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蛋白质从头算仅根据序列数据预测的模型可以通过分子替换来解释晶体结构。然而,这样的计算从头算模型的计算成本通常很高。这里,一个基于聚类和截断的计算管道廉价地获得从头算描述了结构系综的制备模型。聚类用于选择模型并定量预测其局部精度,允许对预测的不准确区域进行合理截断。由此产生的集成,无论是否快速添加侧链,解决了43%的所有测试用例,所有α蛋白的成功率为80%。实施此方法的程序,充足的,包含在中央处理器4套程序。它只需要输入美国金融服务贸易协会序列文件和衍射数据文件。它使用本地安装的罗塞塔,创建搜索集合并自动执行分子替换和模型重建。

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可移植文档格式(PDF)文件https://doi.org/10.107/S090744912039194/tz5014sup1.pdf
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