弗兰克·T·伯格曼
人员信息
其他同名人员
优化列表
2020年–今天
2024 [j35] 卢西安·史密斯 , 弗兰克·T·伯格曼 , 阿兰·加里 , 托马斯·赫利卡尔 , 乔纳森·R·卡尔 , 大卫·P·尼克森 , 赫伯特·M·索罗 , 达格马尔·沃尔特马 , 马蒂亚斯·科尼格 :
模拟实验描述标记语言(SED-ML):1级版本5的语言规范。 J.整合。 生物信息。 21 ( 1 ) ( 2024 ) 2023 [公元34年] 詹姆斯·沙夫 , Anuradha Lakshminarayana公司 , 罗伯特·墨菲 , 弗兰克·T·伯格曼 , 阿基拉·福纳哈西 , 德文·沙利文 , 卢西安·史密斯 :
SBML第3级包:空间过程,版本1,版本1。 J.整合。 生物信息。 20 ( 1 ) ( 2023 ) [公元33年] 弗兰克·T·伯格曼 :
BASICO:COPASI的简化Python接口。 J.开源软件。 8 ( 91 ) : 5553 ( 2023 ) 2022 [公元32年] 比拉尔·谢赫 , 卢西安·史密斯 , 丹·瓦西列斯库 , 马鲁皮氏Gnaneswara , 米高·威尔逊 , 埃兰·阿格蒙 , 亨利·阿格纽 , 史蒂文·安德鲁斯 , 阿兹拉夫·安瓦尔 , 莫里茨·贝伯 , 弗兰克·T·伯格曼 , 大卫·布鲁克斯 , 卢兹·布鲁什 , 劳伦斯·卡尔松 , Kiri Choi公司 , 乔舒亚·库珀·拉莫 , 约翰·德特洛夫 , 布莱恩·德劳特 , 米歇尔·杜蒙蒂尔 , G.Bard Ermentrout公司 , 詹姆斯·费德 , 安德鲁·弗雷伯格 , 费边·弗罗里奇(Fabian Fröhlich) , 阿基拉·福纳哈西 , 阿兰·加里 , 约翰·根纳里 , 帕德莱格·格莱森 , 安妮·戈尔泽 , 扎卡里·B·海曼 , 扬·哈塞纳(Jan Hasenauer) , 约瑟夫·海勒斯坦 , 亨宁·赫姆贾科布 , 斯特凡·霍普斯 , 乔恩·伊森 , 迭戈·扬 , 亨利·雅库博夫斯基 , 瑞安·乔丹 , 马图斯·卡拉斯 , 马蒂亚斯·科尼格 , 沃尔夫拉姆·利伯梅斯特 , Rahuman S.Malik警长 , Synchon Mandal公司 , 罗伯特·麦克杜格尔 , J.Kyle混合泳 , 柏度·文迪斯 , 罗伯特·米勒 , 克里斯·迈尔斯 , 奥雷连·纳尔迪 , 董文新阮 , 大卫·P·尼克森 , 布雷特·奥利维尔 , 德拉什蒂·帕托利娅 , 洛伊克·保列夫 , 琳达·R·佩佐德 , 安基塔·普里亚 , 阿南德·兰帕达拉斯(Anand K.Rampadarath) , 约翰·罗威尔(Johann M.Rohwer) , 阿里·西南·萨格拉姆 , 迪拉瓦尔·辛格 , 安库尔·辛哈 , 杰基·斯诺普 , 休·索比 , 瑞安·斯潘格勒 , Jörn Starruß , 佩顿·J·托马斯 , 大卫·D·范·尼克尔 , 丹尼尔·温德尔 , 张丰凯 , 安娜·朱科娃 , 亚瑟·P·戈德堡 , 詹姆斯·沙夫 , 迈克尔·布林诺夫 , 赫伯特·M·索罗 , Ion I.莫拉鲁 , 乔纳森·R·卡尔 :
