目前，人类因子H蛋白家族代表七种多域、多功能血清蛋白。该组包括补体和免疫调节因子H、因子H样蛋白1（FHL-1）和五种因子H相关蛋白（FHR-1、-2、-3、-4和-5）。每一个都由单独折叠的蛋白质结构域组成，称为短一致重复序列（SCR）或补体控制模块。结构-功能分析允许将因子H和FHL-1的补体调节域定位在SCR 1-4的N末端区域。此外，C3b、肝素和微生物表面蛋白的多个结合位点定位于因子H和FHL-1的N末端、中间区域以及C末端。最近的结果表明，因子H的C末端（即SCRs 19-20）发挥着中心作用。这些特殊结构域在迄今为止确定的所有FHR中都是保守的，包括C3b、肝素和微生物表面蛋白的接触点，并代表了患有因子H相关型溶血尿毒综合征患者基因突变的“热点”。
