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环胺氮杂环丁烷(C)的晶体结构H(H)7N) ,吡咯烷(C4H(H)9N) 和六亚甲基亚胺(高哌啶,C6H(H)13N) 系列(CH2)n个NH,带n个分别在170 K下测定=3、4和6,如下就地熔体结晶。这些结构提供了完成环胺(CH)同系物系列的晶体学数据2)n个NH,用于n个= 2–6. 阿泽替丁和吡咯烷含有沿着21螺旋轴,其中分子通过合作N-H连接...N氢键。阿西替丁在其不对称单元中有两个分子,而吡咯烷只有一个。六亚甲基亚胺含有四聚氢键环,由晶体反转中心形成,不对称单元中有两个分子。在氮杂环丁烷的氢键链中观察到晶体上不同的摩尔和六甲基亚亚胺中的环状氢键基序,这与通过与通过合作O-H形成链或环的单醇进行比较得出的预期一致...O氢键。环胺系列的下一个成员庚亚甲基亚胺从熔体中冷却后形成立方塑性相。

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结晶信息文件(CIF)https://doi.org/10.107/S010827010826012/fa3160sup1.cif
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CCDC参考:707206;707207;707208

注释顶部

仪器和技术的当代发展就地结晶大大简化了获取衍射数据的任务低熔点材料(Boese&Nussbaumer,1994;Davies&Bond,2001).这份手稿描述了环氮杂胺、(I)、吡咯烷、(II)和六亚甲基亚胺(高哌啶),(III),在环境条件下均为液体。连同先前报道的氮杂啶(Mitzel)的结构et(等)阿尔。和哌嗪(帕金等。, 2004),这些结构提供晶体学数据以完成环状的同源序列胺,(CH2)n个NH,用于n个= 2–6.

在该系列的每个结构中,分子通过合作N-H··N连接具有类似几何特征的氢键(表1-3)。阿齐利定(n个=2),氮杂啶(n个= 3; 图1),吡啶(n个= 4; 图2)和哌嗪(n个=5)均为一维氢键链。在最后两种结构中,链传播沿21空间组中的螺旋轴P(P)21/c(c),带有一个分子在非对称装置中(图3)。在氮杂啶中,链也沿着21旋入轴P(P)21/c(c),但有两个晶体每条链中有不同的分子(图4)。因此,沿着链由2关联1螺旋操作,每四个分子翻译相关b条阿齐利定在空间群中结晶P(P)1每个分子中有三个晶体学上不同的分子氢键链。链构象约为31螺丝钉对称性(图5),每三个分子沿b条在六亚甲基亚胺(图6)中,分子形成四聚环具有合作N-H··N氢键的闭合循环。戒指是关于空间群中晶体反转中心的形成P(P)21/n个,四聚体的四个分子中有两个是晶体学上不同(图7)。

环胺中的N-H··N氢键基序令人想起在一元醇中经常观察到的那些。例如,氢键链存在于环境压力(Jönsson,1976)和高压(艾伦&Clark,1999)乙醇的多晶型,而体积更大3-乙基-3-戊醇形成环状四聚体(Bond,2006)。NH组类似于OH中的组它可以同时作为氢键供体(尽管情况更糟比OH;斯坦纳,2002),并作为一名接受人。因此,延伸链和关闭在这两种情况下,环都是预期的图案。对于单醇,Brock&Duncan(1994)指出,具有多个晶体学上不同的分子异常高,因为O-H··O氢的空间要求之间经常发生冲突键和分子紧密堆积的整体限制,那个分子通常排列在反转中心,21螺旋轴或滑翔飞机。中扩展O-H··O氢键链的形成单醇要求O原子进入加利福尼亚州2.7–2.9º。在环胺中,相应的N··N距离为稍长一点(加利福尼亚州3.1–3.2 Å). 在这些限制中,O-H··O或N-H··N氢键链可能与分子包装兼容大约21螺旋轴或滑动面,例如在吡咯烷和哌嗪。然而,在其他情况下,这种兼容性可能无法保证,因此,与结构相比,链状图案的可能性更大在剑桥结构数据库(Allen,2002)中作为一个整体]形成或者有一个以上的晶体缺陷分子,如氮杂环丁烷,或围绕3、4或6级的螺旋或旋转反转轴,如用氮杂环丙烷近似。对于更大的分子,环状基序提供了其他替代方案。这些通常是四聚体,可能形成于正方空间群(例如2-苯基金刚烷-2-醇;辛格伦伯格&van Eijck,1987)或关于两个反演中心晶体学上不同的分子,如六亚甲基亚胺和3-乙基-3-戊醇(键,2006). 据观察,大件货物的包装安排酒精可通过增加压力。例如,2-氯苯酚和环境压力下的4-氟苯酚含有氢键链沿32轴分别在高压下包含链条沿21轴(奥斯瓦尔德等。, 2005).

第三次盲试以氮杂啶的晶体结构为靶点剑桥大学组织的晶体结构预测(CSP2004)晶体数据中心(白天等。, 2005). 这两个晶体学上不同的分子给这个练习带来了困难,并且在前三个预测中没有出现正确的结构任何参与者。值得注意的是,170K处的结构出现成为势能面上的鞍点,具有低势垒空间群中一种假定的下对称结构的变换P(P)1不对称单元中有四个分子。

相关文献顶部

相关文献见:Allan&Clark(1999);艾伦(2002);Boese&Nussbaumer(1994);债券(2006);Brock和Duncan(1994);布鲁克(2003);Davies&Bond(2001);等。(2005);Görbitz(1999年);Jönsson(1976);米策尔等。(1997);奥斯瓦尔德等。(2005);帕金等。(2004);Singelenberg和van Eijck(1987);斯坦纳(2002)。

