结晶信息文件(CIF)https://doi.org/10.107/S0108270103023710/sk1672sup1.cif 包含全局数据块,I
结构系数文件(CIF格式)https://doi.org/10.1107/S108270103023710/sk1672Isup2.hkl 包含数据块I
CCDC参考:229092
二膦酸盐是重要的骨重塑介质,通常用作抗吸附剂。在这种情况下,它们被用于治疗骨质疏松症、高钙血症和溶骨性转移(Compston,1994;Martin&Grill,2000)。这类化合物已证明其在广泛应用中的用途,例如除草剂(Chuiko等。, 1999; 戈登-周等。,《抗寄生虫学》(Docampo,2001;Martin等。,2001),降胆固醇药物(Hiyoshi等。, 2000; 尼索等。,2001),治疗躁郁症的药物(Atack等。, 1993; Faurux&Freeman,1999),抗炎药和抗关节炎(Schlachter等。,1998年)和重量级脱企业代理(福田等。, 1999). 正如对几种含N的二膦酸盐所观察到的那样,PHPBP是一种有效的抗再吸收剂,其效力与常用药物阿仑膦酸盐、奥帕膦酸盐和帕胺膦酸盐相当(Widler等。, 2002). 另一项研究的结果表明,PHPBP作为降胆固醇剂(阿明等。, 1992).
我们对通过单晶X射线晶体学研究PHPBP(I)的兴趣源于我们之前对烷基氨基主链构象的观察(织女星等。, 2002; Fernández和Vega,2003年)。因此,对(I)进行了结构测定,并在此处给出了工作结果。\sch公司
化合物(I)(图1)是两性离子:膦原子O1电离,H原子转移到采用四面体几何结构的原子N1(表1)。正如之前在相关化合物(织女星)中观察到的那样,这种行为在胺基二磷酸盐中并不罕见等。, 2002; 范布鲁塞尔等。, 2003; Fernández和Vega,2003年)。原子P1和P2的几何形状为四面体,分别由原子O1、O2和O3以及原子O4、O5和O6定义。在前一组中,O-P-O和O-P-C键角范围为106.28(8)至114.70(9)°,而在第二组中,该值介于104.62(9)至113.39(8)°之间。最大的角度是O1-P1-O3,它是由一对未调变的原子O1和O3形成的。对于P,P-O键距离(表1)接近1.50Ω═O债券(P1═O3和P2═O5),质子化原子(P1-O2和P2-O4)约为1.55℃。就这些值而言,P1-O1和P2-O6键距离是中间的,这表明键的顺序介于单键和双键之间。当考虑到这些原子所参与的分子间相互作用时,可以找到对这一事实的解释,因为它们形成氢键(表2)。
(I)中的P-C键距离与相关化合物的P-C距离一致。此外,P-C-P键角(表1)的值完全在其他含有C-C-C-N链的二膦酸盐观察到的范围内(109.91–114.23°;Fernández和Vega,2003年)。这个服务提供商三-杂交原子C2具有扭曲的四面体几何结构,如C1-C2-C3键角的115.84(16)°所示。这一事实可归因于原子C2和C3与一些膦酰基O原子之间的排斥作用,即C2-H9··O5[D··a 3.051(3)Au,H··a 2.58 Au和D-H··A110°]以及C3-H10··O1[D··a 3.019(3)Eu,H··a 2.59 Au和D··A108°]。
C-C-C-N链的构象接近反式,C1-C2-C3-N1扭转角为167.02(16)°。这种构象在相关的胺基二磷酸中普遍存在,例如1-羟基-3-(1-吡咯烷基)丙基-1,1-二磷酸(EB 1053;Fernández&Vega,2003)。尽管(I)和该吡咯烷基二膦酸盐之间的分子相似,但C2-C3键相对于P-C-P桥的布置不同。在(I)中,C2-C3键为反式关于C1-P2键[P2-C1-C2-C3 176.44(16)°]高卢人关于C1-P1键[P1-C1-C3 54.7(2)°]。对于吡咯烷基二膦酸酯,C2-C3键为高卢人对于这两种键,相应的扭转角分别为−43.6(2)和85.46(19)°。
