Structure of an RNA duplex with an unusual G·C pair in wobble-like conformation at 1.6 Å resolution

Perbandt, M.; Vallazza, M.; Lippmann, C.; Betzel, Ch.; Erdmann, V.A.

doi:10.1107/S0907444900017042

具有异常G·C对的RNA双链的结构，在1.6°分辨率下呈摆动状构象

M.Perbandt先生,M.Vallazza先生,C.李普曼,C.贝策尔和V.A.埃尔德曼

RNA双链r（CUGGGCGG）·r（CCGCCUGG）的结构已在1.6°分辨率下测定，并细化至最终R（右）系数为18.3%(R（右）_自由的 = 24.1%). RNA片段的序列类似于黄栖热菌5S rRNA。发现了一种以前未描述的类摆动G·C碱基形成。由于观察到氢键网络，建议胞嘧啶在N3位置质子化。不寻常的基面形成可能是由分子间相互作用引起的。在这种情况下，晶体堆积和特定的分子间接触可能对三维结构有直接影响。此外，这种结构包括两个串联构象的G·U摆动碱基对，嘌呤形成所谓的“交叉链G堆叠”。

关键词：5S rRNA；域E；非Watson Crick；摆动碱基对.

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NDB参考：r（CUGGGCGG）·r（CCGCCUGG），AR0012

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