实验顶部

吡咯烷和六亚甲基亚胺的单晶生长在0.3 mm直径玻璃毛细管的温度略低于样本,使用Davies描述的手动区域细化技术&邦德(2001)。衍射图案在一定温度下进行索引就在下面通过旋转收集的一系列图像的熔点毛细管轴,毛细管保持在水平位置晶体生长的地方。将毛细管从水平位置移开精细阶段导致晶体损失,而随后冷却(至170 K),用于数据收集,导致多晶体生长。方向保留并使用为初始单晶建立的基体在整个数据收集和集成过程中,以及与忽略了其他晶体成分的衍射图案。对于两者化合物,这种策略提供了可接受的R(右)整数值,尽管相对较高的R(右)六亚甲基亚胺的精制值为可能主要归因于衍射图案。因为许多然而,忽略重叠的近似值完全优于与积分相关的近似值众多部分重叠组件的基础。这是不可能的使用手动技术生长合适的氮杂啶晶体因此,结晶是通过安装在0.66mm直径毛细管保持在170K,使用激光辅助区域细化Boese和Nussbaumer的技术(1994)。同样,衍射图案包含来自多个晶体的贡献,但单个晶体可以使用程序编制索引双子座(布鲁克,2003)和上的集成这个单一成分的基础提供了良好的结果。在所有情况下用于数据采集的晶体的确切尺寸尚不确定沿着毛细管轴的长度可能超过X射线束。这似乎对最终的精炼没有什么影响参数(Görbitz,1999)。在170K的数据收集之后,进一步的晶体的冷却导致三种晶体的峰值形状恶化化合物,无法获得进一步有用的数据。我们试图明确系列的下一个成员,庚烯亚胺,但从熔体中冷却后会形成塑料相。衍射图样可以基于立方晶格进行索引尺寸11.647(3)Ω,但无法确定结构模型。

精炼顶部

与C原子结合的H原子被几何定位并允许骑行在精炼过程中,C-H=0.99ºU型国际标准化组织(H)=1.2U型等式(C) ●●●●。NH基团的H原子位置不同Fourier映射并使用各向同性位移参数进行细化。对于氮杂啶和吡咯烷,不需要任何限制。对于六亚甲基亚胺N-H距离被限制为标准的通用精确值不确定度0.01°。六亚甲基亚胺中的C4、C5、C11和C12原子为建模为无序,每个组件为两个组件,现场占用系数为0.5。该区域的C-C键(共12个)被限制为精确值,标准不确定度0.01°。

计算详细信息顶部

数据收集:智能(Bruker,1997),用于(I);4月2日(Bruker,2004)为(II),(III)。对于所有化合物,细胞精炼:圣保罗(布鲁克,2003);数据缩减:圣保罗(布鲁克,2003)。用于求解结构的程序:92新加坡元(阿尔托马雷等。(I),1994年);SHELXTL公司(谢尔德里克,2008),(II),(III)。对于所有化合物,用于优化结构的程序:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008);分子图形:SHELXTL公司(Sheldrick,2008)和水银(麦克雷等。, 2006); 用于准备出版材料的软件:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008)。

数字顶部
[图1] 图1。氮杂环丁烷不对称单元(I)中的两个分子以50%概率水平绘制的位移椭球体,H原子除外与C原子结合,显示为任意半径的小球。
[图2] 图2。吡咯烷(II)的分子结构以50%概率水平绘制的椭球体,但与C结合的H原子除外原子,显示为任意半径的小球。
[图3] 图3。沿着c(c)轴,显示两条链通过合作N-H···N氢键(虚线)传播连接沿21平行于b条轴。H原子与C原子结合已被省略。[对称代码:(i)-x, -1/2 +, 1/2 -z(z).]
[图4] 图4。阿齐丁沿途的景色c(c)轴,显示链接的一条链通过合作的N-H··N氢键(虚线)沿着21平行于b条轴。这两个晶体不同的分子及其对称等价物通过其阴影。与C原子结合的H原子被省略了。[对称代码:(i)1-x, -1/2 +, 1/2 -z(z); (ii)1-x, 1/2 +,1/2 -z(z).]
[图5] 图5。氮杂啶(Mitzel)中氢键链的垂直视图等。,1997),显示大约31螺旋对称。这个晶体学上不同的分子及其对称性等价物是通过它们的阴影来区分。与C原子结合的H原子被省略了。
[图6] 图6。六亚甲基亚胺不对称单元中的两个分子,(III),以50%概率水平绘制位移椭球体,H除外原子与C原子结合,表示为任意半径的小球。
[图7] 图7。六亚甲基亚胺的单位细胞含量,显示四聚体连接通过合作的N-H··N氢键(虚线)。这两个晶体学上不同的分子及其对称性等价物是以阴影区分。与C原子结合的H原子被省略了。
(一) 氮杂啶顶部
水晶数据 顶部
CH(H)7N个F类(000) = 256
M(M)第页= 57.10D类x=1.007毫克/米
单诊所,P(P)21/c(c)熔点:190 K
大厅符号:-P 2ybcK(K)α辐射,λ= 0.71073 Å
= 9.507 (3) Å1395次反射的单元参数
b条= 9.122 (3) Åθ= 2–25°
c(c)= 9.790 (3) ŵ=0.06毫米1
β= 117.469 (4)°T型=170 K
V(V)= 753.3 (4) Å圆柱体,无色
Z轴= 81.00×0.33(半径)mm
数据收集 顶部
Bruker SMART APEX CCD区域探测器
衍射仪
1782独立反射
辐射源:细焦点密封管1144次反射> 2σ()
石墨单色仪R(右)整数= 0.035
ϕω扫描θ最大值= 28.3°,θ最小值= 2.4°
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 布鲁克,2003年)
小时=1012
T型最小值= 0.688,T型最大值= 0.960k个=1112
4439次测量反射=1212
精炼 顶部
优化于F类2二次原子位置:差分傅里叶映射
最小二乘矩阵:完整氢站点位置:从邻近站点推断
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.056用独立和约束精化的混合物处理H原子
水风险(F类2) = 0.162 w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.067P(P))2+ 0.1013P(P)]
哪里P(P)= (F类o个2+ 2F类c(c)2)/3
S公司= 1.04(Δ/σ)最大值< 0.001
1782次反射Δρ最大值=0.18埃
83个参数Δρ最小值=0.18埃
0个约束消光校正:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008),Fc*=kFc[1+0.001xFc2λ/罪(2θ)]-1/4
主原子位置定位:结构-变量直接方法消光系数:0.044(9)
水晶数据 顶部
CH(H)7N个V(V)= 753.3 (4) Å
M(M)第页= 57.10Z轴= 8
单诊所,P(P)21/c(c)K(K)α辐射
= 9.507 (3) ŵ=0.06毫米1
b条= 9.122 (3) ÅT型=170 K
c(c)= 9.790 (3) Å1.00×0.33(半径)mm
β= 117.469 (4)°
数据收集 顶部
Bruker SMART APEX CCD区域探测器
衍射仪
1782独立反射
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 布鲁克,2003年)
1144次反射> 2σ()
T型最小值= 0.688,T型最大值= 0.960R(右)整数= 0.035
4439次测量反射
精炼 顶部
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.0560个约束
水风险(F类2) = 0.162用独立和约束精化的混合物处理H原子
S公司= 1.04Δρ最大值=0.18埃
1782次反射Δρ最小值=0.18埃
83个参数
特殊细节 顶部

