单粒子跟踪数据中扩散模式的分类:基于特征与深度学习的方法

Patrycja Kowalek、Hanna Loch-Olszewska和Janusz Szwabiñski
物理。版本E100,032410–2019年9月20日出版

摘要

显微镜实验中测得的单粒子轨迹包含了有关一系列材料(包括活细胞和组织)中动态过程的重要信息。然而,由于粒子运动的随机性和采样噪声,提取这些信息并不是一项简单的任务。在本文中,我们采用一种称为卷积神经网络(CNN)的深度学习方法,从给定的轨迹中对扩散模式进行分类。我们将这种使用原始数据的全自动方法与需要数据预处理和从轨迹中提取人机工程特征的经典机器学习技术进行比较,以向分类器(如随机森林或梯度增强)提供数据。所有方法均使用已知基础物理模型的模拟轨迹进行测试。从结果可以看出,CNN通常略优于基于特征的方法,但代价是处理时间长得多。此外,仍有一些临界情况下,经典方法的表现优于CNN。

  • 图
  • 图
  • 图
  • 图
  • 图
  • 图
  • 图
3更多
  • 收到日期:2019年2月27日

内政部:https://doi.org/10.1103/PhysRevE.100.032410

©2019美国物理学会

物理学科标题(PhySH)

  1. 研究领域
生命系统物理学

作者和附属机构

帕特里卡·科瓦列克,Hanna Loch Olszewska酒店、和雅努斯·斯瓦宾斯基

  • 波兰Wrocław科技大学雨果·斯坦豪斯中心纯粹与应用数学学院,50-370

文章文本(需要订阅)

单击以展开

参考(需要订阅)

单击以展开
问题

第100卷,第。2019年9月3日

重用权限(&P)
Access选项
翻译和文案辅助广告的作者出版服务

需要授权


×
×

图像

×

注册以接收来自的定期电子邮件警报物理审查E

登录

取消
×

搜索


文章查找

粘贴引文或DOI

输入引文
×