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标题化合物C14H(H)194S、 五环抗癌生物碱喜树碱的合成中间体,已被晶体鉴定。晶体结构由分子内和分子间氢键稳定。

支持信息

到岸价

结晶信息文件(CIF)https://doi.org/10.107/S1600536805031636/hg6251sup1.cif
包含全局数据块,I

香港特别行政区

结构系数文件(CIF格式)https://doi.org/10.107/S1600536805031636/hg6251Isup2.hkl
包含数据块I

CCDC参考:289765

关键指标

  • 单晶X射线研究
  • T型=291千
  • 平均值[西格玛](C-C)=0.005Å
  • 系数=0.048
  • 水风险系数=0.088
  • 数据与参数之比=14.5

检查CIF/PLATON结果

未发现语法错误
警报级别C PLAT220_警报_2_C大型非溶剂C Ueq(最大)/Ueq。。。2.58比率铭牌230_铭牌_2_CS1-O1的Hirshfeld测试差异。。5.01苏铭牌230_铭牌_2_CS1-O2的赫什菲尔德试验差异。。6.57苏板241_ALERT_2_C检查C13的高Ueq与相邻值的比较平台242_警报_2_C检查C4的低Ueq与相邻Ueq的比较平台242_警报_2_C检查低Ueq与相邻C12的比较铭牌340_警报_3_CC-C债券的低债券精度(x 1000)Ang。。。5
警报级别G 参考03_图纸_4_G请检查Friedel对数量的估计值是否为对的。如果不是,请在_提交的CIF的publ_section_exptl_refinement部分。来自CIF:_diffrn_reflns_theta_max 25.00来自CIF:_reflns_number_total 2652对称唯一refns计数1548完整性(_total/calc)171.32%测试3:检查Friedels的非中心结构Friedel对测量值的估计1104弗里德尔对的测量分数为0.713是否存在重原子类型Z>Si是
0A级警报=一般情况下:严重问题0B级警报=潜在的严重问题7C级警报=检查并解释1G级警报=一般警报;检查0警报类型1 CIF构造/语法错误,数据不一致或缺失6警告类型2结构模型可能错误或有缺陷的指示器1警报类型3结构质量可能较低的指示器1警报类型4改进、方法、查询或建议

计算详细信息顶部

数据收集:智能(布鲁克,2000年);单元格细化:智能; 数据缩减:圣保罗(Bruker,2000年);用于求解结构的程序:SHELXTL公司(布鲁克,2000年);用于优化结构的程序:SHELXTL公司; 分子图形:SHELXTL公司; 用于准备出版材料的软件:SHELXTL公司

L(左)-1-(第页-甲苯磺酰基)脯氨酸乙酯顶部
水晶数据 顶部
C类14H(H)194S公司F类(000) = 632
M(M)第页= 297.36D类x个=1.313毫克
正交各向异性,P(P)212121K(K)α辐射,λ= 0.71073 Å
大厅符号:P2ac 2ab784次反射的单元参数
= 7.4671 (17) Åθ= 3.0–25.1°
b条= 11.547 (3) ŵ=0.23毫米1
c(c)= 17.445 (4) ÅT型=291千
V(V)= 1504.1 (6) Å平板,无色
Z轴=40.60×0.50×0.40毫米
数据收集 顶部
Bruker SMART CCD区域探测器
衍射仪
2652次独立反射
辐射源:细焦点密封管1855次反射> 2σ()
石墨单色仪整数= 0.069
φω扫描θ最大值= 25.0°,θ最小值= 2.1°
吸收校正:多扫描
(SADABS;布鲁克,2000年)
小时=86
T型最小值= 0.876,T型最大值= 0.915k个=1313
7523次测量反射=2020
精炼 顶部
优化于F类2二次原子位置:差分傅里叶映射
最小二乘矩阵:完整氢站点位置:从邻近站点推断
[F类2> 2σ(F类2)] = 0.048H原子参数受约束
水风险(F类2) = 0.088 w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.024P(P))2]
哪里P(P)= (F类o个2+ 2F类c(c)2)/3
S公司= 0.91(Δ/σ)最大值< 0.001
2652次反射Δρ最大值=0.31埃
183个参数Δρ最小值=0.15埃
7个约束绝对结构:Flack(1983),1104对Friedel对
主原子位置定位:结构-变量直接方法绝对结构参数:0.08 (10)
特殊细节 顶部

