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α-淀粉酶是α-葡聚糖代谢中的必需酶,可催化长糖聚合物如直链淀粉和淀粉的水解。一种先前未鉴定的高温生物淀粉酶(AmyC)的晶体结构海洋热藻通过MAD在2.2°分辨率下测定。AmyC与属于糖基水解酶家族13、70和77的典型α-淀粉酶缺乏序列相似性,但与COG1543中一组尚未表征的蛋白质有显著相似性,并且与甘油水解酶系列57(GH-57)有关。AmyC揭示了α-淀粉酶的特征,如由七条β链和α-螺旋(结构域a)形成的扭曲TIM桶状结构,以及两个额外但不太保守的结构域。后者是B结构域,包含插入β-表2后TIM相关性中的三条螺旋,C结构域是C末端的五条螺旋区域。有趣的是,尽管序列同源性适中,但结构比较显示与已知三维结构的GH-57成员有显著相似性,立陶宛热球菌4-葡聚糖转移酶,与功能未知的酶的结构有更高的相似性嗜热Thermus thermophilus。

支持信息

PDB参考:AmyC,2b5d,r2b5dsf


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