标题化合物C14H(H)19否4S、 五环抗癌生物碱喜树碱的合成中间体,已被晶体鉴定。晶体结构由分子内和分子间氢键稳定。
支持信息
CCDC参考:289765
关键指标
- 单晶X射线研究
- T型=291千
- 平均值
(C-C)=0.005Å
- 对系数=0.048
- 水风险系数=0.088
- 数据与参数之比=14.5
检查CIF/PLATON结果
未发现语法错误
警报级别C
PLAT220_警报_2_C大型非溶剂C Ueq(最大)/Ueq。。。2.58比率铭牌230_铭牌_2_CS1-O1的Hirshfeld测试差异。。5.01苏铭牌230_铭牌_2_CS1-O2的赫什菲尔德试验差异。。6.57苏板241_ALERT_2_C检查C13的高Ueq与相邻值的比较平台242_警报_2_C检查C4的低Ueq与相邻Ueq的比较平台242_警报_2_C检查低Ueq与相邻C12的比较铭牌340_警报_3_CC-C债券的低债券精度(x 1000)Ang。。。5
警报级别G
参考03_图纸_4_G请检查Friedel对数量的估计值是否为对的。如果不是,请在_提交的CIF的publ_section_exptl_refinement部分。来自CIF:_diffrn_reflns_theta_max 25.00来自CIF:_reflns_number_total 2652对称唯一refns计数1548完整性(_total/calc)171.32%测试3:检查Friedels的非中心结构Friedel对测量值的估计1104弗里德尔对的测量分数为0.713是否存在重原子类型Z>Si是
0A级警报=一般情况下:严重问题0B级警报=潜在的严重问题7C级警报=检查并解释1G级警报=一般警报;检查0警报类型1 CIF构造/语法错误,数据不一致或缺失6警告类型2结构模型可能错误或有缺陷的指示器1警报类型3结构质量可能较低的指示器1警报类型4改进、方法、查询或建议
数据收集:智能(布鲁克,2000年);单元格细化:智能; 数据缩减:圣保罗(Bruker,2000年);用于求解结构的程序:SHELXTL公司(布鲁克,2000年);用于优化结构的程序:SHELXTL公司; 分子图形:SHELXTL公司; 用于准备出版材料的软件:SHELXTL公司。
水晶数据 顶部
C类14H(H)19否4S公司 | F类(000) = 632 |
M(M)第页= 297.36 | D类x个=1.313毫克−三 |
正交各向异性,P(P)212121 | 钼K(K)α辐射,λ= 0.71073 Å |
大厅符号:P2ac 2ab | 784次反射的单元参数 |
一= 7.4671 (17) Å | θ= 3.0–25.1° |
b条= 11.547 (3) Å | µ=0.23毫米−1 |
c(c)= 17.445 (4) Å | T型=291千 |
V(V)= 1504.1 (6) Å三 | 平板,无色 |
Z轴=4 | 0.60×0.50×0.40毫米 |
数据收集 顶部
Bruker SMART CCD区域探测器 衍射仪 | 2652次独立反射 |
辐射源:细焦点密封管 | 1855次反射我> 2σ(我) |
石墨单色仪 | 对整数= 0.069 |
φ和ω扫描 | θ最大值= 25.0°,θ最小值= 2.1° |
吸收校正:多扫描 (SADABS;布鲁克,2000年) | 小时=−8→6 |
T型最小值= 0.876,T型最大值= 0.915 | k个=−13→13 |
7523次测量反射 | 我=−20→20 |
精炼 顶部
优化于F类2 | 二次原子位置:差分傅里叶映射 |
最小二乘矩阵:完整 | 氢站点位置:从邻近站点推断 |
对[F类2> 2σ(F类2)] = 0.048 | H原子参数受约束 |
水风险(F类2) = 0.088 | w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.024P(P))2] 哪里P(P)= (F类o个2+ 2F类c(c)2)/3 |
S公司= 0.91 | (Δ/σ)最大值< 0.001 |
2652次反射 | Δρ最大值=0.31埃−三 |
183个参数 | Δρ最小值=−0.15埃−三 |
7个约束 | 绝对结构:Flack(1983),1104对Friedel对 |
主原子位置定位:结构-变量直接方法 | 绝对结构参数:−0.08 (10) |
特殊细节 顶部
实验.通过直接方法(Bruker,2000)和连续方法求解结构差分傅里叶综合。 |
几何图形所有的e.s.d.(除了两个l.s.平面之间的二面角中的e.s.d.)使用全协方差矩阵进行估计在估计e.s.d.的距离、角度时单独考虑和扭转角;e.s.d.细胞内参数之间的相关性仅为 当它们由晶体对称性定义时使用。近似(各向同性)细胞e.s.d.的处理用于估计涉及l.s.的e.s.d。飞机。 |