实验.晶体生长就地在170 K下使用激光辅助区域重建Boese技术(Boese&Nussbauer,1994)。

几何图形.所有e.s.d.(两个l.s.平面之间二面角的e.s.d.除外)使用全协方差矩阵进行估计在估计e.s.d.的距离、角度时单独考虑和扭转角;e.s.d.细胞内参数之间的相关性仅为当它们由晶体对称性定义时使用。近似(各向同性)细胞e.s.d.的处理用于估计涉及l.s.的e.s.d。飞机。

精炼.改进F类2对抗所有反射。加权R(右)-因子水风险和贴合度S公司基于F类2,常规R(右)-因素R(右)基于F类,使用F类设置为零消极的F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算R(右)-因子(gt).并且与选择反射进行细化无关。R(右)-因素基于F类2从统计上看大约是两倍大作为那些基于F类,以及R(右)-基于所有数据的系数将为甚至更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
xz(z)U型国际标准化组织*/U型等式
N1型0.33607 (17)0.80512 (15)0.10290 (15)0.0489 (4)
上半年0.412 (2)0.851 (2)0.178 (2)0.058 (5)*
指挥与控制0.3048 (2)0.8502 (2)0.05269 (18)0.0568 (5)
过氧化氢0.33600.77610.10750.068*
硫化氢0.34840.94780.05650.068*
C3类0.1294 (2)0.8517 (3)0.1004 (2)0.0685 (6)
H3A型0.07260.76130.15320.082*
H3B型0.07330.94060.15740.082*
补体第四成份0.1775 (2)0.8558 (2)0.07009 (19)0.0642 (5)
H4A型0.17610.95540.10960.077*
H4B型0.11850.78580.10180.077*
5号机组0.37687 (16)0.46573 (16)0.13886 (14)0.0490 (4)
H5型0.368 (2)0.559 (2)0.1393 (19)0.058 (5)*
C6级0.3319 (2)0.4012 (2)0.01410 (19)0.0609 (5)
H6A型0.42330.36990.02950.073*
H6B型0.25760.46240.10100.073*
抄送70.2523 (2)0.2769 (2)0.0269 (2)0.0645 (5)
H7A型0.32010.18940.07060.077*
H7B型0.14640.24980.05600.077*
抄送80.2492 (2)0.3812 (2)0.1461 (2)0.0630 (5)
H8A型0.14850.43610.11020.076*
H8B型0.27980.33520.24750.076*
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
N1型0.0523 (8)0.0475 (8)0.0399 (7)0.0018 (6)0.0153 (6)0.0022 (6)
指挥与控制0.0585 (11)0.0710 (12)0.0423 (9)0.0021 (8)0.0246 (8)0.0016 (8)
C3类0.0559 (11)0.0975 (15)0.0452 (10)0.0039 (10)0.0174 (8)0.0017 (9)
补体第四成份0.0572 (11)0.0907 (15)0.0483 (10)0.0012 (9)0.0276 (8)0.0050 (9)
5号机组0.0570 (8)0.0415 (8)0.0417 (7)0.0025 (6)0.0171 (6)0.0009 (5)
C6级0.0651 (11)0.0696 (13)0.0527 (10)0.0087 (9)0.0312 (8)0.0084 (8)
抄送70.0629 (12)0.0650 (12)0.0625 (11)0.0167 (9)0.0262 (9)0.0164 (9)
抄送80.0774 (13)0.0644 (12)0.0561 (10)0.0119 (9)0.0384 (9)0.0041 (8)
几何参数(λ,º) 顶部
N1-C4型1.464 (2)N5-C8号1.467 (2)
N1-C2型1.470 (2)N5-C6型1.477 (2)
N1-H1型0.87 (2)N5-H5型0.86 (2)
C2-C3型1.510 (3)C6至C71.516 (3)
C2-H2A型0.99C6-H6A型0.99
C2-H2B型0.99C6-H6B型0.99
C3-C4型1.513 (2)C7-C8号机组1.517 (2)
C3-H3A型0.99C7-H7A型0.99
C3-H3B型0.99C7-H7B型0.99
C4-H4A型0.99C8-H8A型0.99
C4-H4B型0.99C8-H8B型0.99
C4-N1-C289.34 (12)C8-N5-C688.87 (12)
C4-N1-H1型114.0 (12)C8-N5-H5基因115.9 (12)
C2-N1-H1型116.1 (12)C6-N5-H5型114.7 (11)
N1-C2-C3型89.39 (12)编号5-C6-C788.64 (13)
N1-C2-H2A型113.7N5-C6-H6A型113.9
C3-C2-H2A113.7C7-C6-H6A型113.9
N1-C2-H2B型113.7N5-C6-H6B型113.9
C3-C2-H2B113.7C7-C6-H6B型113.9
