0.0055 (3)	0.0019 (3)	0.0033 (3)
C5级	0.0176 (4)	0.0163 (4)	0.0107 (3)	0.0039 (3)	−0.0012 (3)	0.0027 (3)
C6级	0.0136 (4)	0.0133 (4)	0.0114 (3)	0.0027 (3)	−0.0005 (3)	0.0019 (3)
O1公司	0.0104 (3)	0.0189 (4)	0.0185 (3)	0.0046 (2)	0.0027 (2)	0.0091 (3)
氧气	0.0128 (3)	0.0221 (4)	0.0198 (3)	0.0085（3）	0.0039 (2)	0.0130 (3)
臭氧	0.0175 (3)	0.0246 (4)	0.0130 (3)	0.0075 (3)	−0.0037 (2)	0.0011 (3)
O4号机组	0.0114 (3)	0.0176 (3)	0.0159 (3)	0.0071 (2)	0.0003（2）	0.0032（2）
O5公司	0.0140 (3)	0.0219 (4)	0.0266 (4)	−0.0001 (3)	−0.0061 (3)	0.0071 (3)
O6公司	0.0154 (3)	0.0221 (4)	0.0237 (4)	0.0052 (3)	0.0076 (3)	0.0080 (3)
5号机组	0.0108 (3)	0.0119 (3)	0.0213 (4)	0.0024 (3)	0.0013 (3)	0.0059 (3)
C7	0.0103 (3)	0.0113 (4)	0.0105 (3)	0.0036 (3)	0.0003 (2)	0.0023 (3)
抄送8	0.0105 (3)	0.0110 (4)	0.0114 (3)	0.0034 (3)	0.0000 (2)	0.0026 (3)
C9级	0.0096 (3)	0.0117（4）	0.0137 (3)	0.0024 (3)	0.0006 (3)	0.0034 (3)
C10号机组	0.0122 (3)	0.0139 (4)	0.0138 (4)	0.0036 (3)	0.0009 (3)	0.0052 (3)
C11号机组	0.0120（3）	0.0162（4）	0.0137 (4)	0.0048 (3)	0.0002 (3)	0.0059 (3)
第12项	0.0099 (3)	0.0146 (4)	0.0123 (3)	0.0041 (3)	0.0007 (3)	0.0043 (3)
第13页	0.0110 (3)	0.0128 (4)	0.0110 (3)	0.0038 (3)	0.0010 (2)	0.0034 (3)
第14项	0.0100 (3)	0.0133 (4)	0.0139 (4)	0.0026 (3)	−0.0008 (3)	0.0037 (3)

几何参数（λ，º）顶部

氯1-C4	1.7230 (10)	O4-C14型	1.3130 (12)
N1-C2型	1.3525（13）	O5-N5型	1.2240 (12)
N1-C6型	1.3534 (12)	O6-N5型	1.2220 (12)
C2-N2型	1.3258 (13)	N5-C9型	1.4643 (12)
C2-N3型	1.3348（12）	C7-C12号机组	1.3928 (12)
N3-C4	1.3326 (13)	C7-C8号机组	1.4029 (13)
N4-C6号	1.3259 (13)	C7-C13号机组	1.5017 (13)
C4-C5型	1.3681 (15)	C8-C9型	1.3906 (13)
C5-C6型	1.3991 (13)	C8-C14号机组	1.5151 (12)
O1-C13型	1.2568 (11)	C9-C10型	1.3873 (13)
氧气-C13	1.2569 (11)	C10-C11号机组	1.3812 (13)
臭氧-C14	1.2095 (12)	C11-C12号机组	1.3822 (13)

C2-N1-C6	121.83 (8)	C8-C7-C13型	120.74（8）
N2-C2-N3气体	120.19 (9)	C9-C8-C7	116.94 (8)
N2-C2-N1型	117.42 (9)	C9-C8-C14型	119.68 (8)
N3-C2-N1号	122.38 (8)	C7-C8-C14号机组	123.18（8）
C4-N3-C2型	115.13 (9)	C10-C9-C8号机组	123.80 (8)
编号3-4-C5	127.05 (9)	C10-C9-N5号机组	116.25 (8)
N3-C4-Cl1号机组	114.17 (8)	C8-C9-N5号	119.95 (8)
C5-C4-Cl1	118.78 (7)	C11-C10-C9	118.09 (9)
C4-C5-C6	115.54 (9)	C10-C11-C12号机组	119.86 (8)
编号4-C6-N1	117.68 (9)	C11-C12-C7型	121.60 (8)
编号4-C6-C5	124.26 (9)	O1-C13-O2	123.80 (9)
N1-C6-C5	118.05 (9)	O1-C13-C7型	120.33（8）
O6-N5-O5型	124.15 (9)	氧气-C13-C7	115.86 (8)
O6-N5-C9型	117.69 (8)	臭氧-C14-O4	125.49 (9)
O5-N5-C9型	118.14 (8)	O3至C14至C8	124.28（9）
C12-C7-C8型	119.68 (8)	O4-C14-C8型	110.17 (8)
C12-C7-C13型	119.50 (8)

氢键几何结构（Å，º）顶部

D类-H（H）···一个	D类-H（H）	H（H）···一个	D类···一个	D类-H（H）···一个
N1-H1··O2	0.88	1.70	2.5477 (12)	162
N2-H2气体一个···O1公司	0.911 (17)	2.144 (17)	3.0229 (13)	161.7 (16)
N2-H2气体B类···N3号机组^我	0.92 (2)	2.06 (2)	2.9725 (14)	175.0 (17)
O4-H4··O1^ii（ii）	0.91 (2)	1.68 (2)	2.5811 (11)	167.5 (19)
N4-H4型一个···臭氧^三	0.873 (15)	2.052 (15)	2.9174（12）	171.3 (16)
N4-H4型B类···氧气	0.836 (17)	2.529 (19)	3.1465 (12)	131.5 (17)
N4-H4型B类···臭氧	0.836 (17)	2.488 (17)	3.2800 (13)	158.5 (17)
C5-H5···O5^三	0.95	2.50	3.4434（14）	170
C11-H11···Cl1^iv（四）	0.95	2.79	3.5656 (10)	140
C11-H11···O6^v（v）	0.95	2.55	3.2820 (13)	134
C12-H12···O4^v（v）	0.95	2.43	3.3321 (12)	158

对称代码：（i）−x个+2,−年+2,−z（z）+1; （ii）x个−1,年，z（z）; （iii）−x个，−年+1,−z（z）+1; （iv）x个，年−1,z（z）+1; （v）x个+1,年，z（z）.

（二） 2,6-二氨基-4-氯嘧啶第页-甲苯磺酸盐顶部