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在标题化合物中,C6H(H)6O(运行)5,摘自白果Gaultheria leucocarpaB1 var.crenulata,不对称单元由两个几乎平行的分子组成,它们具有不同的构象,由强分子间O-H连接...O氢键。两种分子中的吡喃环都是平面的,这些平面形成的二面角为7.14(15)°。晶体填料通过O-H稳定...O分子间氢键,形成二维网络。

支持信息

到岸价

结晶信息文件(CIF)https://doi.org/10.107/S1600536805011633/dn6212sup1.cif
包含数据块I,publication_text

香港特别行政区

结构系数文件(CIF格式)https://doi.org/10.107/S1600536805011633/dn6212Isup2.hkl
包含数据块I

CCDC参考:271862

关键指标

  • 单晶X射线研究
  • T型=293千
  • 平均值[西格玛](C-C)=0.004Å
  • R(右)系数=0.061
  • 水风险系数=0.182
  • 数据与参数之比=11.6

检查CIF/PLATON结果

未发现语法错误
警报级别C 板213_ LERT_2_C原子O10具有ADP最大/最小比率。。。。。。。。。。。。。3.50伸长PLAT220_警报_2_C大型非溶剂O Ueq(最大)/Ueq。。。2.75比率铭牌222_ALERT_3_C大非溶剂H Ueq(最大)/Ueq。。。3.49比率平台250_警报2_C平均U(i,j)张量的大U3/U1比。。。。2.87平台250_警报2_C平均U(i,j)张量的大U3/U1比。。。。3.66
0A级警报=一般情况:严重问题0B级警报=潜在的严重问题5C级警报=检查并解释0G级警报=一般警报;检查0警报类型1 CIF构造/语法错误,数据不一致或缺失4警报类型2结构模型可能错误或有缺陷的指示器1警报类型3结构质量可能较低的指示器0警报类型4改进、方法、查询或建议

计算详细信息顶部

数据收集:聪明的(布鲁克,2000年);单元格细化:聪明的; 数据缩减:圣保罗SHELXTL公司(布鲁克,2000年);用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,1997);用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,1997);分子图形:'ORTEPIII公司(伯内特和约翰逊,1996),ORTEP-3(适用于Windows)(Farrugia,1997)卡梅隆(沃特金等。, 1993) '; 用于准备出版材料的软件:SHELXTL公司(布鲁克,2000年)。

3,5-二羟基-2-羟甲基-4H(H)-吡喃-4-酮顶部
水晶数据 顶部
C类6H(H)6O(运行)5Z轴= 4
M(M)第页= 158.11F类(000) = 328
三联诊所,P(P)1D类x个=1.689毫克
大厅符号:-P 1熔点:460 K
= 8.2045 (9) ÅK(K)α辐射,λ= 0.71073 Å
b条= 8.9704 (10) Å1957年反射的电池参数
c(c)= 9.6826 (10) Åθ= 4.9–56.1°
α= 93.026 (2)°µ=0.15毫米1
β= 109.337 (2)°T型=293千
γ= 109.787 (2)°平板,无色
V(V)= 621.71 (12) Å0.51×0.50×0.39毫米
数据收集 顶部
Bruker SMART CCD区域探测器
衍射仪
2387次独立反射
辐射源:细焦点密封管2007年反思> 2σ()
石墨单色仪R(右)整数= 0.063
φω扫描θ最大值= 26.0°,θ最小值= 2.3°
吸收校正:多扫描
(SADABS;Sheldrick,1996)
小时=810
T型最小值= 0.914,T型最大值= 0.939k个=1111
3405次测量反射=1011
精炼 顶部
优化于F类2主原子位置定位:结构-变量直接方法
最小二乘矩阵:完整二次原子位置:差分傅里叶映射
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.061氢站点位置:从邻近站点推断
水风险(F类2) = 0.182受约束的氢原子参数
S公司= 1.08 w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.1098P(P))2+ 0.1959P(P)]
哪里P(P)= (F类o个2+ 2F类c(c)2)/3
2387次反射(Δ/σ)最大值< 0.001
205个参数Δρ最大值=0.55埃
0个约束Δρ最小值=0.39埃
特殊细节 顶部

几何图形.所有e.s.d.(两个l.s.平面之间二面角的e.s.d.除外)使用全协方差矩阵进行估计在估计e.s.d.的距离、角度时单独考虑和扭转角;e.s.d.细胞内参数之间的相关性仅为当它们由晶体对称性定义时使用。近似(各向同性)细胞e.s.d.的处理用于估计涉及l.s.的e.s.d。飞机。

