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一水合硫酸链霉菌素{系统名称:1,1′-[(1S公司,3,4S公司,6)-2,4,5,6-四羟基环己烷-1,3-二烷基]硫酸二胍一水合物},C8H(H)20N个6O(运行)42+·SO公司42−·H(H)2O、 在100(2)K时,成分以氢键为基础排列成双螺旋。一个螺旋含有链霉菌阳离子,另一个螺旋包含无序硫酸盐阴离子和溶剂水分子。螺旋通过O-H连接成三维氢键网络...O和N-H...O氢键。

支持信息

到岸价

结晶信息文件(CIF)https://doi.org/10.107/S0108270109015650/gd3283sup1.cif
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结构系数文件(CIF格式)https://doi.org/10.107/S010827010915650/gd3283Isup2.hkl
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CCDC参考:742182

注释顶部

链霉素{N个,N个'''-[(1S公司,3,4S公司,6)-2,4,5,6-四羟基环己烷-1,3-二基]二胍}是氨基糖苷类抗生素如链霉素、二氢链霉素和蓝霉素。链霉素是环己烷的衍生物,被取代具有四个羟基和两个碱性胍基团被证明是八个人之一中尺度的的形式1,3-二胍基-2,4,5,6-四羟基环己烷(卡特等。,1947).链霉素引起的坂口反应由链霉素引起,当胍基在碱性溶液中形成强烈的红色时用…处理α-萘酚和次氯酸钠;这是一个定性测试精氨酸,无论是游离的还是在蛋白质中结合的。电测法盐酸链霉素的滴定表明它是一种很强的碱(油炸等。, 1946).

Streptidine是一种“诱饵受体”,可使链霉素恢复抵抗大肠杆菌拉紧氨基糖苷修饰酶6的过度表达-O(运行)-腺苷酸转移酶。这可能是设计更多氨基糖苷修饰酶的有效“诱饵受体”(拉托尔et(等)阿尔。, 2007). 链霉素是一种代谢物,但不是抗生素自身。是长期使用抗生素后耳毒性的潜在因素因为它是内耳的损伤剂(梅扎&格拉纳多斯,2005年)。该化合物的唯一先前结构研究雇佣X射线粉末衍射(Rose,1954)。这里,我们报告一个单晶学习100 K下标题化合物(I)(图1)的含量。

(I)的硫酸盐阴离子带双电荷,但水分子不带双电荷质子化。晶体结构的计量学要求链霉菌阳离子携带两个正电荷,位于胍基。这些群体的平面性及其相对紧密性硫酸根阴离子表明它们实际上必须被质子化。这个硫酸根阴离子在两组原子位置上无序,占据率为0.795(4)和0.205(5)。

中心环己烷环采用经典的椅子构象。所有H原子占据轴向位置,而羟基和质子化胍基团占据赤道位置。链霉菌肽以阳离子形式存在质子化在C上两个胍片段中的NH N原子。相同的链霉素肟的晶体结构中发现质子化类型四水硒酸盐(奈德尔等。, 1978). 根据这个结果,这个C-NH上的质子化2拉托雷提出的streptidine组等。(2007)似乎不正确。

在两个胍部分中,N原子都具有平面几何结构。C-N键长度范围为1.320–1.347º,介于两倍(1.28º;标准值参考?)和单个(1.47º;参考标准值?)键,表示双原子的离域C类N键超过所有三个C-N键。两个胍基,N1–N3/C7和N4–N6/C8的平面度分别在0.003(3)和0.006(3)°以内。这个中心环己烷环(C1–C6)和胍部分为112.3(1)(N1–N3/C7平面)和100.8(1)°(N4–N6/C8)。为了进行比较,链霉素中各自的二面角四水硒酸肟为97.5°和109.2°(奈德等。,1978).

