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标题化合物C7H(H)8N个4O(运行)5采用简单的羟甲基化方法,在碱性介质中与甲醛反应合成了一种潜在的抗恰加斯衍生物。该结构揭示了两个无限二维网络(\上划线{1}02)和(001)平面,由分子间氢键稳定。

支持信息

到岸价

结晶信息文件(CIF)https://doi.org/10.107/S1600536805017721/hg6183sup1.cif
包含全局数据块,2

香港特别行政区

结构系数文件(CIF格式)https://doi.org/10.107/S1600536805017721/hg61832sup2.hkl
包含数据块2

CCDC参考:277269

关键指标

  • 单晶X射线研究
  • =298千
  • 平均值[西格玛](C-C)=0.003º
  • 主要残留物紊乱
  • R(右)系数=0.039
  • 水风险系数=0.111
  • 数据与参数之比=10.3

检查CIF/PLATON结果

未发现语法错误
警报级别B 板241_ALERT_2_B检查O22与邻居相比的高Ueq
警报级别C PLAT152_警报_1_C供应和计算的体积s.u.不一致?板250_ LERT_2_C平均U(i,j)张量的大U3/U1比。。。。2.25PLAT301_警报_3_C主要残留物障碍。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。11.00百分比。PLAT779_警报_2_CCIF中可疑或无关(债券)角度。。。。。。21.60度。O12-N1-O11 1.555 1.555 1.5555PLAT779_警报_2_CCIF中可疑或无关(债券)角度。。。。。。18.80度。O21-N1-O22 1.555 1.555 1.5555
0A级警报=一般情况:严重问题1B级警报=潜在的严重问题5C级警报=检查并解释0G级警报=一般警报;检查1警报类型1 CIF结构/语法错误,数据不一致或缺失4警报类型2结构模型可能错误或有缺陷的指示器1警报类型3结构质量可能较低的指示器0警报类型4改进、方法、查询或建议

计算详细信息顶部

数据收集:收集(诺尼乌斯,1998);单元格细化:香港(HKL) 电子秤组件(Otwinowski&Minor,1997);数据缩减:香港(HKL) DENZO公司(Otwinowski&Minor 1997)和电子秤组件; 用于求解结构的程序:SHELXS97标准(Sheldrick,1997);用于优化结构的程序:货架xl97(谢尔德里克,1997);分子图形:ORTEP-3(适用于Windows)(Farrugia,1997);用于准备出版材料的软件:WinGX公司(Farrugia,1999年)。

5-硝基-2-糠醛N个-(羟甲基)氨基脲顶部
水晶数据 顶部
C类7H(H)8N个4O(运行)5F类(000)=944
M(M)第页= 228.17D类x个=1.596毫克
单诊所,C类2/c(c)K(K)α辐射,λ= 0.71073 Å
大厅符号:-C 2yc16323次反射的单元参数
= 10.3757 (5) Åθ= 2.9–27.5°
b条= 10.8125 (5) ŵ=0.14毫米1
c(c)= 16.9455 (8) Å=298千
β= 92.095 (3)°指针,黄色
V(V)= 1899.8 (2) Å0.2×0.1×0.1毫米
Z轴= 8
数据收集 顶部
Nonius KappaCCD区域探测器
衍射仪
1367次反射> 2σ()
辐射源:细焦点密封管R(右)整数= 0.036
水平安装石墨晶体单色仪θ最大值= 25.5°,θ最小值= 3.6°
探测器分辨率:9像素mm-1个小时=1212
φ扫描,以及ω使用扫描κ偏移k个=1313
13352次测量反射=2020
1755次独立反射
精炼 顶部
优化于F类2通过独立和约束精化的混合物处理的H原子
最小二乘矩阵:完整 w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.0609P(P))2+ 0.6344P(P)]
哪里P(P)========================================================(F类o个2+ 2F类c(c)2)/3
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.039(Δ/σ)最大值< 0.001
水风险(F类2) = 0.111Δρ最大值=0.18埃
S公司= 1.07Δρ最小值=0.17埃
1755次反射消光校正:SHELXL97(Sheldrick,1997),Fc*=kFc[1+0.001xFc2λ/罪(2θ)]-1/4
170个参数消光系数:0.013(2)
0个约束
特殊细节 顶部

