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像所有人一样c(c)-型溶菌酶,虹鳟鱼的溶菌酶作为1,4-β-乙酰基-尿嘧啶酶,通过切割交替的多糖链来破坏细菌N个-乙酰氨基葡萄糖(NAG)和N个-细胞壁中的乙酰氨基甲酸(NAM)单位。溶菌酶还水解甲壳素,甲壳素类似物N个-乙酰氨基葡萄糖聚合物。虹鳟鱼酶已被证明在细菌防御方面特别有效。我们测定了虹鳟溶菌酶(RBTL)和壳寡糖(NAG)之间三种配合物的晶体结构2,(NAG)和(NAG)4分辨率分别为1.8、2.0和1.6Ω。通过共结晶获得这些配合物的晶体,并在FAST面积检测系统上收集强度数据。最终进行了改进和建模R(右)二糖、三糖和四糖复合物的值分别为16.6%、15.9%和16.5%。结果表明,壳寡糖与位点结合A类,B类C类如之前观察到的鸡蛋白溶菌酶(HEWL)与多种糖之间的复合物。现场NAG环D类没有如此深的结合,只是轻微地向半椅子构象变形,如HEWL中观察到的等效NAM残基。从我们的结果来看,有理由质疑D类糖与两种糖的结合方式及其在位点中的重要性E类F类正确定位糖D类以及有效水解生产性底物-溶菌酶复合物。从我们的结构进行的简单模型构建研究表明,(NAG)的“左侧”绑定模式6RBTL活性部位下部。

支持信息

PDB参考:100万;1百万英镑;1平方米

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