(I)的晶体结构由N-H··O和O-H··O氢稳定键和静电相互作用。分子排列成双基于氢键的螺旋,其中一个是链霉菌阳离子,第二个是链球菌阳离子硫酸盐阴离子和水分子(图2)。螺旋线之间,O-H··O和N-H··O氢键发生,三维氢键结合网络是通过整个晶体结构建立起来的。氢键将硫酸盐阴离子、链霉素阳离子和水分子连接起来总结如表1所示,如图3所示。所有氢的几何形状债券在可接受的范围内(Desiraju&Steiner,1999)。这个链霉菌属阳离子参与156[15 ?]O-H··O和N-H··O型,具有相邻的链霉菌阳离子(三键)、水分子(两个键)和硫酸根离子(十个键)。硫酸盐阴离子接受八个氢键来自链肽阳离子,一个氢键来自水分子。最后,水分子涉及四个O-H··O键,两个一个链霉菌阳离子作为受体,两个链霉菌阴离子作为受体捐赠者。链霉素阳离子中没有分子内氢键。

实验顶部

链霉菌素晶体是在试图使分子结晶时获得的硫酸链霉素与-磺基杯[4]芳烃水溶液[请简要说明数量、反应条件等].由于链霉素的酸性水解链霉素和双氢链球菌胺,而不是所需的复合物获得了一水硫酸链霉菌素晶体(I)。

精炼顶部

由于硫酸盐阴离子的几何形状不太令人满意,SADI指令在里面SHELXL公司程序的应用是为了使键长合理化。次成分氧原子的各向异性位移参数无序阴离子与主离子的相应原子保持一致组件。所有的H原子都位于差异图中。连接到C原子上的H原子是然后被视为处于几何计算位置的骑乘原子,C-H=1.00º,以及U型国际标准化组织(H) =1.5U型等式(C) ●●●●。对于与N键合的H原子或O原子,用U型国际标准化组织(H)=1.2U型等式(N) 和1.5U型等式(O) ,给出范围内的距离N-H=0.79(4)–0.94(4)奥,O-H=0.78(5)–0.93(5)奥。弗里德尔对立双方保持一致,高射炮的价值x个参数(Flack,1983)证实,太空小组P(P)2.

计算详细信息顶部

数据收集:收集(诺尼乌斯,1998);单元格细化:DENZO公司(Otwinowski&Minor 1997)和电子秤组件(Otwinowski&Minor)1997); 数据缩减:DENZO公司(Otwinowski&Minor 1997)和电子秤组件(Otwinowski&Minor,1997); 用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008);用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008);分子图形:ORTEP-3公司(Burnett&Johnson,1996);用于准备出版材料的软件:公共CIF(Westrip,2009)。

数字顶部
[图1] 图1。(I)的分子结构,显示了原子标记方案。仅限显示了硫酸根阴离子的主要成分。位移椭球为以50%的概率水平绘制,H原子显示为任意半径。
[图2] 图2。链肽鎓阳离子的双螺旋排列(白色),硫酸盐阴离子(灰色)和水分子(黑色)围绕32晶体轴。
[图3] 图3。(I)沿着c(c)轴,显示氢键以虚线表示。水分子被表示为球体。
{[(1S公司,3,4S公司,6)-2,4,5,6-四羟基环己烷-1,3-二酰]二氨基}双(氨甲亚胺)硫酸盐一水合物顶部
水晶数据 顶部
C类8H(H)20N个6O(运行)42+·SO公司42·H(H)2O(运行)D类x个=1.614毫克米
M(M)第页= 378.38Kα辐射,λ= 0.71073 Å
三角,P(P)21276次反射的单元参数
大厅符号:P 32θ= 2.6–27.5°
= 9.1105 (5) ŵ=0.27毫米1
c(c)= 16.2506 (7) ÅT型=100 K
V(V)= 1168.1 (1) Å三角金字塔,无色
Z轴= 30.50×0.40×0.35毫米
F类(000) = 600
数据收集 顶部
Nonius Kappa APEXII公司
衍射仪
2547次反射> 2σ()
辐射源:细焦点密封管整数= 0.028
石墨单色仪θ最大值= 27.5°,θ最小值= 2.9°
探测器分辨率:8.3像素mm-1小时=1111
ϕω扫描k个= 011
4125次测量反射=1521
2645个独立反射
精细化 顶部
优化于F类2氢站点位置:geom和difmap
最小二乘矩阵:完整用独立和约束精化的混合物处理H原子
[F类2> 2σ(F类2)] = 0.046 w个= 1/[σ2(F类o(o)2) + (0.0172P(P))2+ 2.4698P(P)]
哪里P(P)= (F类o(o)2+ 2F类c(c)2)/3
加权平均值(F类2) = 0.100(Δ/σ)最大值= 0.002
S公司= 1.05Δρ最大值=0.67埃
2645次反射Δρ最小值=0.59埃
279个参数消光校正:SHELXL97型(谢尔德里克,2008),Fc*=kFc[1+0.001xFc2λ/罪(2θ)]-1/4
29个约束消光系数:0.007(2)
主原子位置定位:结构-变量直接方法绝对结构:Flack(1983)
二次原子位置:差分傅里叶映射绝对结构参数:0.08(12)
水晶数据 顶部
C类8H(H)20N个6O(运行)42+·SO公司42·H(H)2O(运行)Z轴= 3
M(M)第页= 378.38Kα辐射
三角,P(P)2µ=0.27毫米1
= 9.1105 (5) ÅT型=100 K
c(c)= 16.2506 (7) Å0.50×0.40×0.35毫米
V(V)= 1168.1 (1) Å
数据收集 顶部
Nonius Kappa APEXII公司
衍射仪
2547次反射> 2σ()
4125次测量反射整数= 0.028
2645个独立反射
精细化 顶部
[F类2> 2σ(F类2)] = 0.046用独立和约束精化的混合物处理H原子
水风险(F类2) = 0.100Δρ最大值=0.67埃
S公司= 1.05Δρ最小值=0.59埃
2645次反射绝对结构:Flack(1983)
279个参数绝对结构参数:0.08(12)
29个约束
特殊细节 顶部

