Hierarchical analysis of promolecular full electron-density distributions: description of protein structure fragments

Leherte, L.

doi:10.1107/S0907444904011035

前分子全电子密度分布的层次分析：蛋白质结构片段的描述

一种理论方法被应用于描述蛋白质结构的层次相关子结构。该方法基于在不同平滑度下建立的前分子电子密度（ED）分布中局部最大值（峰值）的位置。使用前分子原子壳层近似（PASA）表示生成前分子ED分布，或使用Cromer-Mann系数计算ED。对天然和假设的延伸构象中蛋白质结构的分解模式的分析表明，无论氨基酸残基在蛋白质序列中的位置、蛋白质构象和晶体堆积的影响如何，它们都具有相似的分解模式。提出了利用模型构建工具从衍射数据确定蛋白质结构的链接。

关键词：前分子电子密度;散射因子;低分辨率;层次分解;蛋白质片段.

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