通过使用S100B蛋白的结构进行分子替换，测定了钙结合形式的人EF-hand钙结合蛋白S100A12的晶体结构，分辨率为1.95μ。S100家族成员与钙调素和其他相关EF-手钙结合蛋白同源。与大多数S100蛋白一样，S100A12是一种二聚体，两个亚基之间的界面主要由疏水残基组成。除了两个EF-hand基序之间的连接区外，S100A12的折叠与S100蛋白的其他已知晶体和溶液结构相似。S100家族成员之间的序列和结构比较表明，S100A12中的靶结合区是由一个亚单位的连接区和C末端残基以及二聚体的另一亚单位的N末端残基形成的。靶结合位点的N末端区域包括两个在大多数S100序列中保守的谷氨酸盐。这一比较还提供了对亚单元内和亚单元间疏水相互作用重要的残基作用的更好理解。S100A12在细胞行为中的确切作用尚不明确，整个家族的情况也是如此，尽管已经表明S100A11与RAGE受体的相互作用与炎症反应有关。
