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标题化合物C10H(H)92从海洋的EtOAc提取物中分离并表征链霉菌属. 060524. 除甲基氢原子外,所有原子几乎都是共面的。存在分子间N-H...晶体结构中的O氢键。该化合物对K562人类慢性白血病具有细胞毒性。

支持信息

到岸价

结晶信息文件(CIF)https://doi.org/10.1107.S1600536805012109/bt6646sup1.cif
包含全局数据块,I

香港特别行政区

结构系数文件(CIF格式)https://doi.org/10.107/S1600536805011109/bt6646Isup2.hkl
包含数据块I

CCDC参考:274336

关键指标

  • 单晶X射线研究
  • T型=298千
  • 平均值[西格玛](C-C)=0.003Å
  • 系数=0.056
  • 水风险系数=0.152
  • 数据与参数之比=14.4

检查CIF/PLATON结果

未发现语法错误
警报级别C 牢房02_警报_1_C提供的电池体积s.u.与之不同根据电池参数s.u.'s计算,大于2计算单元体积su=8.88单元体积su=6.00RINTA01_ALERT_3_CRint值大于0.10给出的铃声0.146PLAT020_警报_3_CRint值大于0.10。。。。。。。。。0.15PLAT029_警报_3_C_衍射_测量_分数_高度_全低。。。。。。。0.98PLAT066_警报_1_C预测和报告的传输相同?铭牌125_警报_4_C没有给定_symmetry_space_group_name_Hall?PLAT152_警报_1_C供应和计算的体积s.u.不一致?铭牌230_铭牌_2_CC7-C8的Hirshfeld测试差异。。6.16苏
0A级警报=一般情况:严重问题0B级警报=潜在的严重问题8C级警报=检查并解释0G级警报=一般警报;检查3警报类型1 CIF结构/语法错误,数据不一致或缺失1警报类型2结构模型可能错误或有缺陷的指示器3警报类型3结构质量可能较低的指示器1警报类型4改进、方法、查询或建议

计算详细信息顶部

数据收集:智能(西门子,1996年);单元格细化:圣保罗(西门子,1996年);数据缩减:圣保罗; 用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,1997年a);用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,1997年a);分子图形:SHELXTL公司(谢尔德里克,1997年b);用于准备出版材料的软件:SHELXTL公司.

吲哚-3-羧酸甲酯顶部
水晶数据 顶部
C类10H(H)92F类(000) = 736
M(M)第页= 175.18D类x个=1.347毫克
单诊所,C类2/c(c)K(K)α辐射,λ= 0.71073 Å
= 21.382 (4) Å1009次反射的单元参数
b条= 7.4070 (15) Åθ= 2.9–26.5°
c(c)= 13.372 (3) ŵ=0.10毫米1
β= 125.34 (3)°T型=298千
V(V)= 1727.6 (6) Å无色棱镜
Z轴= 80.45×0.41×0.38毫米
数据收集 顶部
西门子SMART CCD区域探测器
衍射仪
1752独立反射
辐射源:细焦点密封管1315次反射> 2σ()
石墨单色仪整数= 0.146
φω扫描θ最大值= 26.5°,θ最小值= 2.3°
吸收校正:多扫描
(SADABS;谢尔德里克,1996年)
小时=2626
T型最小值= 0.959,T型最大值= 0.965k个=95
5009次测量反射=1616
精炼 顶部
优化于F类2主原子位置定位:结构-变量直接方法
最小二乘矩阵:完整二次原子位置:差分傅里叶映射
[F类2> 2σ(F类2)] = 0.056氢站点位置:从邻近站点推断
水风险(F类2) = 0.152受约束的氢原子参数
S公司= 1.06 w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.0677P(P))2+ 0.0691P(P)]
哪里P(P)= (F类o个2+ 2F类c(c)2)/3
1752次反射(Δ/σ)最大值< 0.001
122个参数Δρ最大值=0.34埃
1个约束Δρ最小值=0.33埃
特殊细节 顶部

