Leslie M.Cope、Rafael A.Irizarry、Harris A.Jaffee、Zhijin Wu、Terence P.Speed，Affymetrix基因芯片表达测量基准，生物信息学，第20卷，第3期，2004年2月，第323–331页，https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btg410
动机：寡核苷酸表达阵列的定义特征是使用多个探针来分析每个目标转录物。这对统计遗传学家来说是一笔财富，他们可以创建具有特定特征的有问题的总结。现在有几种方法可用于汇总流行Affymetrix GeneChips的探针级数据，但很难确定用于给定查询的最佳方法。
结果：我们开发了一个图形工具，用于评估Affymetrix探测级别数据的摘要。绘图和汇总统计提供了表达式度量在几个重要领域的表现。这张图片有助于比较竞争性表达方法和选择适合特定调查的方法。关键是由稀释研究和峰值研究组成的基准数据集。因为这些数据的真相是已知的，所以我们可以提前确定预期结果已知的数据的统计特征。在我们的图表套件中突出显示的这些特征是由生物兴趣的问题所证明的，并且是由适当数据的存在所激发的。
可利用性：结合发布图形工具箱作为Bioconductor项目的一部分(http://www.bioconductor.org)，Web工具位于http://affycomp.biostat.jhsph.edu。补充材料可在网址：http://www.biostat.jhsph.edu/~ririzarr/papers/suppaffycomp.pdf
信件应寄给谁。
约翰·霍普金斯大学数学科学系，地址：104 Whitehead Hall，3400 North Charles Street，Baltimore，MD 21218，USA；约翰·霍普金大学生物统计系，地址为615 N.Wolfe Street，Barltimore，MD 21105，USA，以及3加州大学伯克利分校统计系，邮编：367 Evans Hall，Berkeley，CA 94720，USA
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