焦磷酸异戊烯酯（IPP）是普遍存在的类异戊二烯的通用构建块，对所有生物都至关重要。IPP合成的非甲羟戊酸途径的酶是许多病原菌所特有的，最近已被探索为抗生素开发的靶点。2的几种晶体结构C类-甲基-天-据报道，赤藓糖醇-2,4-环磷酸（MECDP）合酶是参与IPP合成的非甲羟戊酸途径的七种酶中的第五种；然而，活性中心中金属离子的组成以及沿非晶体学三重对称轴存在的疏水空穴在所报道的结构之间有所不同。这里，MEDCP的结构来自欧氏Shewanella oneidensis在无底物的情况下，测定MR1（SO3437）的分辨率为1.6º。锌反常衍射证实活性位点间隙中存在锌离子，由两个组氨酸侧链、一个天冬氨酸侧链和一个模糊的第四配体四面体配位。根据异常衍射数据和典型金属-配体键长的分析，得出八面体钠离子与锌离子的距离为3.94º的结论。沿着三重非晶体学对称轴观察到一个疏水空腔，由定义明确的非蛋白电子密度填充，该电子密度可以被模拟为IPP的下游产物法尼基焦磷酸（FPP），这表明可能存在酶调节的反馈机制。与先前报道的结构相比，高分辨率数据澄清了FPP结合模式。多重序列比对表明，大多数MEDCP合成酶酶中存在对形成疏水腔和协调FPP焦磷酸基团至关重要的残基，支持与MEDCP合酶同系物亚家族中FPP结合相关的特殊生物功能的观点。