H2A-C2-H2B型111H6A-C6-H6B型111.1
C2-C3-C4型85.99 (13)C6-C7-C8型85.61 (14)
C2-C3-H3A型114.3C6-C7-H7A型114.4
C4-C3-H3A型114.3C8-C7-H7A型114.4
C2-C3-H3B型114.3C6-C7-H7B型114.4
C4-C3-H3B型114.3C8-C7-H7B型114.4
H3A-C3-H3B型111.5H7A-C7-H7B型111.5
N1-C4-C3型89.50 (13)N5-C8-C7号88.98 (12)
N1-C4-H4A型113.7N5-C8-H8A型113.8
C3-C4-H4A型113.7C7-C8-H8A基因113.8
N1-C4-H4B型113.7N5-C8-H8B型113.8
C3-C4-H4B型113.7C7-C8-H8B型113.8
H4A-C4-H4B型111H8A-C8-H8B111
C4-N1-C2-C318.32 (15)C8-N5-C6-C721.33 (15)
N1-C2-C3-C417.74 (15)N5-C6-C7-C820.66 (14)
C2-N1-C4-C3型18.28 (15)C6-N5-C8-C721.33 (15)
C2-C3-C4-N1型17.81 (15)C6-C7-C8-N520.80 (14)
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-小时···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-小时···A类
N5-H5···N10.86 (2)2.27 (2)3.120 (2)171.5 (15)
N1-H1··N50.87 (2)2.24 (2)3.102 (2)174.4 (16)
对称代码:(i)x+1,+1/2,z(z)+1/2.
(二) 吡咯烷顶部
水晶数据 顶部
C4H(H)9N个F类(000) = 160
M(M)第页= 71.12D类x=1.042毫克
单诊所,P(P)21/c(c)熔点:210 K
大厅符号:-P 2ybcK(K)α辐射,λ= 0.71073 Å
= 8.6753 (8) Å2626次反射的细胞参数
b条= 5.2078 (5) Åθ= 2.5–26.1°
c(c)= 10.7108 (10) ŵ=0.06毫米1
β= 110.451 (3)°T型=170 K
V(V)= 453.41 (7) Å圆柱体,无色
Z轴= 40.35×0.15(半径)mm
数据收集 顶部
Bruker Nonius X8 APEXII CCD区域探测器
衍射仪
900个独立反射
辐射源:细焦点密封管760次反射> 2σ()
石墨单色仪R(右)整数= 0.026
薄片ωϕ扫描θ最大值= 26.1°,θ最小值= 4.0°
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 布鲁克,2003年)
小时=1010
T型最小值= 0.853,T型最大值= 0.977k个=66
5429次测量反射=1313
精炼 顶部
优化于F类2主原子位置定位:结构-变量直接方法
最小二乘矩阵:完整二次原子位置:差分傅里叶映射
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.042氢站点位置:从邻近站点推断
水风险(F类2) = 0.110用独立和约束精化的混合物处理H原子
S公司= 1.06 w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.0456P(P))2+ 0.1266P(P)]
哪里P(P)= (F类o个2+ 2F类c(c)2)/3
900次反射(Δ/σ)最大值< 0.001
50个参数Δρ最大值=0.16埃
0个约束Δρ最小值=0.13埃
水晶数据 顶部
C4H(H)9N个V(V)= 453.41 (7) Å
M(M)第页= 71.12Z轴= 4
单诊所,P(P)21/c(c)K(K)α辐射
= 8.6753 (8) ŵ=0.06毫米1
b条= 5.2078 (5) ÅT型=170 K
c(c)= 10.7108 (10) Å0.35×0.15(半径)mm
β= 110.451 (3)°
数据收集 顶部
Bruker Nonius X8 APEXII CCD区域探测器
衍射仪
900个独立反射
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 布鲁克,2003年)
760次反射> 2σ()
T型最小值= 0.853,T型最大值= 0.977R(右)整数= 0.026
5429次测量反射
精炼 顶部
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.0420个约束
水风险(F类2) = 0.110用独立和约束精化的混合物处理H原子
S公司= 1.06Δρ最大值=0.16埃
900次反射Δρ最小值=0.13埃
50个参数
特殊细节 顶部

实验.X塔尔成年的就地加利福尼亚州203 K,0.3 mm毛细管。这个晶体长度没有估计,但它可能超过了准直器。在170K温度下,确实存在几种晶体。一种晶体的折射率可以非常接近熔点,而只有这一个被认为是在较低的温度下。无法在170 K下进行索引。

几何图形.所有e.s.d.(两个l.s.平面之间二面角的e.s.d.除外)使用全协方差矩阵进行估计在估计e.s.d.的距离、角度时单独考虑和扭转角;e.s.d.细胞内参数之间的相关性仅为当它们由晶体对称性定义时使用。近似(各向同性)细胞e.s.d.的处理用于估计涉及l.s.的e.s.d。飞机。