几何图形.所有esd(两个l.s.平面之间二面角中的esd除外)使用全协方差矩阵进行估计在估计esd的距离、角度时单独考虑和扭转角;细胞参数中esd之间的相关性仅为当它们由晶体对称性定义时使用。近似(各向同性)细胞esd的处理用于估计涉及l.s.平面的esd。

精炼.F的细化2对抗所有反射。加权R系数wR和拟合优度S基于F2,基于传统R系数R在F上,对于负F,F设置为零2。的阈值表达式F类2>2西格玛(F2)仅用于计算R系数(gt)等与优化反射的选择无关。基于R因素在F上2在统计学上大约是基于F和R的值的两倍-基于所有数据的因素将更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个z(z)U型国际标准化组织*/U型等式开路特性。(<1)
C1类0.4926 (5)0.4670 (4)0.8515 (2)0.0173 (7)
上半年0.46850.55430.87500.021*
指挥与控制0.6612 (5)0.5597 (5)0.8052 (2)0.0184 (7)
氢气0.69290.47530.78540.022*
C3类0.6461 (4)0.6551 (4)0.7317 (2)0.0145 (7)
H3级0.61470.73940.75210.017*
补体第四成份0.5089 (4)0.5338 (5)0.6728 (2)0.0165 (7)
H4型0.53620.44600.65340.020*
C5级0.3393 (4)0.4481 (4)0.7193 (2)0.0160 (7)
H5型0.31170.53660.73710.019*
C6级0.3447 (5)0.3514 (5)0.7950 (3)0.0186 (8)
H6型0.36470.25870.77540.022*
抄送70.5080 (4)0.4061 (5)0.9983 (2)0.0177 (7)
抄送80.9247 (5)0.9068 (5)0.7015 (3)0.0206 (8)
O1公司0.7849 (4)0.6716 (3)0.86210 (18)0.0229 (6)
上半年0.874 (7)0.684 (6)0.852 (3)0.034*
氧气0.5009 (3)0.6269 (3)0.60419 (19)0.0217 (6)
0.452 (7)0.553 (7)0.566 (3)0.033*
臭氧0.2097 (3)0.3318 (3)0.66622 (18)0.0232 (6)
H3O公司0.141 (7)0.365 (6)0.659 (3)0.035*
O4号机组0.1874 (4)0.2743 (3)0.83795 (19)0.0242 (6)
H4O型0.178 (7)0.348 (7)0.853 (3)0.036*
N1型0.5027 (5)0.3684 (4)0.9196 (2)0.0230 (7)
甲型H1A0.509 (6)0.267 (6)0.902 (3)0.028*
氮气0.5040 (6)0.5414 (5)1.0236 (3)0.0333 (9)
过氧化氢0.510 (7)0.639 (7)0.992 (3)0.040*
过氧化氢0.516 (7)0.566 (7)1.079 (3)0.040*
N3号机组0.5165 (4)0.3002 (4)1.0542 (2)0.0202 (7)
H3A型0.503 (6)0.206 (6)1.036 (3)0.024*
H3B型0.496 (6)0.309 (6)1.110 (3)0.024*
4号机组0.8068 (4)0.7456 (4)0.6879 (2)0.0171 (7)
H4A型0.825 (5)0.697 (6)0.647 (3)0.021*
5号机组1.0663 (4)0.9756 (5)0.6586 (3)0.0265 (8)
H5A型1.128 (6)1.095 (6)0.663 (3)0.032*
H5B型1.075 (7)0.915 (7)0.622 (3)0.032*
N6号0.8990 (4)0.9996 (4)0.7570 (2)0.0239 (7)