几何图形.所有e.s.d.(两个l.s.平面之间二面角的e.s.d.除外)使用全协方差矩阵进行估计在估计e.s.d.的距离、角度时单独考虑和扭转角;e.s.d.细胞内参数之间的相关性仅为当它们由晶体对称性定义时使用。近似(各向同性)细胞e.s.d.的处理用于估计涉及l.s.的e.s.d。飞机。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个zU型国际标准化组织*/U型等式开路特性。(<1)
1个0.85510 (17)0.46319 (18)0.30115 (10)0.0687 (5)
氮气0.41500 (12)0.53080 (12)0.08495 (8)0.0481 (4)
N3号机组0.32951 (13)0.60726 (13)0.04746(9)0.0537 (4)
H3级0.33370.68590.05450.064*
4号机组0.24375 (13)0.43515 (12)0.01394 (9)0.0502 (4)
H4型0.30560.39510.00960.06*
臭氧0.68403(11)0.53924 (11)0.21938 (7)0.0522 (4)
O4号机组0.15337 (11)0.62518 (10)0.03360 (8)0.0551 (4)
O5公司0.07951 (12)0.28440 (11)0.02165 (8)0.0587 (4)
O11号机组0.8972 (16)0.369 (2)0.3360 (11)0.080 (3)0.5
O12号机组0.9298 (17)0.377 (2)0.3184 (12)0.087 (3)0.5
O21号机组0.8728 (19)0.5650 (15)0.3258 (9)0.073 (2)0.5
O22号机组0.896 (2)0.5726 (18)0.3076 (10)0.110 (5)0.5
C1类0.75064 (17)0.43960 (17)0.24722 (10)0.0535(5)
指挥与控制0.70584 (19)0.33386 (18)0.21729 (11)0.0634 (5)
氢气0.73690.25470.22790.076*
C3级0.60162(19)0.36677 (17)0.16629 (11)0.0597 (5)
H3A型0.54990.31290.13640.072*
补体第四成份0.59064 (15)0.49087 (16)0.16884 (9)0.0469 (4)
C5级0.50308 (15)0.57706 (15)0.13029 (10)0.0490 (4)
H5型0.51050.66190.13810.059*
C6级0.23621 (14)0.55693 (15)0.00192 (10)0.0450 (4)
抄送70.15416 (17)0.36740 (16)0.06393 (11)0.0530 (5)
H7A型0.09750.42520.09190.064*
H7B型0.20150.3220.10290.064*
H5A型0.012(2)0.325 (2)0.0022 (13)0.093 (8)*
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
1个0.0683 (11)0.0636 (12)0.0719 (11)0.0045 (9)0.0305(9)0.0033 (9)
氮气0.0424(7)0.0422 (8)0.0587 (8)0.0012 (6)0.0109 (6)0.0039 (6)
N3号机组0.0464 (8)0.0372 (7)0.0759 (10)0.0016 (6)0.0196 (7)0.0003 (6)
4号机组0.0420 (7)0.0384 (8)0.0690 (9)0.0002(6)0.0145 (6)0.0042 (6)
臭氧0.0506 (7)0.0455 (7)0.0591 (7)0.0005 (5)0.0171 (5)0.0027 (5)
O4号机组0.0425 (6)0.0447 (7)0.0770 (8)0.0053 (5)0.0155 (6)0.0044 (6)
O5公司0.0472 (7)0.0388 (7)0.0898 (10)0.0025 (5)0.0033 (6)0.0002(6)
O11号机组0.087 (8)0.069 (3)0.082 (6)0.015 (5)0.037 (5)0.016 (4)
O12号机组0.076 (6)0.082 (4)0.101 (9)0.014 (4)0.035 (4)0.015 (5)
O21号机组0.080 (5)0.054 (4)0.084 (3)0.008 (3)0.038 (3)0.001(2)
O22号机组0.094 (8)0.076(4)0.155 (12)0.012 (4)0.074 (8)0.007 (7)