精炼.改进F类2对抗所有反射。加权R(右)-因子水风险和贴合度S公司基于F类2,常规R(右)-因素R(右)基于F类,使用F类设置为零消极的F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算R(右)-因子(gt).并且与选择反射进行细化无关。R(右)-因素基于F类2从统计上看大约是两倍大作为那些基于F类,以及R(右)-基于所有数据的系数将为甚至更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
xz(z)U型国际标准化组织*/U型等式
N1型0.10684 (13)0.5232 (2)0.30411 (12)0.0402 (3)
上半年0.038 (2)0.411 (3)0.2626 (17)0.054 (5)*
指挥与控制0.18779 (17)0.4308 (3)0.43977 (13)0.0422 (4)
过氧化氢0.10610.35510.47450.051*
硫化氢0.24410.57410.49890.051*
C3类0.31260 (16)0.2278 (3)0.43463 (13)0.0423 (4)
H3A型0.41450.24000.51380.051*
H3B型0.26630.05290.43050.051*
补体第四成份0.34677 (18)0.2893 (3)0.30783 (15)0.0463 (4)
H4A型0.31770.14190.24550.056*
H4B型0.46430.33180.32840.056*
C5级0.23822 (19)0.5199 (3)0.24830 (14)0.0465 (4)
H5A型0.30320.68040.27130.056*
H5B型0.19140.50480.15000.056*
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
N1型0.0346 (6)0.0328 (6)0.0469 (7)0.0027 (5)0.0062 (5)0.0002 (5)
指挥与控制0.0442 (8)0.0433 (8)0.0425 (8)0.0096 (6)0.0192 (6)0.0010 (6)
C3类0.0429 (7)0.0417 (8)0.0406 (7)0.0109 (6)0.0124 (6)0.0015 (6)
补体第四成份0.0483 (8)0.0421 (8)0.0554 (9)0.0047 (6)0.0269 (7)0.0024 (6)
C5级0.0644 (9)0.0331 (7)0.0477 (8)0.0005 (6)0.0270 (7)0.0012 (6)
几何参数(λ,º) 顶部
N1-C2型1.4570 (17)C3-H3A型0.99
N1-C5型1.4604 (18)C3-H3B型0.99
N1-H1型0.84 (2)C4-C5型1.522 (2)
C2-C3型1.5281 (17)C4-H4A型0.99
C2-H2A型0.99C4-H4B型0.99
C2-H2B型0.99C5-H5A型0.99
C3-C4型1.5220 (19)C5-H5B型0.99
C2-N1-C5103.38 (10)H3A-C3-H3B型108.9
C2-N1-H1型107.6 (12)C3-C4-C5型104.77 (11)
C5-N1-H1106.5 (11)C3-C4-H4A型110.8
N1-C2-C3型107.05 (10)C5-C4-H4A型110.8
N1-C2-H2A型110.3C3-C4-H4B型110.8
C3-C2-H2A110.3C5-C4-H4B110.8
N1-C2-H2B型110.3H4A-C4-H4B型108.9
C3-C2-H2B110.3N1-C5-C4107.14 (11)
H2A-C2-H2B型108.6N1-C5-H5A型110.3
C4-C3-C2型104.36 (11)C4-C5-H5A型110.3
C4-C3-H3A型110.9N1-C5-H5B型110.3
C2-C3-H3A型110.9C4-C5-H5B型110.3
C4-C3-H3B型110.9H5A-C5-H5B型108.5
C2-C3-H3B型110.9
C5-N1-C2-C335.77 (14)C2-N1-C5-C4型35.32 (14)
N1-C2-C3-C422.47 (15)C3-C4-C5-N121.25 (15)
C2-C3-C4-C5型0.69 (15)
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-小时···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-小时···A类
N1-H1··N10.84 (2)2.35 (2)3.1716 (13)163.7 (15)
对称代码:(i)x,1/2,z(z)+1/2.
(三) 六亚甲基亚胺顶部
水晶数据 顶部
C6H(H)13N个F类(000) = 448
M(M)第页= 99.17D类x=0.998毫克
单诊所,P(P)21/n个熔点:236 K
大厅符号:-P 2ynK(K)α辐射,λ= 0.71073 Å
= 11.0201 (14) Å6154次反射的细胞参数
b条= 10.3027 (13) Åθ= 2.6–23.2°
c(c)= 12.7322 (15) ŵ=0.06毫米1
β= 114.110 (5)°T型=170 K
V(V)= 1319.5 (3) Å圆柱体,无色
Z轴= 80.35×0.15(半径)mm
数据收集 顶部
Bruker Nonius X8 APEXII CCD区域探测器
衍射仪
2509独立反射
辐射源:细焦点密封管1824次反射> 2σ()
石墨单色仪R(右)整数= 0.051
薄片ωϕ扫描θ最大值= 25.9°,θ最小值= 3.7°
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 布鲁克,2003年)
小时=1213
T型最小值= 0.688,T型最大值= 0.981k个=1212
16092次测量反射=1415
精炼 顶部
优化于F类2主原子位置定位:结构-变量直接方法
最小二乘矩阵:完整二次原子位置:差分傅里叶映射
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.083氢站点位置:从邻近站点推断
水风险(F类2) = 0.269用独立和约束精化的混合物处理H原子
S公司= 1.12 w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.1254P(P))2+ 0.8949P(P)]
哪里P(P)= (F类o个2+ 2F类c(c)2)/3
2509次反射(Δ/σ)最大值< 0.001
173个参数Δρ最大值=0.29埃
14个约束Δρ最小值=0.22埃
水晶数据 顶部
C6H(H)13N个V(V)= 1319.5 (3) Å
M(M)第页= 99.17Z轴= 8
单诊所,P(P)21/n个K(K)α辐射
= 11.0201 (14) ŵ=0.06毫米1
b条= 10.3027 (13) ÅT型=170 K
c(c)= 12.7322 (15) Å0.35×0.15(半径)mm
β= 114.110 (5)°
数据收集 顶部
Bruker Nonius X8 APEXII CCD区域探测器
衍射仪
2509独立反射
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 布鲁克,2003年)
1824次反射> 2σ()
T型最小值= 0.688,T型最大值= 0.981R(右)整数= 0.051
16092次测量反射
精炼 顶部
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.08314约束
水风险(F类2) = 0.269用独立和约束精化的混合物处理H原子
S公司= 1.12Δρ最大值=0.29埃
2509次反射Δρ最小值=0.22埃
173个参数
特殊细节 顶部