H6A型0.812 (6)0.945 (6)0.794 (3)0.029*
H6B型0.994 (6)1.110 (6)0.774 (3)0.029*
S10.43923 (11)0.46653 (11)0.24761 (4)0.0219 (2)
操作系统0.5553 (5)0.6048 (4)0.1917 (2)0.0347 (9)0.786 (3)
氧传感器0.2591 (3)0.4094 (5)0.2327 (3)0.0316 (9)0.786 (3)
臭氧层0.4931 (5)0.5230 (5)0.33338 (15)0.0261 (8)0.786 (3)
O4S公司0.4715 (5)0.3241 (4)0.2324 (2)0.0278 (9)0.786 (3)
O1S(操作系统)0.4024 (18)0.5609 (15)0.1843 (6)0.0347 (9)0.214 (3)
氧传感器0.3081 (13)0.4522 (18)0.3063 (7)0.0316 (9)0.214 (3)
臭氧层0.6076 (8)0.5825 (14)0.2834 (8)0.0261 (8)0.214 (3)
O4S’0.3720 (19)0.2907 (7)0.2180 (8)0.0278 (9)0.214 (3)
O1瓦0.3210 (4)0.4019 (4)0.4808 (2)0.0271 (7)
高沸点0.229 (7)0.397 (7)0.493 (4)0.041*
H2W(氢气)0.365 (7)0.427 (7)0.426 (4)0.041*
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
C1类0.0278 (19)0.0147 (16)0.0138 (17)0.0139 (15)0.0001 (15)0.0006 (14)
指挥与控制0.0239 (19)0.0173 (17)0.0151 (18)0.0112 (15)0.0032 (15)0.0037 (15)
C3类0.0136 (16)0.0130 (16)0.0148 (18)0.0051 (13)0.0042 (14)0.0013 (13)
补体第四成份0.0178 (16)0.0147 (16)0.0142 (18)0.0061 (14)0.0030 (14)0.0044 (14)
C5级0.0161 (16)0.0091 (15)0.0195 (19)0.0037 (13)0.0026 (15)0.0017 (14)
C6级0.0190 (17)0.0120 (16)0.0196 (19)0.0038 (14)0.0021 (15)0.0014 (14)
抄送70.0138 (16)0.0225 (18)0.0153 (18)0.0078 (14)0.0002 (14)0.0035 (15)
抄送80.0171 (17)0.0178 (17)0.024 (2)0.0069 (15)0.0005 (15)0.0023 (16)
O1公司0.0197 (13)0.0275 (14)0.0208 (15)0.0112 (12)0.0056 (12)0.0058 (12)
氧气0.0226 (14)0.0177 (13)0.0180 (14)0.0049 (11)0.0024 (12)0.0041 (11)
臭氧0.0175 (13)0.0190 (13)0.0249 (15)0.0031 (11)0.0042 (12)0.0008 (11)
O4号机组0.0253 (14)0.0147 (13)0.0263 (16)0.0053 (11)0.0117 (12)0.0002 (11)
N1型0.041 (2)0.0194 (16)0.0137 (16)0.0189 (15)0.0011 (15)0.0006 (13)
氮气0.059 (3)0.038 (2)0.0171 (19)0.034 (2)0.0095 (18)0.0122 (17)
N3号机组0.0253 (17)0.0225 (16)0.0123 (16)0.0115 (14)0.0011 (13)0.0022 (13)
