利用贝叶斯推理降低cDNA微阵列图像处理的可变性

动机：通过从幻灯片扫描图像中提取像素强度，从微阵列实验中获得基因表达水平。众所周知，使用相同软件包的不同用户从相同图像中提取的表情水平可能会发生变化。这些不一致是由于微阵列“网格”位置的精细化差异造成的。我们引入了一种新的自动化方法来细化网格布局，该方法基于贝叶斯推理，用于确定微阵列“点”的大小、形状和位置，捕获可传递给下游分析的不确定性。

结果：我们的实验表明，使用该方法可以显著降低用户之间的可变性。该方法的自动化特性还节省了研究人员通常用于优化网格布局的数小时时间。

可利用性：我们的实验中使用的算法和幻灯片的tiff图像的MATLAB实现，以及重新创建它们所需的代码，可从以下网站获得非商业用途：http://www.dcs.shef.ac.uk/~neil/VIS公司