实验.X塔尔成年的就地在0.3mm毛细管中加利福尼亚州230 K晶体长度没有估计,但它可能超过了准直器。在170K温度下,确实存在几种晶体。一种晶体的折射率可以非常接近熔点,而只有这一个被认为是在较低的温度下。多扫描校正为解释晶体吸收以外的影响,包括毛细管吸收和可能存在的重叠其他晶体的反射。

几何图形.所有e.s.d.(两个l.s.平面之间二面角的e.s.d.除外)使用全协方差矩阵进行估计在估计e.s.d.的距离、角度时单独考虑和扭转角;e.s.d.细胞内参数之间的相关性仅为当它们由晶体对称性定义时使用。近似(各向同性)细胞e.s.d.的处理用于估计涉及l.s.的e.s.d。飞机。

精炼.改进F类2对抗所有反射。加权R(右)-因子水风险和贴合度S公司基于F类2,常规R(右)-因素R(右)基于F类,使用F类设置为零消极的F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算R(右)-因子(gt).并且与选择反射进行细化无关。R(右)-因素基于F类2从统计上看大约是两倍大作为那些基于F类,以及R(右)-基于所有数据的系数将为甚至更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
xz(z)U型国际标准化组织*/U型等式开路特性。(<1)
N1型0.3562 (2)0.5819 (2)0.0683 (2)0.0424 (6)
上半年0.350 (3)0.515 (3)0.021 (2)0.042 (7)*
指挥与控制0.3410 (3)0.5335 (3)0.1691 (3)0.0523 (8)
过氧化氢0.37810.44470.18580.063*
硫化氢0.24500.52770.15160.063*
C3类0.4084 (3)0.6168 (3)0.2764 (3)0.0608 (9)
H3A型0.35790.60700.32480.073*0.50
H3B型0.49840.58110.32050.073*0.50
H3C公司0.39870.57430.34230.073*0.50
H3D(高密度)0.50450.62320.29440.073*0.50
补体第四成份0.4224 (6)0.7613 (6)0.2587 (5)0.0504 (17)0.50
H4A型0.49610.77370.23430.060*0.50
H4B型0.44720.80610.33340.060*0.50
C5级0.2980 (6)0.8258 (7)0.1704 (5)0.0523 (18)0.50
H5A型0.21870.78620.17540.063*0.50
H5B型0.29900.91900.18970.063*0.50
C6级0.2860 (4)0.8138 (3)0.0489 (3)0.0644 (9)
H6A型0.37030.84160.04560.077*0.50
H6B型0.21450.87200.00160.077*0.50
H6C型0.33060.85660.00470.077*0.50
H6D型0.20020.85890.02930.077*0.50
C4A公司0.3495 (9)0.7523 (6)0.2608 (6)0.0672 (19)0.50
H4C型0.25280.74390.23900.081*0.50
H4D型0.38800.79700.33620.081*0.50
C5A公司0.3693 (10)0.8377 (7)0.1738 (6)0.069 (2)0.50
H5C型0.35420.92850.19090.082*0.50
H5D型0.46370.83080.18590.082*0.50
抄送70.2550 (3)0.6757 (3)0.0052 (3)0.0602 (9)
H7A型0.17020.64910.00830.072*
H7B型0.24180.67380.07650.072*
N8号0.6496 (2)0.6463 (2)0.09841 (19)0.0433 (6)
H8型0.567 (3)0.630 (3)0.093 (3)0.065 (10)*
C9级0.7372 (3)0.6199 (4)0.2172 (3)0.0678 (10)
H9A型0.70170.54460.24400.081*
H9B型0.73580.69560.26450.081*
C10号机组0.8784 (3)0.5921 (4)0.2377 (3)0.0741 (11)
H10A型0.88960.49660.24060.089*0.50
H10B型0.93570.62580.31500.089*0.50
H10C型0.92840.56850.31960.089*0.50
H10D型0.88030.51620.19060.089*0.50
C11号机组0.9331 (8)0.6453 (9)0.1524 (10)0.084 (3)0.50
H11A型1.03120.63830.19100.101*0.50
H11B型0.90400.58440.08660.101*0.50
第12项0.9033 (8)0.7784 (9)0.1027 (9)0.080 (3)0.50
H12A型0.92310.84140.16630.095*0.50
H12B型0.96360.79780.06460.095*0.50
第13页0.7655 (4)0.7984 (4)0.0191 (4)0.0742 (11)
H13A型0.74780.73880.04650.089*0.50
H13B型0.75740.88820.01090.089*0.50
H13C型0.78920.89170.02650.089*0.50
H13D(H13D)0.72770.77670.06390.089*0.50
C11A型0.9460 (7)0.7015 (8)0.2099 (6)0.064 (2)0.50
H11C型1.04300.68520.24250.076*0.50
H11D型0.93030.78200.24500.076*0.50
C12A型0.8942 (7)0.7187 (10)0.0800 (6)0.063 (2)0.50
H12C型0.87920.63120.04470.075*0.50
H12D型0.96530.76020.06320.075*0.50
第14项0.6593 (4)0.7779 (3)0.0635 (4)0.0691 (10)
H14A型0.67750.83610.13010.083*
H14B型0.57240.80340.00270.083*
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
N1型0.0375 (12)0.0423 (12)0.0466 (13)0.0031 (9)0.0162 (10)0.0095 (10)
指挥与控制0.0548 (17)0.0472 (16)0.0523 (17)0.0039 (13)0.0193 (13)0.0000 (13)
C3类0.0609 (19)0.072 (2)0.0455 (17)0.0014 (16)0.0176 (14)0.0017 (15)
补体第四成份0.035 (3)0.065 (4)0.051 (4)0.015 (3)0.017 (3)0.029 (3)
C5级0.037 (3)0.045 (4)0.076 (5)0.008 (3)0.024 (3)0.024 (3)
C6级0.068 (2)0.0451 (17)0.070 (2)0.0068 (14)0.0182 (17)0.0013 (15)
C4A公司0.065 (5)0.079 (5)0.057 (4)0.008 (4)0.024 (4)0.027 (4)
C5A公司0.085 (6)0.043 (4)0.081 (6)0.018 (4)0.038 (5)0.019 (3)