4号机组0.0178 (15)0.0154 (14)0.0178 (17)0.0080 (12)0.0048 (13)0.0000 (13)
5号机组0.0183 (16)0.0226 (18)0.033 (2)0.0060 (14)0.0055 (15)0.0001 (16)
N6号0.0209 (16)0.0150 (15)0.031 (2)0.0054 (13)0.0012 (15)0.0045 (14)
S10.0245 (5)0.0203 (5)0.0144 (4)0.0062 (4)0.0012 (4)0.0009 (4)
操作系统0.039 (2)0.0243 (18)0.025 (2)0.0037 (16)0.0045 (18)0.0049 (16)
氧传感器0.0236 (18)0.034 (2)0.038 (2)0.0152 (16)0.0080 (16)0.0030 (17)
臭氧层0.0314 (19)0.0327 (19)0.018 (2)0.0186 (16)0.0034 (15)0.0068 (15)
O4S公司0.041 (2)0.035 (2)0.0161 (18)0.026 (2)0.0007 (18)0.0021 (16)
O1S(操作系统)0.039 (2)0.0243 (18)0.025 (2)0.0037 (16)0.0045 (18)0.0049 (16)
氧传感器0.0236 (18)0.034 (2)0.038 (2)0.0152 (16)0.0080 (16)0.0030 (17)
臭氧层0.0314 (19)0.0327 (19)0.018 (2)0.0186 (16)0.0034 (15)0.0068 (15)
O4S’0.041 (2)0.035 (2)0.0161 (18)0.026 (2)0.0007 (18)0.0021 (16)
O1瓦0.0337 (16)0.0267 (15)0.0216 (16)0.0155 (13)0.0014 (13)0.0025 (13)
几何参数(λ,º) 顶部
C1-N1型1.456 (5)O1-H1O型0.78 (6)
C1-C2类1.531 (5)氧气-水0.85 (5)
C1-C6号机组1.533 (5)臭氧合三0.83 (5)
C1-H1型1O4-H4O型0.76 (6)
C2-O1型1.420 (4)N1-H1A型1.00 (5)
C2-C3型1.523 (5)N2-H2A气体1.01 (6)
C2-H2型1N2-H2B型0.92 (6)
C3-N4型1.457 (4)N3-H3A型0.85 (5)
C3-C4型1.523 (5)N3-H3B型0.93 (5)
C3-H3型1N4-H4A型0.86 (5)
C4-O2型1.425 (4)N5-H5A型0.95 (5)
C4-C5型1.537 (5)N5-H5B型0.84 (5)
C4-H4型1N6-H6A型0.91 (5)
C5-O3型1.418 (4)N6-H6B型0.99 (5)
C5至C61.527 (5)S1-O2S型1.473 (2)
C5-H5型1S1-O3S’1.479 (2)
C6-O4型1.424 (5)S1-O4S’1.480 (2)
C6-H6型1S1-O3S型1.482 (2)
C7-N2型1.318 (5)1个月至1个月1.483 (2)
C7-N1型1.319 (5)S1-O1S’1.483 (2)
C7-N3号机组1.355 (5)S1-O2S’1.483 (2)
C8-N5号机组1.318 (5)S1-O4S型1.487 (2)
C8-N4号机组1.334 (5)O1W-H1W型0.85 (6)
C8-N6号机组1.335 (5)O1W-H2W型0.95 (6)
N1-C1-C2型111.0 (3)N5-C8-N4号119.6 (4)
N1-C1-C6109.6 (3)N5-C8-N6号119.8 (4)
C2-C1-C6型112.3 (3)编号4-C8-N6120.6 (3)
N1-C1-H1107.9C2-O1-H1O型111 (4)
C2-C1-H1型107.9C4-O2-H2O(C4-O2-水)105 (3)
C6-C1-H1型107.9C5-O3-H3O108 (4)