精炼.改进F类2对抗所有反射。加权对-因子水风险和贴合度S公司基于F类2,常规对-因素对基于F类,使用F类为设置为零消极的F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算对-因子(gt)等。并且与选择反射进行细化无关。对-因素基于F类2从统计上看大约是两倍大作为那些基于F类、和对-基于所有数据的系数将为甚至更大。 |
分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部 | x个 | 年 | z(z) | U型国际标准化组织*/U型等式 | |
C1类 | 0.4766 (4) | 0.6102 (3) | 0.29772 (16) | 0.0449 (7) | |
C2 | 0.4520 (4) | 0.5131 (3) | 0.34185 (18) | 0.0556 (9) | |
氢气 | 0.4522 | 0.4402 | 0.3192 | 0.067* | |
C3类 | 0.4269 (4) | 0.5239(3) | 0.4194 (2) | 0.0635 (11) | |
H3级 | 0.4116 | 0.4576 | 0.4490 | 0.076* | |
补体第四成份 | 0.4240 (5) | 0.6301 (4) | 0.45421 (19) | 0.0641 (11) | |
C5级 | 0.4469 (5) | 0.7256 (3) | 0.4092 (2) | 0.0719 (11) | |
H5型 | 0.4449 | 0.7985 | 0.4320 | 0.086* | |
C6级 | 0.4728 (5) | 0.7178 (3) | 0.33139 (17) | 0.0582 (9) | |
H6型 | 0.4874 | 0.7843 | 0.3019 | 0.070* | |
抄送7 | 0.4010 (6) | 0.6413 (4) | 0.54008 (17) | 0.1057 (16) | |
H7A型 | 0.3267 | 0.5794 | 0.5585 | 0.159* | |
H7B型 | 0.3456 | 0.7142 | 0.5517 | 0.159* | |
H7C型 | 0.5160 | 0.6373 | 0.5645 | 0.159* | |
抄送8 | 0.8309 (4) | 0.4890 (3) | 0.2233(2) | 0.0629 (10) | |
H8A型 | 0.8325 | 0.4253 | 0.1871 | 0.075* | |
H8B型 | 0.7743 | 0.4632 | 0.2704 | 0.075* | |
C9 | 1.0178 (5) | 0.5330 (3) | 0.2385 (2) | 0.0746 (11) | |
H9A型 | 1.0954 | 0.5188 | 0.1949 | 0.090* | |
H9B型 | 1.0689 | 0.4964 | 0.2835 | 0.090* | |
C10号机组 | 0.9911 (5) | 0.6622 (3) | 0.25129 (17) | 0.0717 (10) | |
H10A型 | 0.9521 | 0.6778 | 0.3033 | 0.086* | |
H10B型 | 1.1009 | 0.7047 | 0.2415 | 0.086* | |
C11号机组 | 0.8473 (4) | 0.6946 (3) | 0.19404 (17) | 0.0516 (9) | |
H11型 | 0.7779 | 0.7613 | 0.2120 | 0.062* | |
第12项 | 0.9287 (5) | 0.7183 (3) | 0.11713(18) | 0.0553 (9) | |
第13页 | 1.0765 (7) | 0.8578(4) | 0.0413 (2) | 0.1163 (17) | |
H13A型 | 1.1955 | 0.8241 | 0.0425 | 0.140* | |
H13B型 | 1.0139 | 0.8274 | −0.0031 | 0.140* | |
第14项 | 1.0899 (5) | 0.9825 (4) | 0.0356 (2) | 0.0970 (15) | |
第14页 | 1.1452 | 1.0126 | 0.0811 | 0.145* | |
H14B型 | 0.9723 | 1.0150 | 0.0302 | 0.145* | |