抄送70.0635 (19)0.0502 (18)0.0505 (18)0.0010 (14)0.0064 (15)0.0010 (13)
N8号0.0340 (12)0.0463 (13)0.0486 (13)0.0034 (9)0.0158 (10)0.0062 (10)
C9级0.0589 (19)0.093 (3)0.0486 (18)0.0053 (18)0.0188 (15)0.0027 (17)
C10号机组0.0470 (18)0.092 (3)0.063 (2)0.0029 (17)0.0019 (16)0.0085 (19)
C11号机组0.038 (4)0.085 (6)0.124 (9)0.006 (4)0.029 (5)0.007 (6)
第12项0.057 (5)0.085 (7)0.092 (7)0.048 (5)0.026 (5)0.024 (5)
第13页0.077 (2)0.058 (2)0.095 (3)0.0026 (17)0.043 (2)0.0181 (18)
C11A型0.035 (3)0.072 (5)0.062 (4)0.017 (3)0.003 (3)0.014 (4)
C12A型0.035 (4)0.088 (7)0.062 (5)0.028 (4)0.017 (3)0.003 (5)
第14项0.063 (2)0.0527 (18)0.094 (3)0.0112 (16)0.0354 (19)0.0114 (18)
几何参数(λ,º) 顶部
N1-C7型1.446 (4)编号8-C141.444 (4)
N1-C2型1.449 (4)N8-C9型1.449 (4)
N1-H1型0.90 (2)N8-H8型0.90 (3)
C2-C3型1.524 (4)C9-C10型1.498 (5)
C2-H2A型0.99C9-H9A型0.99
C2-H2B型0.99C9-H9B型0.99
C3-C4型1.523 (6)C10-C11号机组1.542 (8)
C3-H3A型0.99C10-H10A型0.99
C3-H3B型0.99C10-H10B型0.99
C4-C5型1.525 (7)C11-C12号机组1.490 (8)
C4-H4A型0.99C11-H11A型0.99
C4-H4B型0.99C11-H11B型0.99
C5至C61.503 (7)C12-C13型1.470 (8)
C5-H5A型0.99C12-小时12a0.99
C5-H5B型0.99C12-H12B型0.99
C6至C71.515 (4)C13至C141.509 (5)
C6-H6A型0.99C13-H13A型0.99
C6-H6B型0.99C13-H13B型0.99
C4A-C5A型1.498 (8)C11A-C12A型1.524 (8)
C4A-H4C型0.99C11A-H11C段0.99
C4A-H4D飞机0.99C11A-H11D型0.99
C5A-H5C型0.99C12A-H12C型0.99
C5A-H5D型0.99C12A-H12D型0.99
C7-H7A型0.99C14-H14A型0.99
C7-H7B型0.99C14-H14B型0.99
C7-N1-C2型112.3 (2)C14-N8-C9型113.3 (3)
C7-N1-H1型107.9 (18)C14-N8-H8型110 (2)
C2-N1-H1型109.0 (18)C9-N8-H8型106 (2)
N1-C2-C3型114.2 (2)N8-C9-C10型114.8 (3)
N1-C2-H2A型108.7N8-C9-H9A型108.6
C3-C2-H2A108.7C10-C9-H9A型108.6
N1-C2-H2B型108.7N8-C9-H9B108.6
C3-C2-H2B108.7C10-C9-H9B型108.6
H2A-C2-H2B型107.6H9A-C9-H9B107.5
C4-C3-C2型117.4 (3)C9-C10-C11119.1 (4)
C4-C3-H3A型108C9-C10-H10A107.5
C2-C3-H3A型108C11-C10-H10A型107.5
C4-C3-H3B型108C9-C10-H10B107.5
C2-C3-H3B型108C11-C10-H10B型107.5
H3A-C3-H3B型107.2H10A-C10-H10B型107
C3-C4-C5型114.8 (5)C12-C11-C10123.0 (8)
C3-C4-H4A型108.6C12-C11-H11A型106.6
C5-C4-H4A型108.6C10-C11-H11A型106.6
C3-C4-H4B型108.6C12-C11-H11B型106.6
C5-C4-H4B108.6C10-C11-H11B型106.6
H4A-C4-H4B型107.5H11A-C11-H11B型106.5
C6-C5-C4113.4 (5)C13-C12-C11114.8 (6)
C6-C5-H5A型108.9C13-C12-H12A型108.6
C4-C5-H5A型108.9C11-C12-H12A型108.6
C6-C5-H5B型108.9C13-C12-H12B108.6
C4-C5-H5B型108.9C11-C12-H12B型108.6
H5A-C5-H5B型107.7H12A-C12-H12B型107.5
C5-C6-C7111.6 (4)C12-C13-C14型116.0 (6)
C5-C6-H6A109.3C12-C13-H13A型108.3
C7-C6-H6A型109.3C14-C13-H13A型108.3
C5-C6-H6B型109.3C12-C13-H13B108.3
C7-C6-H6B型109.3C14-C13-H13B型108.3
H6A-C6-H6B型108H13A-C13-H13B型107.4
C5A-C4A-H4C108.1C12A-C11A-H11C型109.6
C5A-C4A-H4D108.1C12A-C11A-H11D型109.6
H4C-C4A-H4D型107.3H11C-C11A-H11D108.1
C4A-C5A-H5C型107.7C11A-C12A-H12C型107.9
C4A-C5A-H5D型107.7C11A-C12A-H12D107.9
H5C-C5A-H5D型107.1H12C-C12A-H12D型107.2
N1-C7-C6114.6 (3)N8-C14-C13型114.4 (3)
N1-C7-H7A型108.6N8-C14-H14A108.7
C6-C7-H7A型108.6C13-C14-H14A型108.7
N1-C7-H7B型108.6N8-C14-H14B108.7
C6-C7-H7B型108.6C13-C14-H14B108.7
H7A-C7-H7B型107.6H14A-C14-H14B107.6
C7-N1-C2-C386.5 (3)C14-N8-C9-C10型80.7 (4)
N1-C2-C3-C428.7 (5)N8-C9-C10-C11号24.7 (7)
C2-C3-C4-C5型44.9 (6)C9-C10-C11-C1241.5 (11)
C3-C4-C5-C6型85.3 (7)C10-C11-C12-C1370.5 (14)
C4-C5-C6-C7型70.5 (6)C11-C12-C13-C1460.4 (11)
C2-N1-C7-C685.2 (3)C9-N8-C14-C1387.7 (4)
C5-C6-C7-N162.3 (4)C12-C13-C14-N8型64.6 (6)
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-小时···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-小时···A类
N8-H8···N10.90 (3)2.27 (3)3.167 (3)176 (3)
N1-H1··N80.90 (2)2.25 (3)3.150 (3)175 (2)
对称代码:(i)x+1,+1,z(z).