O1-C2-3型111.5 (3)C6-O4-H4O105 (4)
O1-C2-C1型107.0 (3)C7-N1-C1型125.5 (3)
C3-C2-C1110.4 (3)C7-N1-H1A型120 (3)
O1-C2小时109.3C1-N1-H1A114 (3)
C3-C2-H2109.3C7-N2-H2A型131 (3)
C1-C2-H2109.3C7-N2-H2B型119 (3)
编号4-C3-C2110.7 (3)H2A-N2-H2B型110 (4)
编号4-C3-C4109.3 (3)C7-N3-H3A型117 (3)
C2-C3-C4型110.7 (3)C7-N3-H3B型120 (3)
编号4-C3-H3108.7H3A-N3-H3B型119 (4)
C2-C3-H3型108.7C8-N4-C3型124.7 (3)
C4-C3-H3型108.7C8-N4-H4A型116 (3)
氧气-C4-C3109.1 (3)C3-N4-H4A型119 (3)
氧气-C4-C5110.5 (3)C8-N5-H5A型113 (3)
C3-C4-C5型108.1 (3)C8-N5-H5B型117 (4)
氧气-C4-H4109.7H5A-N5-H5B型127 (5)
C3-C4-H4型109.7C8-N6-H6A型118 (3)
C5-C4-H4109.7C8-N6-H6B型120 (3)
臭氧-C5-C6108.3 (3)H6A-N6-H6B型116 (4)
臭氧-C5-C4109.3 (3)O3S’-S1-O4S’128.4 (8)
C6-C5-C4112.0 (3)O2S-S1-o3秒113.2 (2)
臭氧-C5-H5109.1氧传感器-S1-O1S113.3 (2)
C6-C5-H5型109.1O3S-S1-O1S型108.1 (2)
C4-C5-H5型109.1O3S’-S1-OIS’108.3 (8)
O4-C6-C5型111.4 (3)O4S“-S1-O1S”108.1 (8)
O4-C6-C1型111.5 (3)O3S’-S1-O2S’108.2 (8)
C5-C6-C1110.9 (3)O4S“-S1-O2S”103.6 (8)
O4-C6-H6型107.6O1S“-S1-O2S”95.3 (8)
C5-C6-H6107.6氧传感器-S1-O4S109.6 (2)
C1-C6-H6型107.6O3S-S1-O4S106.5 (2)
N2-C7-N1型122.2 (4)O1S-S1-O4S105.8 (2)
N2-C7-N3型119.6 (4)H1W-O1W-H2W型121 (5)
N1-C7-N3号机组118.2 (3)
N1-C1-C2-O161.3 (4)臭氧-C5-C6-O460.1 (4)
C6-C1-C2-O1175.6 (3)C4-C5-C6-O4型179.3 (3)
N1-C1-C2-C3177.2 (3)O3-C5-C6-C1175.1 (3)
C6-C1-C2-C354.1 (4)C4-C5-C6-C1型54.5 (4)
O1-C2-C3-N4型60.4 (4)N1-C1-C6-O459.8 (4)
C1-C2-C3-N4179.2 (3)C2-C1-C6-O4型176.4 (3)
O1-C2-C3-C4178.2 (3)N1-C1-C6-C5型175.5 (3)
C1-C2-C3-C4型59.3 (4)C2-C1-C6-C5型51.6 (4)
N4-C3-C4-O256.6 (4)N2-C7-N1-C10.3 (6)
C2-C3-C4-O2型178.8 (3)N3-C7-N1-C1179.7 (4)
N4-C3-C4-C5176.7 (3)C2-C1-N1-C7107.6 (4)
C2-C3-C4-C5型61.0 (4)C6-C1-N1-C7127.9 (4)
O2-C4-C5-O361.8 (4)N5-C8-N4-C3179.5 (4)
C3-C4-C5-O3178.9 (3)N6-C8-N4-C31.8 (6)
氧气-C4-C5-C6178.2 (3)C2-C3-N4-C8型93.3 (4)
C3-C4-C5-C6型58.9 (4)C4-C3-N4-C8型144.4 (4)