精炼.改进F类2对抗所有反射。加权R(右)-因子水风险和贴合度S公司基于F类2,常规R(右)-因素R(右)基于F类,使用F类设置为零消极的F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算R(右)-因子(gt).并且与选择反射进行细化无关。R(右)-因素基于F类2从统计上看大约是两倍大作为那些基于F类、和R(右)-基于所有数据的系数将为甚至更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个z(z)U型国际标准化组织*/U型等式
O1公司1.0093 (2)0.58572 (19)0.80116 (18)0.0395 (4)
氧气1.4542 (2)0.5796 (2)0.83150 (19)0.0435 (5)
氢气1.47740.51070.79140.065*
臭氧1.2114 (2)0.33178 (19)0.59512 (18)0.0412 (4)
第4页0.8319 (2)0.25457 (19)0.49931 (17)0.0397 (4)
H4型0.88930.21140.46760.059*
O5公司0.6403 (2)0.41613 (19)0.77607 (18)0.0401 (4)
H5型0.60830.31990.78000.060*
O6公司0.8723 (2)0.15192 (19)0.90459 (18)0.0397 (4)
O7公司1.3335 (2)0.1999 (2)0.9222 (2)0.0567 (6)
H7型1.38320.26591.00020.085*
O8号机组1.1186 (2)0.0459 (2)0.68921 (19)0.0447 (5)
O9号机组0.7316 (2)0.1598 (2)0.5973 (2)0.0497 (5)
H9型0.79390.18730.55790.075*
O10号机组0.5079 (3)0.0972 (3)0.7481 (5)0.1091 (12)
H10型0.40370.06550.75230.164*
C1类1.1945 (3)0.6202 (3)0.8477 (3)0.0380 (6)
上半年1.27440.70400.92780.046*
指挥与控制1.2670 (3)0.5386 (2)0.7830 (2)0.0308 (5)
C3类1.1486 (3)0.4085 (2)0.6583 (2)0.0286 (5)
补体第四成份0.9531 (3)0.3751 (2)0.6146 (2)0.0288 (5)
C5级0.8897 (3)0.4626 (3)0.6857 (2)0.0323 (5)
C6级0.6914 (3)0.4430 (3)0.6508 (2)0.0378 (5)
H6A型0.67430.53930.61920.045*
H6B型0.61070.35270.56930.045*
抄送71.0597 (3)0.2074 (3)0.9482 (2)0.0388 (6)
H7A型1.13120.29231.02880.047*
抄送81.1469 (3)0.1460 (3)0.8812 (2)0.0348 (5)
C9级1.0438 (3)0.0151 (2)0.7552 (2)0.0317 (5)
C10号机组0.8451 (3)0.0382 (2)0.7131 (2)0.0322 (5)
C11号机组0.7673 (3)0.0297 (3)0.7863 (3)0.0357 (5)
第12项0.5636 (3)0.0203 (3)0.7497 (4)0.0617 (9)
H12A型0.49790.09040.65270.074*
H12B型0.53050.08250.82210.074*
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
O1公司0.0219 (8)0.0429 (9)0.0421 (9)0.0069 (6)0.0067 (7)0.0144 (7)
氧气0.0190 (8)0.0454 (10)0.0487 (10)0.0056 (7)0.0027 (7)0.0218 (7)
臭氧0.0270 (8)0.0439 (9)0.0407 (9)0.0092 (7)0.0061 (7)0.0167 (7)
第4页0.0217 (8)0.0407 (9)0.0378 (9)0.0029 (6)0.0006 (6)0.0155 (7)
O5公司0.0266 (8)0.0422 (9)0.0482 (9)0.0090 (7)0.0152 (7)0.0007 (7)
第6页0.0229 (8)0.0383 (9)0.0458 (9)0.0047 (6)0.0081 (7)0.0137 (7)
O7公司0.0188 (8)0.0720 (13)0.0519 (11)0.0001 (8)0.0033 (7)0.0296 (9)
O8号机组0.0258 (8)0.0430 (9)0.0520 (10)0.0045 (7)0.0110 (7)0.0169 (8)
O9号机组0.0222 (8)0.0477 (10)0.0545 (11)0.0004 (7)0.0030 (7)0.0288 (8)
O10号机组0.0375 (12)0.0441 (12)0.260 (4)0.0178 (9)0.0694 (18)0.0316 (16)
C1类0.0221 (10)0.0392 (12)0.0384 (12)0.0037 (9)0.0051 (9)0.0151 (9)
指挥与控制0.0176 (9)0.0314 (10)0.0311 (10)0.0016 (8)0.0035 (8)0.0065 (8)
C3类0.0224 (10)0.0285 (10)0.0274 (10)0.0045 (8)0.0065 (8)0.0024 (8)
补体第四成份0.0199 (10)0.0291 (10)0.0261 (10)0.0022 (8)0.0033 (8)0.0034 (8)