实验细节

(一)(二)(三)
水晶数据
化学配方CH(H)7N个C4H(H)9N个C6H(H)13N个
M(M)第页57.1071.1299.17
晶体系统,空间组单诊所,P(P)21/c(c)单诊所,P(P)21/c(c)单诊所,P(P)21/n个
温度(K)170170170
,b条,c(c)(Å)9.507 (3), 9.122 (3), 9.790 (3)8.6753 (8), 5.2078 (5), 10.7108 (10)11.0201 (14), 10.3027 (13), 12.7322 (15)
β(°)117.469 (4)110.451 (3)114.110 (5)
V(V))753.3 (4)453.41 (7)1319.5 (3)
Z轴848
辐射类型K(K)αK(K)αK(K)α
µ(毫米1)0.060.060.06
晶体尺寸(mm)1.00×0.33(半径)0.35×0.15(半径)0.35×0.15(半径)
数据收集
衍射仪布吕克智能 CCD区域探测器
衍射仪
Bruker Nonius X8 APEXII CCD区域探测器
衍射仪
Bruker Nonius X8 APEXII CCD区域探测器
衍射仪
吸收校正多扫描
(SADABS公司; 布鲁克,2003年)
多扫描
(SADABS公司; 布鲁克,2003年)
多扫描
(SADABS公司; 布鲁克,2003年)
T型最小值,T型最大值0.688, 0.9600.853, 0.9770.688, 0.981
测量的、独立的和
观察到的[> 2σ()]反射
4439, 1782, 11445429, 900, 76016092, 2509, 1824
R(右)整数0.0350.0260.051
(罪θ/λ)最大值1)0.6670.6180.614
精炼
R(右)[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司0.056, 0.162, 1.040.042, 0.110, 1.060.083, 0.269, 1.12
反射次数17829002509
参数数量8350173
约束装置数量0014
氢原子处理用独立和约束精化的混合物处理H原子用独立和约束精化的混合物处理H原子用独立和约束精化的混合物处理H原子
Δρ最大值, Δρ最小值(eÅ))0.18,0.180.16,0.130.29,0.22

计算机程序:智能(布鲁克,1997),4月2日(布鲁克,2004),圣保罗(布鲁克,2003),92新加坡元(阿尔托马雷等。, 1994),SHELXTL公司(Sheldrick,2008)和水银(麦克雷等。, 2006).

(I)的氢键几何(λ,º) 顶部
D类-小时···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-小时···A类
N5-H5···N10.86 (2)2.27 (2)3.120 (2)171.5 (15)
N1-H1··N50.87 (2)2.24 (2)3.102 (2)174.4 (16)
对称代码:(i)x+1,+1/2,z(z)+1/2.
(II)的氢键几何(λ,º) 顶部
D类-小时···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-小时···A类
N1-H1··N10.84 (2)2.35 (2)3.1716 (13)163.7 (15)
对称代码:(i)x,1/2,z(z)+1/2.
(III)的氢键几何结构(Å,º) 顶部
D类-小时···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-小时···A类
N8-H8···N10.90 (3)2.27 (3)3.167 (3)176 (3)
N1-H1··N80.90 (2)2.25 (3)3.150 (3)175 (2)
对称代码:(i)x+1,+1,z(z).
 

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