实验.通过直接方法(Bruker,2000)和连续方法求解结构差分傅里叶综合。

几何图形所有的e.s.d.(除了两个l.s.平面之间的二面角中的e.s.d.)使用全协方差矩阵进行估计在估计e.s.d.的距离、角度时单独考虑和扭转角;e.s.d.细胞内参数之间的相关性仅为

当它们由晶体对称性定义时使用。近似(各向同性)细胞e.s.d.的处理用于估计涉及l.s.的e.s.d。飞机。

精炼.改进F类2对抗所有反射。加权-因子水风险和贴合度S公司基于F类2,常规-因素基于F类,使用F类为设置为零消极的F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算-因子(gt)并且与选择反射进行细化无关。-因素基于F类2从统计上看大约是两倍大作为那些基于F类、和-基于所有数据的系数将为甚至更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个z(z)U型国际标准化组织*/U型等式
C1类0.4766 (4)0.6102 (3)0.29772 (16)0.0449 (7)
C20.4520 (4)0.5131 (3)0.34185 (18)0.0556 (9)
氢气0.45220.44020.31920.067*
C3类0.4269 (4)0.5239(3)0.4194 (2)0.0635 (11)
H3级0.41160.45760.44900.076*
补体第四成份0.4240 (5)0.6301 (4)0.45421 (19)0.0641 (11)
C5级0.4469 (5)0.7256 (3)0.4092 (2)0.0719 (11)
H5型0.44490.79850.43200.086*
C6级0.4728 (5)0.7178 (3)0.33139 (17)0.0582 (9)
H6型0.48740.78430.30190.070*
抄送70.4010 (6)0.6413 (4)0.54008 (17)0.1057 (16)
H7A型0.32670.57940.55850.159*
H7B型0.34560.71420.55170.159*
H7C型0.51600.63730.56450.159*
抄送80.8309 (4)0.4890 (3)0.2233(2)0.0629 (10)
H8A型0.83250.42530.18710.075*
H8B型0.77430.46320.27040.075*
C91.0178 (5)0.5330 (3)0.2385 (2)0.0746 (11)
H9A型1.09540.51880.19490.090*
H9B型1.06890.49640.28350.090*
C10号机组0.9911 (5)0.6622 (3)0.25129 (17)0.0717 (10)
H10A型0.95210.67780.30330.086*
H10B型1.10090.70470.24150.086*
C11号机组0.8473 (4)0.6946 (3)0.19404 (17)0.0516 (9)
H11型0.77790.76130.21200.062*
第12项0.9287 (5)0.7183 (3)0.11713(18)0.0553 (9)
第13页1.0765 (7)0.8578(4)0.0413 (2)0.1163 (17)
H13A型1.19550.82410.04250.140*
H13B型1.01390.82740.00310.140*
第14项1.0899 (5)0.9825 (4)0.0356 (2)0.0970 (15)
第14页1.14521.01260.08110.145*
H14B型0.97231.01500.03020.145*
H14C型1.16101.00260.00820.145*
N1型0.7360 (3)0.5908 (2)0.19090 (13)0.0522 (6)
O1公司0.4515 (3)0.49069 (19)0.17390 (11)0.0628 (7)
氧气0.4681 (4)0.70389 (19)0.16354(11)0.0652 (7)
臭氧层0.9798 (4)0.8272(2)0.11091 (12)0.0816 (8)
O4号机组0.9485 (4)0.6479 (2)0.06845 (12)0.0881 (9)
S1(第一阶段)0.52168 (11)0.59891 (7)0.19946 (4)0.0508 (2)
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
C1类0.0397 (16)0.0361 (18)0.0589 (16)0.0034 (16)0.0039 (16)0.0018(17)