C1类0.0533 (9)0.0517 (10)0.0543 (9)0.0050(7)0.0137 (8)0.0051 (8)
指挥与控制0.0712 (12)0.0465 (10)0.0710 (12)0.0061 (9)0.0197(10)0.0021 (9)
C3类0.0633 (11)0.0472 (10)0.0671 (11)0.0020 (8)0.0194 (9)0.0007 (8)
补体第四成份0.0430 (9)0.0503 (10)0.0468 (9)0.0041 (7)0.0080 (7)0.0013 (7)
C5级0.0448 (9)0.0431 (9)0.0582 (10)0.0023 (7)0.0101 (8)0.0010 (7)
C6级0.0361 (8)0.0402 (9)0.0581 (9)0.0001 (6)0.0053(7)0.0050 (7)
抄送70.0514 (10)0.0451 (9)0.0617 (10)0.0046 (7)0.0107 (8)0.0010 (7)
几何参数(λ,º) 顶部
N1-O21号1.190 (17)臭氧-C41.373 (2)
N1-O12号1.24 (2)O4-C6型1.240 (2)
N1-011号1.24 (2)O5-C7型1.400 (2)
第1页至第22页1.259 (19)O5-H5A型0.90 (3)
N1-C1型1.415 (2)C1-C2类1.328 (3)
N2-C5气体1.274 (2)C2-C3型1.405 (2)
氮二氮三1.354(2)C2-H2型0.93
N3-C6型1.369 (2)C3-C4型1.347 (2)
编号3-H30.86C3-H3A型0.93
N4-C6号1.335 (2)C4-C5型1.441 (2)
编号4-C71.436 (2)C5-H5型0.93
N4-H4型0.86C7-H7A型0.97
臭氧-C11.355 (2)C7-H7B型0.97
O21-N1-O12型121.6 (14)C1-C2-C3105.52 (17)
O21-N1-O11型122.7 (13)C1-C2-H2127.2
O12-N1-O11型21.6 (12)C3-C2-H2127.2
O21-N1-O22型18.8 (14)C4-C3-C2型107.25 (16)
O12-N1-O22型118.7 (14)C4-C3-H3A型126.4
O11-N1-O22号机组127.9 (13)C2-C3-H3A型126.4
O21-N1-C1型119.9(9)C3-C4-O3型109.92 (14)
O12-N1-C1型118.4 (11)C3-C4-C5型133.01 (16)
O11-N1-C1114.0(10)臭氧-C4-C5117.07 (15)
O22-N1-C1型118.1 (9)N2-C5-C4气体116.47 (15)
C5-N2-N3119.10 (14)N2-C5-H5型121.8
N2-N3-C6118.73 (13)C4-C5-H5型121.8
N2-N3-H3120.6O4-C6-N4124.36 (15)
C6-N3-H3120.6O4-C6-N3119.44 (15)
C6-N4-C7123.58 (14)N4-C6-N3号116.18 (14)
C6-N4-H4118.2O5-C7-N4型112.6 (1)
C7-N4-H4型118.2O5-C7-H7A109.1
C1-O3-C4104.69(13)N4-C7-H7A型109.1
C7-O5-H5A型109 (2)O5-C7-H7B型109.1
C2-C1-O3型112.61 (15)N4-C7-H7B型109.1
C2-C1-N1型130.62 (17)H7A-C7-H7B型107.8
臭氧-C1-N1116.76 (16)
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
N3-H3··O40.862.082.909 (2)162
N4-H4··O5ii(ii)0.862.283.047 (2)148
C2-H2··O210.932.503.10 (2)122
C2-H2··O220.932.473.04 (2)120
C3-H3型A类···O5公司ii(ii)0.932.553.446 (2)162
C5-H5··O11iv(四)0.932.483.37 (2)162
C5-H5··O12iv(四)0.932.513.42 (2)167
O5-H5型A类···O4号机组v(v)0.90 (2)1.92 (2)2.799 (2)166 (2)
对称代码:(i)x个+1/2,+3/2,z; (ii)x个+1/2,+1/2,z; (iii)x个+3/2,1/2,z+1/2;(iv)x个+3/2,+1/2,z+1/2; (v)x个,+1,z.
 

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