H14C型 | 1.1610 | 1.0026 | −0.0082 | 0.145* | |
N1型 | 0.7360 (3) | 0.5908 (2) | 0.19090 (13) | 0.0522 (6) | |
O1公司 | 0.4515 (3) | 0.49069 (19) | 0.17390 (11) | 0.0628 (7) | |
氧气 | 0.4681 (4) | 0.70389 (19) | 0.16354(11) | 0.0652 (7) | |
臭氧层 | 0.9798 (4) | 0.8272(2) | 0.11091 (12) | 0.0816 (8) | |
O4号机组 | 0.9485 (4) | 0.6479 (2) | 0.06845 (12) | 0.0881 (9) | |
S1(第一阶段) | 0.52168 (11) | 0.59891 (7) | 0.19946 (4) | 0.0508 (2) | |
原子位移参数(2) 顶部 | U型11 | U型22 | U型33 | U型12 | U型13 | U型23 |
C1类 | 0.0397 (16) | 0.0361 (18) | 0.0589 (16) | 0.0034 (16) | −0.0039 (16) | 0.0018(17) |
C2 | 0.057 (2) | 0.042 (2) | 0.067 (2) | −0.0052 (18) | −0.0015 (19) | −0.0012 (17) |
C3类 | 0.061 (3) | 0.067 (3) | 0.062 (2) | 0.004 (2) | 0.0054 (19) | 0.021 (2) |
补体第四成份 | 0.064 (2) | 0.076 (3) | 0.053 (2) | 0.010 (2) | 0.0014 (17) | −0.005(2) |
C5级 | 0.086 (3) | 0.055 (2) | 0.075 (2) | 0.007(2) | −0.001 (2) | −0.016 (2) |
C6级 | 0.069 (3) | 0.043 (2) | 0.062 (2) | 0.009 (2) | 0.004 (2) | 0.0013 (17) |
抄送7 | 0.119 (4) | 0.133 (4) | 0.065(2) | 0.016 (3) | 0.012 (3) | 0.002(3) |
抄送8 | 0.053 (2) | 0.055(2) | 0.081 (2) | 0.0111 (19) | 0.0101 (18) | 0.005(2) |
C9 | 0.063 (3) | 0.084(3) | 0.077 (2) | 0.004 (2) | −0.003 (2) | 0.022 (2) |
C10号机组 | 0.068 (2) | 0.091 (3) | 0.0562 (19) | −0.020 (2) | −0.008 (2) | 0.000 (2) |
C11号机组 | 0.055 (2) | 0.050 (2) | 0.0500 (18) | −0.0020 (17) | 0.0047 (18) | −0.0070 (19) |
第12项 | 0.065 (3) | 0.049 (2) | 0.052 (2) | −0.0045 (18) | 0.0030(18) | −0.0021 (19) |
第13页 | 0.181(5) | 0.082 (3) | 0.086 (3) | −0.037 (3) | 0.068 (3) | 0.001 (2) |
第14项 | 0.098 (3) | 0.092 (4) | 0.100 (3) | −0.004 (3) | 0.021(3) | 0.041 (3) |
N1型 | 0.0524 (16) | 0.0387 (15) | 0.0654 (16) | −0.0018 (15) | 0.0042 (13) | 0.0080 (16) |
O1公司 | 0.0624 (17) | 0.0550 (15) | 0.0711 (14) | −0.0122 (13) | −0.0029 (12) | −0.0162 (12) |
氧气 | 0.0739 (17) | 0.0593(15) | 0.0624 (12) | 0.0148 (15) | −0.0080(13) | 0.0179 (12) |
臭氧层 | 0.125 (2) | 0.0534 (16) | 0.0667 (14) | −0.0262 (18) | 0.0355 (16) | −0.0023 (12) |