C20.057 (2)0.042 (2)0.067 (2)0.0052 (18)0.0015 (19)0.0012 (17)
C3类0.061 (3)0.067 (3)0.062 (2)0.004 (2)0.0054 (19)0.021 (2)
补体第四成份0.064 (2)0.076 (3)0.053 (2)0.010 (2)0.0014 (17)0.005(2)
C5级0.086 (3)0.055 (2)0.075 (2)0.007(2)0.001 (2)0.016 (2)
C6级0.069 (3)0.043 (2)0.062 (2)0.009 (2)0.004 (2)0.0013 (17)
抄送70.119 (4)0.133 (4)0.065(2)0.016 (3)0.012 (3)0.002(3)
抄送80.053 (2)0.055(2)0.081 (2)0.0111 (19)0.0101 (18)0.005(2)
C90.063 (3)0.084(3)0.077 (2)0.004 (2)0.003 (2)0.022 (2)
C10号机组0.068 (2)0.091 (3)0.0562 (19)0.020 (2)0.008 (2)0.000 (2)
C11号机组0.055 (2)0.050 (2)0.0500 (18)0.0020 (17)0.0047 (18)0.0070 (19)
第12项0.065 (3)0.049 (2)0.052 (2)0.0045 (18)0.0030(18)0.0021 (19)
第13页0.181(5)0.082 (3)0.086 (3)0.037 (3)0.068 (3)0.001 (2)
第14项0.098 (3)0.092 (4)0.100 (3)0.004 (3)0.021(3)0.041 (3)
N1型0.0524 (16)0.0387 (15)0.0654 (16)0.0018 (15)0.0042 (13)0.0080 (16)
O1公司0.0624 (17)0.0550 (15)0.0711 (14)0.0122 (13)0.0029 (12)0.0162 (12)
氧气0.0739 (17)0.0593(15)0.0624 (12)0.0148 (15)0.0080(13)0.0179 (12)
臭氧层0.125 (2)0.0534 (16)0.0667 (14)0.0262 (18)0.0355 (16)0.0023 (12)
O4号机组0.138 (2)0.0661 (17)0.0606 (14)0.0221 (18)0.0229 (16)0.0147 (13)
S1(第一阶段)0.0502 (5)0.0482 (5)0.0540(4)0.0004 (5)0.0043 (4)0.0002 (5)
几何参数(λ,º) 顶部
C1-C2类1.372 (4)C9-H9A型0.9700
C1-C6号机组1.375 (4)C9-H9B型0.9700
C1-S1号机组1.752 (3)C10-C11号机组1.514 (4)
C2-C3型1.372 (4)C10-H10A型0.9700
C2-H2型0.9300C10-H10B型0.9700
C3-C4型1.368 (5)C11-N1型1.459 (4)
C3-H3型0.9300C11-C12号机组1.498(4)
C4至C51.365 (4)C11-H11型0.9800
C4至C71.513 (4)C12-O4型1.185 (3)
C5至C61.374(4)C12-O3型1.318 (4)
C5-H5型0.9300C13至C141.446 (4)
C6-H6型0.9300C13-O3型1.456 (4)
C7-H7A型0.9600C13-H13A型0.9700
C7-H7B型0.9600C13-H13B型0.9700
C7-H7C型0.9600C14-H14A型0.9600
C8-N1型1.485 (4)C14-H14B型0.9600
C8-C9型1.509 (5)C14-H14C型0.9600
C8-H8A型0.9700N1-S1型1.610 (2)
C8-H8B型0.9700O1-S1型1.426 (2)
C9-C10型1.522 (4)氧气-S11.422 (2)
C2-C1-C6型119.7 (3)C11-C10-H10A型111
C2-C1-S1型121.0 (2)C9-C10-H10A111
C6-C1-S1119.3 (2)C11-C10-H10B型111
C3-C2-C1119.9 (3)C9-C10-H10B111
C3-C2-H2120.1H10A-C10-H10B型109
C1-C2-H2120.1N1-C11-C12号机组110.3 (3)
C4-C3-C2型121.4 (3)N1-C11-C10103.1 (3)