几何图形.所有e.s.d.(两个l.s.平面之间二面角的e.s.d.除外)使用全协方差矩阵进行估计在估计e.s.d.的距离、角度时单独考虑和扭转角;e.s.d.细胞内参数之间的相关性仅为当它们由晶体对称性定义时使用。近似(各向同性)细胞e.s.d.的处理用于估计涉及l.s.的e.s.d。飞机。

精炼.改进F类2对抗所有反射。加权-因子水风险和贴合度S公司基于F类2,常规-因素基于F类,使用F类设置为零消极的F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算-因子(gt).并且与选择反射进行细化无关。-因素基于F类2从统计上看大约是两倍大作为那些基于F类、和-基于所有数据的系数将为甚至更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个z(z)U型国际标准化组织*/U型等式
O10.23931 (6)0.28869 (16)0.36724 (11)0.0529 (4)
氧气0.35102 (5)0.43096 (16)0.49706 (10)0.0534 (4)
N1型0.23271 (7)0.90625 (17)0.35139 (12)0.0478 (4)
C1类0.16367 (8)0.6504 (2)0.28083 (12)0.0403 (4)
指挥与控制0.15931 (8)0.8388 (2)0.27359 (13)0.0433 (4)
C3类0.09050 (9)0.9314 (3)0.19884 (15)0.0564 (5)
H3级0.08881.05690.19520.068*
补体第四成份0.02488 (10)0.8286 (3)0.13045 (17)0.0658 (5)
H4型0.02230.88590.07950.079*
C5级0.02772 (9)0.6419 (3)0.13603 (16)0.0626 (5)
人50.01780.57700.08890.075*
C6级0.09592 (8)0.5490 (3)0.20931 (14)0.0517 (4)
H6型0.09700.42340.21130.062*
抄送70.24359 (7)0.6066 (2)0.36797 (12)0.0400 (4)
抄送80.28203 (9)0.7678 (2)0.40701 (15)0.0461 (4)
H8型0.33470.77980.46390.055*
C9级0.27562 (8)0.4288 (2)0.40758 (13)0.0401 (4)
C10号机组0.38748 (10)0.2590 (2)0.54184 (19)0.0615 (5)
H10A型0.36100.18970.56710.092*
H10B型0.43980.27620.61040.092*
H10C型0.38620.19580.47800.092*
上半年0.2455 (10)1.0248 (15)0.3644 (18)0.080*
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
O10.0529 (6)0.0330 (7)0.0656 (7)0.0009 (5)0.0302 (6)0.0007 (5)
氧气0.0436 (6)0.0418 (7)0.0631 (7)0.0047 (4)0.0242 (5)0.0034 (5)
N1型0.0514 (7)0.0300 (8)0.0571 (8)0.0024 (5)0.0286 (6)0.0030 (6)
C1类0.0463 (8)0.0319 (9)0.0442 (7)0.0009 (6)0.0271 (6)0.0008 (6)
指挥与控制0.0487 (8)0.0366 (10)0.0463 (7)0.0021 (6)0.0284 (7)0.0010 (6)
C3类0.0577 (9)0.0429 (10)0.0642 (10)0.0129 (7)0.0327 (8)0.0066 (8)
补体第四成份0.0484 (9)0.0645 (15)0.0713 (11)0.0126 (9)0.0270 (8)0.0084 (10)
C5级0.0435 (8)0.0579 (13)0.0695 (10)0.0033 (8)0.0228 (8)0.0020 (10)
C6级0.0490 (8)0.0390 (10)0.0597 (9)0.0052 (7)0.0272 (7)0.0010 (7)
抄送70.0434 (7)0.0313 (8)0.0449 (8)0.0018 (6)0.0252 (6)0.0022 (6)