O4号机组 | 0.138 (2) | 0.0661 (17) | 0.0606 (14) | −0.0221 (18) | 0.0229 (16) | −0.0147 (13) |
S1(第一阶段) | 0.0502 (5) | 0.0482 (5) | 0.0540(4) | 0.0004 (5) | −0.0043 (4) | −0.0002 (5) |
几何参数(λ,º) 顶部
C1-C2类 | 1.372 (4) | C9-H9A型 | 0.9700 |
C1-C6号机组 | 1.375 (4) | C9-H9B型 | 0.9700 |
C1-S1号机组 | 1.752 (3) | C10-C11号机组 | 1.514 (4) |
C2-C3型 | 1.372 (4) | C10-H10A型 | 0.9700 |
C2-H2型 | 0.9300 | C10-H10B型 | 0.9700 |
C3-C4型 | 1.368 (5) | C11-N1型 | 1.459 (4) |
C3-H3型 | 0.9300 | C11-C12号机组 | 1.498(4) |
C4至C5 | 1.365 (4) | C11-H11型 | 0.9800 |
C4至C7 | 1.513 (4) | C12-O4型 | 1.185 (3) |
C5至C6 | 1.374(4) | C12-O3型 | 1.318 (4) |
C5-H5型 | 0.9300 | C13至C14 | 1.446 (4) |
C6-H6型 | 0.9300 | C13-O3型 | 1.456 (4) |
C7-H7A型 | 0.9600 | C13-H13A型 | 0.9700 |
C7-H7B型 | 0.9600 | C13-H13B型 | 0.9700 |
C7-H7C型 | 0.9600 | C14-H14A型 | 0.9600 |
C8-N1型 | 1.485 (4) | C14-H14B型 | 0.9600 |
C8-C9型 | 1.509 (5) | C14-H14C型 | 0.9600 |
C8-H8A型 | 0.9700 | N1-S1型 | 1.610 (2) |
C8-H8B型 | 0.9700 | O1-S1型 | 1.426 (2) |
C9-C10型 | 1.522 (4) | 氧气-S1 | 1.422 (2) |
| | | |
C2-C1-C6型 | 119.7 (3) | C11-C10-H10A型 | 111 |
C2-C1-S1型 | 121.0 (2) | C9-C10-H10A | 111 |
C6-C1-S1 | 119.3 (2) | C11-C10-H10B型 | 111 |
C3-C2-C1 | 119.9 (3) | C9-C10-H10B | 111 |
C3-C2-H2 | 120.1 | H10A-C10-H10B型 | 109 |
C1-C2-H2 | 120.1 | N1-C11-C12号机组 | 110.3 (3) |
C4-C3-C2型 | 121.4 (3) | N1-C11-C10 | 103.1 (3) |
C4-C3-H3型 | 119.3 | C12-C11-C10 | 110.4 (3) |
C2-C3-H3型 | 119.3 | N1-C11-H11型 | 110.9 |
C5-C4-C3型 | 117.9 (3) | C12-C11-H11型 | 110.9 |
C5-C4-C7 | 121.0(4) | C10-C11-H11号机组 | 110.9 |
C3至C4-7 | 121.1 (4) | 臭氧-C12-O3 | 124.0 (3) |
C4-C5-C6 | 122.2 (3) | O4-C12-C11型 | 124.6 (3) |
C4-C5-H5型 | 118.9 | O3-C12-C11型 | 111.4 (3) |
C6-C5-H5型 | 118.9 | C14-C13-O3型 | 109.5(3) |
C5-C6-C1 | 119.0 (3) | C14-C13-H13A | 109.8 |
C5-C6-H6 | 120.5 | O3-C13-H13A型 | 109.8 |
C1-C6-H6型 | 120.5 | C14-C13-H13B型 | 109.8 |
C4-C7-H7A型 | 109.5 | O3-C13-H13B型 | 109.8 |
C4-C7-H7B型 | 109.5 | H13A-C13-H13B型 | 108.2 |
H7A-C7-H7B型 | 109.5 | C13-C14-H14A型 | 109.5 |
C4-C7-H7C型 | 109.5 | C13-C14-H14B | 109.5 |