C4-C3-H3型119.3C12-C11-C10110.4 (3)
C2-C3-H3型119.3N1-C11-H11型110.9
C5-C4-C3型117.9 (3)C12-C11-H11型110.9
C5-C4-C7121.0(4)C10-C11-H11号机组110.9
C3至C4-7121.1 (4)臭氧-C12-O3124.0 (3)
C4-C5-C6122.2 (3)O4-C12-C11型124.6 (3)
C4-C5-H5型118.9O3-C12-C11型111.4 (3)
C6-C5-H5型118.9C14-C13-O3型109.5(3)
C5-C6-C1119.0 (3)C14-C13-H13A109.8
C5-C6-H6120.5O3-C13-H13A型109.8
C1-C6-H6型120.5C14-C13-H13B型109.8
C4-C7-H7A型109.5O3-C13-H13B型109.8
C4-C7-H7B型109.5H13A-C13-H13B型108.2
H7A-C7-H7B型109.5C13-C14-H14A型109.5
C4-C7-H7C型109.5C13-C14-H14B109.5
H7A-C7-H7C型109.5H14A-C14-H14B109.5
H7B-C7-H7C型109.5C13-C14-H14C109.5
N1-C8-C9型103.9 (3)H14A-C14-H14C109.5
N1-C8-H8A型111H14B-C14-H14C型109.5
C9-C8-H8A基因111C11-N1-C8型111.4 (2)
N1-C8-H8B型111C11-N1-S1型121.0 (2)
C9-C8-H8B111C8-N1-S1型119.0 (2)
H8A-C8-H8B109C12-O3-C13116.4 (3)
C8-C9-C10型103.6(3)O2-S1-O1型120.37 (13)
C8-C9-H9A型111O2-S1-N1型106.77 (15)
C10-C9-H9A型111O1-S1-N1型106.57 (14)
C8-C9-H9B型111O2-S1-C1型108.30 (14)
C10-C9-H9B型111O1-S1-C1型107.48(14)
H9A-C9-H9B109N1-S1-C1号机组106.61 (12)
C11-C10-C9103.7 (3)
C6-C1-C2-C3型1.2 (5)C12-C11-N1-S1111.7 (3)
S1-C1-C2-C3型176.3 (2)C10-C11-N1-S1号机组130.5 (2)
C1-C2-C3-C4型0.7 (5)C9-C8-N1-C116.5 (3)
C2-C3-C4-C5型0.0 (6)C9-C8-N1-S1154.6 (2)
C2-C3-C4-C7型178.5 (3)O4-C12-O3-C134.1 (6)
C3-C4-C5-C6型0.2 (6)C11-C12-O3-C13174.3 (3)
C7-C4-C5-C6178.3(4)C14-C13-O3-C12168.1 (4)
C4-C5-C6-C1型0.3 (6)C11-N1-S1-O235.1 (3)
C2-C1-C6-C5型1.0 (5)C8-N1-S1-O2179.9 (2)
S1-C1-C6-C5型176.5 (3)C11-N1-S1-O1型164.9 (2)
N1-C8-C9-C1027.1 (3)C8-N1-S1-O1号机组50.1 (3)
C8-C9-C10-C11号机组37.9(3)C11-N1-S1-C180.5 (2)
C9-C10-C11-N133.4 (3)C8-N1-S1-C164.5 (3)
C9-C10-C11-C1284.4 (4)C2-C1-S1-O2型156.1 (3)
N1-C11-C12-O422.0 (5)C6-C1-S1-O226.4 (3)
C10-C11-C12-O491.3 (4)C2-C1-S1-O1型24.6 (3)
N1-C11-C12-O3型159.6 (3)C6-C1-S1-O1157.9 (3)
C10-C11-C12-O3型87.1(4)C2-C1-S1-N1型89.4 (3)
C12-C11-N1-C8100.9 (3)C6-C1-S1-N188.2 (3)
C10-C11-N1-C816.9 (3)
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
C6-H6···O20.932.592.933 (4)102
C11-H11···O20.982.552.883 (4)100
C6-H6···O10.932.463.202(4)137
对称代码:(i)x个+1,+1/2,z(z)+1/2.
 

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