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
O1-H1型O(运行)···O1公司W公司0.78 (6)2.00 (6)2.775 (4)170 (5)
氧气-氢气O(运行)···O1公司W公司0.85 (5)1.90 (5)2.748 (4)171 (5)
臭氧-H3O(运行)···臭氧S公司ii(ii)0.83 (5)1.79 (5)2.590 (12)162 (5)
臭氧-H3O(运行)···臭氧S公司ii(ii)0.83 (5)2.00 (5)2.801 (5)160 (5)
臭氧-H3O(运行)···O1公司S公司ii(ii)0.83 (5)2.56 (5)3.155 (5)130 (4)
O4-H4型O(运行)···氧气ii(ii)0.76 (6)2.15 (6)2.876 (4)158 (5)
N1-H1型A类···臭氧S公司1.00 (5)2.07 (5)2.863 (12)135 (4)
N1-H1型A类···O4号机组S公司1.00 (5)2.27 (5)3.136 (5)145 (4)
N2-H2气体B类···O1公司S公司iv(四)0.92 (6)1.87 (6)2.782 (5)174 (5)
N2-H2气体B类···O1公司S公司iv(四)0.92 (6)1.99 (6)2.805 (14)147 (5)
N2-H2气体A类···氧气S公司1.01 (6)1.85 (6)2.811 (8)158 (4)
N2-H2气体A类···氧气S公司1.01 (6)2.25 (6)3.220 (6)161 (4)
编号3-H3A类···臭氧S公司0.85 (5)2.00 (5)2.774 (12)150 (4)
编号3-H3A类···臭氧S公司0.85 (5)2.12 (5)2.978 (5)176 (4)
编号3-H3B类···O4号机组S公司iv(四)0.93 (5)2.02 (5)2.949 (5)174 (4)
编号3-H3B类···O4号机组S公司iv(四)0.93 (5)2.05 (5)2.952 (14)161 (4)
N4-H4型A类···O4号机组S公司0.86 (5)2.02 (5)2.865 (14)168 (4)
N4-H4型A类···O4号机组S公司0.86 (5)2.14 (5)2.976 (5)167 (4)
N5-H5型A类···臭氧不及物动词0.95 (5)1.90 (5)2.831 (5)169 (4)
N5-H5型B类···氧气S公司0.84 (5)2.22 (5)3.009 (5)157 (5)
N5-羟色胺B类···氧气S公司0.84 (5)2.43 (5)3.019 (14)127 (4)
N5-H5型B类···O4号机组S公司0.84 (5)2.54 (6)3.258 (15)144 (5)
N6-H6型B类···O4号机组不及物动词0.99 (5)1.94 (5)2.884 (4)159 (4)
N6-H6型B类···臭氧不及物动词0.99 (5)2.66 (5)3.284 (4)122 (3)
N6-H6型A类···O4号机组S公司0.91 (5)2.40 (5)3.021 (13)125 (4)
N6-H6型A类···氧气S公司0.91 (5)2.45 (5)3.358 (5)170 (4)
O1公司W公司-上半年W公司···O1公司S公司ii(ii)0.85 (6)1.95 (6)2.784 (5)166 (5)
O1公司W公司-上半年W公司···O1公司S公司ii(ii)0.85 (6)2.25 (6)2.894 (12)133 (5)
O1公司W公司-氢气W公司···臭氧S公司0.95 (6)1.84 (6)2.772 (5)166 (5)
O1公司W公司-氢气W公司···氧气S公司0.95 (6)2.06 (6)2.884 (12)144 (5)
对称代码:(i)x个++1,x个+1,z(z)+1/3; (ii)x个+,x个+1,z(z)+1/3; (iii)+1,x个,z(z)+2/3; (iv)x个,,z(z)+1; (v)+1,x个+1,z(z)+2/3; (vi)x个+1,+1,z(z).