H7A-C7-H7C型 | 109.5 | H14A-C14-H14B | 109.5 |
H7B-C7-H7C型 | 109.5 | C13-C14-H14C | 109.5 |
N1-C8-C9型 | 103.9 (3) | H14A-C14-H14C | 109.5 |
N1-C8-H8A型 | 111 | H14B-C14-H14C型 | 109.5 |
C9-C8-H8A基因 | 111 | C11-N1-C8型 | 111.4 (2) |
N1-C8-H8B型 | 111 | C11-N1-S1型 | 121.0 (2) |
C9-C8-H8B | 111 | C8-N1-S1型 | 119.0 (2) |
H8A-C8-H8B | 109 | C12-O3-C13 | 116.4 (3) |
C8-C9-C10型 | 103.6(3) | O2-S1-O1型 | 120.37 (13) |
C8-C9-H9A型 | 111 | O2-S1-N1型 | 106.77 (15) |
C10-C9-H9A型 | 111 | O1-S1-N1型 | 106.57 (14) |
C8-C9-H9B型 | 111 | O2-S1-C1型 | 108.30 (14) |
C10-C9-H9B型 | 111 | O1-S1-C1型 | 107.48(14) |
H9A-C9-H9B | 109 | N1-S1-C1号机组 | 106.61 (12) |
C11-C10-C9 | 103.7 (3) | | |
| | | |
C6-C1-C2-C3型 | −1.2 (5) | C12-C11-N1-S1 | −111.7 (3) |
S1-C1-C2-C3型 | 176.3 (2) | C10-C11-N1-S1号机组 | 130.5 (2) |
C1-C2-C3-C4型 | 0.7 (5) | C9-C8-N1-C11 | −6.5 (3) |
C2-C3-C4-C5型 | 0.0 (6) | C9-C8-N1-S1 | −154.6 (2) |
C2-C3-C4-C7型 | −178.5 (3) | O4-C12-O3-C13 | −4.1 (6) |
C3-C4-C5-C6型 | −0.2 (6) | C11-C12-O3-C13 | 174.3 (3) |
C7-C4-C5-C6 | 178.3(4) | C14-C13-O3-C12 | 168.1 (4) |
C4-C5-C6-C1型 | −0.3 (6) | C11-N1-S1-O2 | 35.1 (3) |
C2-C1-C6-C5型 | 1.0 (5) | C8-N1-S1-O2 | −179.9 (2) |
S1-C1-C6-C5型 | −176.5 (3) | C11-N1-S1-O1型 | 164.9 (2) |
N1-C8-C9-C10 | 27.1 (3) | C8-N1-S1-O1号机组 | −50.1 (3) |
C8-C9-C10-C11号机组 | −37.9(3) | C11-N1-S1-C1 | −80.5 (2) |
C9-C10-C11-N1 | 33.4 (3) | C8-N1-S1-C1 | 64.5 (3) |
C9-C10-C11-C12 | −84.4 (4) | C2-C1-S1-O2型 | 156.1 (3) |
N1-C11-C12-O4 | −22.0 (5) | C6-C1-S1-O2 | −26.4 (3) |
C10-C11-C12-O4 | 91.3 (4) | C2-C1-S1-O1型 | 24.6 (3) |
N1-C11-C12-O3型 | 159.6 (3) | C6-C1-S1-O1 | −157.9 (3) |
C10-C11-C12-O3型 | −87.1(4) | C2-C1-S1-N1型 | −89.4 (3) |
C12-C11-N1-C8 | 100.9 (3) | C6-C1-S1-N1 | 88.2 (3) |
C10-C11-N1-C8 | −16.9 (3) | | |
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类 | D类-H(H) | H(H)···A类 | D类···A类 | D类-H(H)···A类 |
C6-H6···O2 | 0.93 | 2.59 | 2.933 (4) | 102 |
C11-H11···O2 | 0.98 | 2.55 | 2.883 (4) | 100 |
C6-H6···O1我 | 0.93 | 2.46 | 3.202(4) | 137 |
对称代码:(i)−x个+1,年+1/2,−z(z)+1/2. |