C5级0.0222 (10)0.0336 (11)0.0303 (11)0.0036 (8)0.0050 (8)0.0035 (8)
C6级0.0220 (10)0.0462 (13)0.0383 (12)0.0105 (9)0.0067 (9)0.0024 (10)
抄送70.0226 (11)0.0404 (12)0.0364 (12)0.0021 (9)0.0031 (9)0.0112 (10)
抄送80.0191 (10)0.0379 (12)0.0321 (11)0.0014 (8)0.0025 (8)0.0068 (9)
C9级0.0232 (10)0.0299 (10)0.0331 (11)0.0054 (8)0.0056 (8)0.0026 (8)
C10号机组0.0214 (10)0.0271 (10)0.0341 (11)0.0025 (8)0.0017 (8)0.0065 (8)
C11号机组0.0229 (11)0.0287 (10)0.0424 (12)0.0054 (8)0.0026 (9)0.0071 (9)
第12项0.0234 (12)0.0423 (14)0.100 (2)0.0071 (10)0.0091 (13)0.0191 (14)
几何参数(λ,º) 顶部
O1-C1型1.349 (3)O10-H10型0.8200
O1-C5型1.357 (2)C1-C2类1.333 (3)
氧气-C21.355 (2)C1-H1型0.9300
氧气-氢气0.8200C2-C3型1.438 (3)
臭氧-C31.232 (2)C3-C4型1.433 (3)
O4-C41.347 (2)C4-C5型1.348 (3)
O4-H4型0.8200C5至C61.492 (3)
O5-C6型1.416 (3)C6-H6A型0.9700
O5-H5型0.8200C6-H6B型0.9700
O6-C7型1.349 (2)C7-C8号机组1.331 (3)
O6-C11型1.353 (3)C7-H7A型0.9300
O7-C8型1.346 (3)C8-C9型1.440 (3)
O7-H7型0.8200C9-C10型1.436 (3)
O8-C9型1.239 (3)C10-C11号机组1.342 (3)
O9-C10型1.344 (2)C11-C12号机组1.484 (3)
O9-H9型0.8200C12-H12A型0.9700
O10-C12型1.283 (3)C12-H12B型0.9700
C1-O1-C5119.87 (17)C5-C6-H6A109.3
C2-O2-H2109.5O5-C6-H6B型109.3
C4-O4-H4型109.5C5-C6-H6B型109.3
C6-O5-H5109.5H6A-C6-H6B型108
C7-O6-C11型118.86 (17)C8-C7-O6型122.97 (18)
C8-O7-H7型109.5C8-C7-H7A型118.5
C10-O9-H9号机组109.5O6-C7-H7A型118.5
C12-O10-H10型109.5C7-C8-O7型124.02 (19)
C2-C1-O1型122.39 (19)C7-C8-C9121.12 (19)
C2-C1-H1型118.8O7-C8-C9型114.85 (19)
O1-C1-H1型118.8O8-C9-C10型123.02 (19)
C1-C2-O2120.35 (18)O8-C9-C8型123.48 (19)
C1-C2-C3120.67 (19)C10-C9-C8号机组113.50 (19)
氧气-C2-C3118.96 (18)C11-C10-O9型118.14 (19)
臭氧-C3-C4122.93 (18)C11-C10-C9121.95 (19)
臭氧-C3-C2122.27 (18)O9-C10-C9号机组119.91 (19)
C4-C3-C2型114.80 (18)C10-C11-O6型121.58 (19)
O4-C4-C5型119.97 (18)C10-C11-C12号机组124.8 (2)
O4-C4-C3型118.79 (17)O6-C11-C12型113.6 (2)
C5-C4-C3121.24 (18)O10-C12-C11型114.2 (2)
C4-C5-O1型121.01 (19)O10-C12-H12A型108.7
C4-C5-C6126.97 (19)C11-C12-H12A型108.7
O1-C5-C6型112.01 (18)O10-C12-H12B型108.7
O5-C6-C5型111.42 (17)C11-C12-H12B型108.7
O5-C6-H6A型109.3H12A-C12-H12B型107.6
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···D类-H(H)H(H)···D类···D类-H(H)···
O2-H2··O50.821.852.597 (2)151
O2-H2··O30.822.352.756 (2)112
O4-H4··O8ii(ii)0.822.042.765 (2)148
O4-H4··O30.822.332.755 (2)113
O5-H5··O100.821.852.657 (3)168
O7-H7··O20.821.852.655 (2)167
O9-H9···O3ii(ii)0.821.902.614 (2)146
O9-H9··O80.822.372.784 (2)112
O10-H10···O8iv(四)0.822.062.849 (2)161
O10-H10···O7iv(四)0.822.322.839 (3)122
对称代码:(i)x个+1,,z(z); (ii)x个+2,,z(z)+1; (iii)x个+3,+1,z(z)+2; (iv)x个1,,z(z).
 

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