DBTSS;转录起始点数据库。
为了支持转录调控研究,我们构建了DBTSS,它根据我们独特的经实验验证的TSS测序方法TSS-seq表示基因组中转录起始位点(TSS)的准确位置。该数据库包括人类成人和胚胎组织主要部分的DBTSS数据。DBTSS现在包含4.91亿TSS标签序列,用于从总共20个组织和7个细胞培养物中收集。我们还整合了新生成的亚细胞分离RNA的RNA-seq数据和组蛋白修饰的ChIP-seq数据、RNA聚合酶II和培养细胞系中的几个转录调控因子。我们还包括最近积累的外部表观基因组数据,如ENCODE项目的染色质图谱。
综上所述,我们提供了一种独特的数据资源,用于调查在各种样本的特定基因组坐标中观察到的基因组特征。我们认为,新的DBTSS有助于理解大规模鉴定的TSS的生物学后果,并确定与无序转录调控相关的人类遗传估值。
基金:
DBTSS公司由JSPS支持,授予ID为221S0002
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