BioSimulators:用于推荐特定工具的模拟引擎和服务的中央注册中心。 核酸研究。 50 ( 第1周 ) : 108-114 ( 2022 ) [i3] 比拉尔·谢赫 , 卢西安·史密斯 , 丹·瓦西列斯库 , 马鲁皮氏Gnaneswara , 米高·威尔逊 , 埃兰·阿格蒙 , 亨利·阿格纽 , 史蒂文·安德鲁斯 , 阿兹拉夫·安瓦尔 , 莫里茨·贝伯 , 弗兰克·T·伯格曼 , 大卫·布鲁克斯 , 卢兹·布鲁什 , 劳伦斯·卡尔松 , Kiri Choi公司 , 乔舒亚·库珀·拉莫 , 约翰·德特洛夫 , 布莱恩·德劳特 , 米歇尔·杜蒙蒂尔 , G.Bard Ermentrout公司 , 詹姆斯·费德 , 安德鲁·弗雷伯格 , 费边·弗罗里奇(Fabian Fröhlich) , 阿基拉·福纳哈西 , 阿兰·加里 , 约翰·根纳里 , 帕德莱格·格莱森 , 安妮·戈尔泽 , 扎卡里·B·海曼 , 约瑟夫·海勒斯坦 , 斯特凡·霍普斯 , 乔恩·伊森 , 迭戈·扬 , 亨利·雅库博夫斯基 , 瑞安·乔丹 , 马图斯·卡拉斯 , 马蒂亚斯·科尼格 , 沃尔夫拉姆·利伯梅斯特 , Synchon Mandal公司 , 罗伯特·麦克杜格尔 , J.Kyle混合泳 , 柏度·文迪斯 , 罗伯特·米勒 , 克里斯·迈尔斯 , 奥雷连·纳尔迪 , 董文新阮 , 大卫·P·尼克森 , 布雷特·奥利维尔 , 德拉什蒂·帕托利娅 , 洛伊克·保列夫 , 琳达·R·佩佐德 , 安基塔·普里亚 , 阿南德·兰帕达拉斯(Anand K.Rampadarath) , 约翰·罗威尔(Johann M.Rohwer) , 阿里·西南·萨格拉姆 , 迪拉瓦尔·辛格 , 安库尔·辛哈 , 杰基·斯诺普 , 休·索比 , 瑞安·斯潘格勒 , Jörn Starruß , 佩顿·J·托马斯 , 大卫·D·范·尼克尔 , 丹尼尔·温德尔 , 张丰凯 , 安娜·朱科娃 , 亚瑟·P·戈德堡 , 迈克尔·布林诺夫 , 赫伯特·M·索罗 , Ion I.莫拉鲁 , 乔纳森·R·卡尔 :
BioSimulators:用于推荐特定工具的模拟引擎和服务的中央注册中心。 CoRR公司 abs/2203.06732 ( 2022 ) 2021 [公元31年] 乔纳斯·弗斯特 , 弗兰克·T·伯格曼 , 尤尔根·帕勒 :
CoRC:COPASI R连接器。 生物信息。 37 ( 17 ) : 2778-2779 ( 2021 ) 【j30】 卢西安·史密斯 , 弗兰克·T·伯格曼 , 阿兰·加里 , 托马斯·赫利卡尔 , 乔纳森·R·卡尔 , 大卫·P·尼克森 , 赫伯特·M·索罗 , 达格马尔·沃尔特马 , 马蒂亚斯·科尼格 :
模拟实验描述标记语言(SED-ML):第1级版本4的语言规范。 J.整合。 生物信息。 18 ( 三 ) ( 2021 ) [公元29年] 伦纳德·施密斯特 , Yannik Schälte , 弗兰克·T·伯格曼 , 塔西奥·坎巴 , 埃里卡·杜德金 , 珍妮·埃格特 , 费边·弗罗里奇(Fabian Fröhlich) , 劳拉·富尔曼 , 阿德里安·豪伯 , 斯文加·凯默 , 波琳娜·拉克里森科 , 卡罗琳·卢斯 , 西蒙·默克 , 沃尔夫冈·米勒 , 迪兰·帕西拉纳 , 埃尔巴·雷蒙德斯-阿尔瓦雷斯 , 卢卡斯·雷西施 , 马库斯·罗森布拉特 , 保罗·斯塔波尔 , 菲利普·施塔特 , 王丹彤 , 弗兰兹·乔治·威兰德 , 朱利奥·班加 , 延斯·蒂默 , 亚历杭德罗·维拉弗德 , 斯文·萨赫勒 , 克莱门斯·克鲁茨 , 扬·哈塞纳(Jan Hasenauer) , 丹尼尔·温德尔 :
PEtab-系统生物学中参数估计问题的互操作规范。 公共科学图书馆计算。 生物。 17 ( 1 ) ( 2021 ) 2020 [公元28年] 弗兰克·T·伯格曼 , 托比亚斯·查德纳 , 乌古尔·多格鲁索斯 , 阿德里安·罗格尼 , 安德烈亚斯·德格 , 瓦桑德拉·图雷 , 亚历山大·马泽因 , 迈克尔·布林诺夫 , 奥古斯汀·卢纳 :
