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β-苦瓜素(M(M)第页≃29 kDa)是一种单链核糖体激活蛋白(RIP),带有与Asn51结合的支链六糖。用分子置换法测定了β-莫诺肝素的晶体结构,并将其精确到2.55º分辨率。最终的结构模型给出了R(右)因子为17.2%,与理想键长和键角的平方根偏差分别为0.016º和1.76°。β-莫诺肝素含有九个α-螺旋,两个310螺旋和三个β-片,其整体结构与其他单链RIP相似。残基Tyr70、Tyr109、Glu158和Arg161有望将β-莫莫肝素的活性位点定义为rRNA N-糖苷酶。低聚糖通过N-糖苷键β-GlcNAc–(1)与蛋白质连接-N个)-Asn51,并从远离活性位点的N末端结构域表面延伸,这表明它不应在酶功能中发挥作用。每个β-莫莫肝素分子的低聚糖通过氢键与蛋白质相互作用,尽管在晶体中,大多数是与相邻单元细胞中的蛋白质原子的分子间相互作用。这是RIP结构的第一个例子,它提供了有关RIP活性链中低聚糖的三维结构和结合位点的信息。

支持信息

PDB参考:β-莫诺肝素,1cf5

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