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这个大肠杆菌蛋白WrbA是一种FMN依赖的NAD(P)H:醌氧化还原酶,在新的条件下,在FAD或天然辅因子FMN的存在下结晶。用FAD形成的缓慢生长的深黄色晶体显示出WrbA典型的四方双锥形状,并衍射到1.2欧决议,最高的报告。由FMN形成的快速生长的深黄色晶体显示出非典型形状,但衍射仅为~1.6这里不再进一步分析。1.2版这里详细描述的光学分辨率结构显示活性位点中只有FMN,没有能够容纳FAD缺失部分的电子密度。非常高的分辨率支持了FMN异柳氮嗪的建模,它具有较小但明显的螺旋桨扭曲,这显然是对这种预测构象的首次实验观察,这种构象似乎是由蛋白质通过氢键网络实现的。扭曲的异恶嗪环的电子密度与QM/MM模拟结果的比较与氧化还原态相一致。质谱证实,极高的分辨率还支持Met10作为亚砜的独特精制。键长、分子内距离以及氢键供体和受体的模式表明辅因子可能与Met10相互作用。FMN是FAD库存中的一种微量污染物,其缓慢并入生长晶体可能是近原子分辨率的原因,但不能排除FMN和/或Met10亚砜构象的直接影响。

支持信息

PDB参考:WrbA,3zho公司


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