人类上游结合因子（hUBF）中的第五个HMG-box结构域有助于RNA聚合酶I（Pol I）合成rRNA。用单波长反常色散法（SAD）求解了该蛋白的2.0μl分辨率晶体结构。C的晶体结构和报告的核磁共振结构的r.m.s.偏差为2.18–3.03Ωα原子。然而，这两个结构之间存在显著差异，位移高达9.0º。与其他HMG-box结构相比，C的均方根偏差αhUBF HMG盒5和HMG畴之间的原子黑腹果蝇蛋白质D和褐家鼠HMG1分别为1.5º和1.6º。这表明hUBF HMG盒5的晶体结构和核磁共振结构之间的差异大于其同源结构。这两种结构之间的差异可能反映了具有不同结构的两种状态。用超灵敏差示扫描量热法和化学位移微扰法研究了hUBF HMG盒5与TBP-相关因子1（TAF1）的第一溴代主之间的特异性相互作用。基于这些实验数据，提出了hUBF HMG盒5中可能与TAF1的第一溴代主胺相互作用的位点。