实验细节

水晶数据
化学配方C类8H(H)20N个6O(运行)42+·SO公司42·H(H)2O(运行)
M(M)第页378.38
晶体系统,空间组三角,P(P)2
温度(K)100
,c(c)(Å)9.1105 (5), 16.2506 (7)
V(V))1168.1 (1)
Z轴
辐射类型Kα
µ(毫米1)0.27
晶体尺寸(mm)0.50 × 0.40 × 0.35
数据收集
衍射仪Nonius Kappa APEXII公司
衍射仪
吸收校正
测量、独立和
观察到的[> 2σ()]反射
4125, 2645, 2547
整数0.028
(罪θ/λ)最大值1)0.649
精细化
[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司0.046, 0.100, 1.05
反射次数2645
参数数量279
约束装置数量29
氢原子处理用独立和约束精化的混合物处理H原子
Δρ最大值, Δρ最小值(eó))0.67,0.59
绝对结构弗莱克(1983)
绝对结构参数0.08 (12)

计算机程序:收集(诺尼乌斯,1998),DENZO公司(Otwinowski&Minor 1997)和电子秤组件(Otwinowski&Minor)1997),DENZO公司(Otwinowski&Minor 1997)和电子秤组件(Otwinowski&Minor,1997),SHELXS97标准(谢尔德里克,2008),SHELXL97型(谢尔德里克,2008),ORTEP-3公司(伯内特和约翰逊,1996),公共CIF(Westrip,2009)。

氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
O1-H1O··O1W0.78 (6)2.00 (6)2.775 (4)170 (5)
O2-H2O··O1W0.85 (5)1.90 (5)2.748 (4)171 (5)
O3-H3O··O3S’ii(ii)0.83 (5)1.79 (5)2.590 (12)162 (5)
O3至H3O···O3秒ii(ii)0.83 (5)2.00 (5)2.801 (5)160 (5)
O3-H3O··O1Sii(ii)0.83 (5)2.56 (5)3.155 (5)130 (4)
O4-H4O··O2ii(ii)0.76 (6)2.15 (6)2.876 (4)158 (5)
N1-H1A··O3S’1.00 (5)2.07 (5)2.863 (12)135 (4)
N1-H1A··O4S1.00 (5)2.27 (5)3.136 (5)145 (4)
N2-H2B···O1Siv(四)0.92 (6)1.87 (6)2.782 (5)174 (5)
N2-H2B···O1S’iv(四)0.92 (6)1.99 (6)2.805 (14)147 (5)
N2-H2A··O2S’1.01 (6)1.85 (6)2.811 (8)158 (4)
N2-H2A··O2S1.01 (6)2.25 (6)3.220 (6)161 (4)
N3-H3A···o3秒0.85 (5)2.00 (5)2.774 (12)150 (4)
N3-H3A··O3S0.85 (5)2.12 (5)2.978 (5)176 (4)
N3-H3B···O4Siv(四)0.93 (5)2.02 (5)2.949 (5)174 (4)
N3-H3B···O4Siv(四)0.93 (5)2.05 (5)2.952 (14)161 (4)
N4-H4A··O4S’0.86 (5)2.02 (5)2.865 (14)168 (4)
N4-H4A··O4S0.86 (5)2.14 (5)2.976 (5)167 (4)
N5-H5A··O3不及物动词0.95 (5)1.90 (5)2.831 (5)169 (4)
N5-H5B··O2S0.84 (5)2.22 (5)3.009 (5)157 (5)
N5-H5B··O2S’0.84 (5)2.43 (5)3.019 (14)127 (4)
N5-H5B···O4S0.84 (5)2.54 (6)3.258 (15)144 (5)
N6-H6B···O4不及物动词0.99 (5)1.94 (5)2.884 (4)159 (4)
N6-H6B···O3不及物动词0.99 (5)2.66 (5)3.284 (4)122 (3)
N6-H6A···O4S0.91 (5)2.40 (5)3.021 (13)125 (4)
N6-H6A··O2S0.91 (5)2.45 (5)3.358 (5)170 (4)
O1W-H1W··O1Sii(ii)0.85 (6)1.95 (6)2.784 (5)166 (5)
O1W-H1W··O1S’ii(ii)0.85 (6)2.25 (6)2.894 (12)133 (5)
O1W-H2W··O3S0.95 (6)1.84 (6)2.772 (5)166 (5)
O1W-H2W··O2S’0.95 (6)2.06 (6)2.884 (12)144 (5)
对称代码:(i)x个++1,x个+1,z(z)+1/3; (ii)x个+,x个+1,z(z)+1/3; (iii)+1,x个,z(z)+2/3; (iv)x个,,z(z)+1; (v)+1,x个+1,z(z)+2/3; (vi)x个+1,+1,z(z).
 

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