抄送80.0434 (7)0.0392 (10)0.0520 (8)0.0009 (6)0.0254 (7)0.0018 (6)
C9级0.0421 (7)0.0354 (8)0.0451 (7)0.0004 (6)0.0266 (6)0.0009 (6)
C10号机组0.0506 (9)0.0546 (13)0.0710 (11)0.0151 (7)0.0304 (9)0.0138 (8)
几何参数(λ,º) 顶部
O1-C9型1.2189 (18)C4-C5型1.384 (3)
氧气-C91.3415 (18)C4-H4型0.9300
氧气-C101.4312 (19)C5至C61.381 (3)
N1-C8型1.345 (2)C5-H5型0.9300
N1-C2型1.3808 (19)C6-H6型0.9300
N1-H1型0.906 (10)C7-C8号机组1.370 (2)
C1-C2类1.398 (2)C7-C91.437 (2)
C1-C6号机组1.406 (2)C8-H8型0.9300
C1-C7号机组1.4421 (19)C10-H10A型0.9600
C2-C3型1.390 (2)C10-H10B型0.9600
C3-C4型1.379 (3)C10-H10摄氏度0.9600
C3至H30.9300
C9-O2-C10116.44 (13)C5-C6-C1型117.76 (18)
C8-N1-C2型109.06 (13)C5-C6-H6121.1
C8-N1-H1型125.4 (12)C1-C6-H6型121.1
C2-N1-H1型125.5 (12)C8-C7-C9127.25 (14)
C2-C1-C6型119.04 (13)C8-C7-C1106.32 (13)
C2-C1-C7型106.33 (12)C9-C7-C1126.41 (13)
C6-C1-C7型134.64 (15)N1-C8-C7型110.36 (15)
N1-C2-C3型129.18 (16)N1-C8-H8型124.8
N1-C2-C1107.93 (12)C7-C8-H8型124.8
C3-C2-C1122.89 (14)O1-C9-O2122.29 (14)
C4-C3-C2型116.87 (18)O1-C9-C7124.85 (14)
C4-C3-H3型121.6O2-C9-C7型112.85 (13)
C2-C3-H3型121.6氧气-C10-H10A109.5
C3-C4-C5型121.32 (15)氧气-C10-H10B109.5
C3-C4-H4型119.3H10A-C10-H10B109.5
C5-C4-H4119.3氧气-C10-H10C109.5
C6-C5-C4122.12 (16)H10A-C10-H10C型109.5
C6-C5-H5型118.9H10B-C10-H10C型109.5
C4-C5-H5型118.9
C8-N1-C2-C3179.28 (14)C2-C1-C7-C8型0.25 (14)
C8-N1-C2-C10.50 (15)C6-C1-C7-C8179.87 (15)
C6-C1-C2-N1179.86 (12)C2-C1-C7-C9178.33 (13)
C7-C1-C2-N1型0.46 (12)C6-C1-C7-C91.3 (2)
C6-C1-C2-C3型0.35 (18)C2-N1-C8-C70.34 (18)
C7-C1-C2-C3179.34 (13)C9-C7-C8-N1178.62 (12)
N1-C2-C3-C4179.58 (14)C1-C7-C8-N10.05 (17)
C1-C2-C3-C4型0.2 (2)C10-O2-C9-O11.1 (2)
C2-C3-C4-C5型0.2 (2)C10-O2-C9-C7179.98 (12)
C3-C4-C5-C6型0.3 (3)C8-C7-C9-O1177.58 (14)
C4-C5-C6-C1型0.8 (2)C1-C7-C9-O14.1 (2)
C2-C1-C6-C5型0.84 (19)C8-C7-C9-O23.5 (2)
C7-C1-C6-C5178.74 (14)C1-C7-C9-O2174.74 (11)
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···D类-H(H)H(H)···D类···D类-H(H)···
N1-H1··O10.91 (1)1.96 (1)2.8381 (18)162 (2)
对称代码:(i)x个,+1,z(z).
 

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