如O7-C1-C2-C3扭转角的值[−70.3(2)°]所示,羟基原子O7相对于C-C-C-N链的取向为高卢人这表明,(I)中O-C-C-N主链周围的构象类似于3-氨-1-羟丙基-1,1-二磷酸二钠五水合物(帕米膦酸盐)中的构象,但与主链为平面的吡咯烷基二磷酸酯的构象不同(Fernández&Vega,2003)。如前所述,这可能是羟基O原子参与的分子间相互作用的结果。虽然O7原子在(I)和吡咯烷基二膦酸盐中作为施主形成了类似的相互作用,但在后者[D··a 3.011(2)Au,H··a 2.41 Au和D-H··A129°]中,它是弱于(I)的受主(见表2)。鉴于可用证据的数量有限,在之前的工作中曾指出,骨架的构象是由N原子的原子取代模式定义的(Fernández&Vega,2003)。根据这里给出的结果,很明显,这并不是O-C-C-C-N主链稳定性的主要贡献者,而是来自氢键。
(I)中的哌啶环相对于六元环(Duax)的最对称构象折叠等。, 1976). 序列N1/C4/C5/C6/C7/C8的吸环参数(Cremer&Pople,1975)为q20.011(2)Å,q三0.577(2)Ω和直径245 (12)°. 相位值表明环的构象几乎是完美的椅子(艾伦等。, 1991). 原子N1和C6分别位于距离C4/C5/C7/C8定义的最小二乘平面0.678(3)和-0.672(4)Au处(拟合原子的均方根偏差0.005 Au)。
(I)的氢键方案由O-H··O和N-H··O相互作用类型组成(表2)。膦基O原子之间的氢键将一对两性离子组装成一个头对头二聚体(图2)。参与这些相互作用的O原子,即原子O2、O3、O4和O5,形成一个八分子的P-O-H··O-P-O··H-O环。膦基原子O1、O5和O6以及羟基之间的相互作用使二聚体在平行于晶体b轴和c轴的平面内结合。哌啶环的N原子充当相邻两性离子的膦基和羟基O原子的氢键的分叉供体。
标题化合物的样品由Lize Binderup博士捐赠(LEO Pharmaceutical Products,Copenhagen,Denmark;LEO代号SL 2333)。通过在315 K的烘箱中缓慢蒸发水溶液,获得了适合X射线衍射的(I)晶体。
连接到O和N原子上的H原子的位置参数可以自由调整,而连接到C原子上的这些H原子则被视为骑自行车。所有H原子的位移参数都被限制为其宿主的1.2倍(对于那些与C原子结合的原子)或1.5倍(对于那些与O和N原子结合的原子)。使用DFIX公司命令在中实现SHELXL97型(谢尔德里克,1997年)。
数据收集:MSC/AFC衍射仪控制软件(分子结构公司,1993年);单元格细化:MSC/AFC衍射仪控制软件; 数据缩减:MSC/AFC衍射仪控制软件; 用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,1997);用于细化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,1997);分子图形:ZORTEP公司(Zsolnai&Pritzkow,1995);用于准备出版材料的软件:剑桥结构数据库(版本?;艾伦,2002),铂(斯佩克,2003)和WinGX公司(Farrugia,1999年)。
实验.F的细化2对抗所有反射。加权R(右)-因子水风险和拟合优度S基于F2,常规R(右)-因素R(右)基于F,对于负F,F设置为零2F的阈值表达式2>2西格玛(F2)仅用于计算R(右)-因子(gt)等.与选择反射进行细化无关。R(右)-基于F的系数2从统计上看,是基于F的因子的两倍,而基于ALL数据的R因子将更大。
几何图形.所有e.s.d.(除了两个l.s.平面之间二面角中的e.s.d.)均使用全协方差矩阵进行估计。在估计e.s.d.的距离、角度和扭转角时,单独考虑单元e.s.d;只有当e.s.d.的胞内参数由晶体对称性定义时,才使用它们之间的相关性。单元e.s.d.的近似(各向同性)处理用于估计涉及l.s.平面的e.s.d。
实验细节
计算机程序:MSC/AFC衍射仪控制软件(分子结构公司,1993年),MSC/AFC衍射仪控制软件,SHELXS97标准(谢尔德里克,1997),SHELXL97型(谢尔德里克,1997),ZORTEP公司(Zsolnai&Pritzkow,1995),剑桥结构数据库(版本?;Allen,2002),铂(斯佩克,2003)和WinGX公司(Farrugia,1999年)。