摘要

提出了一种图形化方法,用于显示一组对齐序列中的图案。对于对齐序列中的每个位置,表示序列的字符将堆叠在一起。每个字母的高度与其频率成比例,并且对字母进行排序,使最常见的字母位于顶部。然后调整整个堆栈的高度,以表示该位置序列的信息内容。从这些“序列标识”中,人们不仅可以确定一致序列,还可以确定碱基的相对频率以及站点或序列中每个位置的信息内容(以比特为单位)。该标志显示了显著的残基和微妙的序列模式。

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