一种基于知识的信令网络表示和推理方法

动机：在本文中，我们建议使用知识表示语言和推理方法的最新发展来表示和推理信令网络。我们的方法不同于大多数其他定性系统生物学方法，因为它基于推理（或推论）而不是模拟。我们的方法的一些优点是，我们可以利用不完全和部分信息推理的最新进展来处理信号网络知识中的缺口；并能进行各种推理，如规划、假设推理和解释观察结果。

结果：使用我们的方法，我们开发了用于表示和推理信号网络的系统BioSigNet RR。我们使用NFκB相关的信号通路来说明我们的系统目前可以进行的推理和表示。

可利用性：该系统可在Web上访问网址：http://www.public.asu.edu/~cbaral/生物火成岩