未定义或部分精炼的大分子模型通常是不完整的，通常具有较大的坐标误差。结果表明，适用于完美部分结构的相位概率方程会导致在这种情况下对相位概率的不准确估计。因此，有必要使用推导出的方程，考虑到局部结构中的误差。给出了一种估计参数的方法σA类在这些相位中，由观测和计算的结构因子振幅得出的概率表达式。从σA类通过分辨率，可以估计模型的平均坐标误差。使用部分结构相计算的电子密度图偏向部分结构。当存在坐标误差时，非中心傅里叶系数的新表达式[（2米|F类N个| -D类|F类c（c）P（P）|)经验(iαc（c）P（P）)]需要抑制此模型偏差。通过比较电子密度图与正确结构图和部分结构图的相关系数来判断，这里导出的傅里叶系数优于当前使用的其他系数。