系统生物学图形符号标记语言(SBGNML)0.3版。 J.整合。 生物信息。 17 ( 2-3 ) ( 2020 ) [公元27年] 卢西安·史密斯 , 斯图亚特·穆迪 , 弗兰克·T·伯格曼 , 科林·吉莱斯皮 , 莎拉·基廷 , 马蒂亚斯·科尼格 , 克里斯·迈尔斯 , Maciek J.斯瓦特 , 达伦·威尔金森 , 迈克尔·哈卡 :
系统生物学标记语言(SBML)第3级包:分发,第1版,第1次发布。 J.整合。 生物信息。 17 ( 2-3 ) ( 2020 )
2010 – 2019
2019 [公元26年] 迈克尔·哈卡 , 弗兰克·T·伯格曼 , 克劳丁·朝义亚(Claudine Chaouiya) , 安德烈亚斯·德格 , 斯特凡·霍普斯 , 莎拉·基廷 , 马蒂亚斯·科尼格 , 尼古拉斯·勒诺维尔 , 克里斯·迈尔斯 , 布雷特·奥利维尔 , 斯文·萨赫勒 , 詹姆斯·沙夫 , Rahuman S.Malik警长 , 卢西安·史密斯 , 达格马尔·沃尔特马 , 达伦·威尔金森 , 张丰凯 :
系统生物学标记语言(SBML):3级版本2核心版本2的语言规范。 J.整合。 生物信息。 16 ( 2 ) ( 2019 ) 2018 [公元25年] 约瑟夫·贝达索 , 弗兰克·T·伯格曼 , Kiri Choi公司 , 凯尔·梅德利 , 赫伯特·M·索罗 :
反应网络的便携式结构分析库。 生物晶体。 169-170 : 20-25 ( 2018 ) [公元24年] 弗兰克·T·伯格曼 , 乔纳森·库珀 , 马蒂亚斯·科尼格 , Ion I.莫拉鲁 , 大卫·P·尼克森 , 尼古拉斯·勒诺维尔 , 布雷特·奥利维尔 , 斯文·萨赫勒 , 卢西安·史密斯 , 达格马尔·沃尔特马 :
仿真实验描述标记语言(SED-ML)第1级第3版(L1V3)。 J.整合。 生物信息。 15 ( 1 ) ( 2018 ) [公元23年] 弗兰克·T·伯格曼 , 莎拉·基廷 , 拉尔夫计量器 , 斯文·萨赫勒 , 卡佳·温格勒 :
SBML Level 3软件包:Render,Version 1,Release 1。 J.整合。 生物信息。 15 ( 1 ) ( 2018 ) [公元22年] 迈克尔·哈卡 , 弗兰克·T·伯格曼 , 安德烈亚斯·德格 , 斯特凡·霍普斯 , 莎拉·基廷 , 尼古拉斯·勒诺维尔 , 克里斯·迈尔斯 , 布雷特·奥利维尔 , 斯文·萨赫勒 , 詹姆斯·沙夫 , 卢西安·史密斯 , 达格马尔·沃尔特马 , 达伦·威尔金森 :
系统生物学标记语言(SBML):3级版本1核心的语言规范。 J.整合。 生物信息。 15 ( 1 ) ( 2018 ) [公元21年] 迈克尔·哈卡 , 弗兰克·T·伯格曼 , 安德烈亚斯·德格 , 斯特凡·霍普斯 , 莎拉·基廷 , 尼古拉斯·勒诺维尔 , 克里斯·迈尔斯 , 布雷特·奥利维尔 , 斯文·萨赫勒 , 詹姆斯·沙夫 , 卢西安·史密斯 , 达格马尔·沃尔特马 , 达伦·威尔金森 :
系统生物学标记语言(SBML):3级版本2核心的语言规范。 J.整合。 生物信息。 15 ( 1 ) ( 2018 ) [j20] 布雷特·奥利维尔 , 弗兰克·T·伯格曼 :
SBML 3级软件包:通量平衡约束版本2。 J.整合。 生物信息。 15 ( 1 ) ( 2018 ) 2017 [公元19年] 弗兰克·T·伯格曼 , 大卫·P·尼克森 , 达格马尔·沃尔特马 , 马丁·沙姆 :
SED-ML网络工具:生成、修改和导出符合标准的仿真研究。 生物信息。 33 ( 8 ) : 1253-1254 ( 2017 ) 2016 [公元18年] 弗兰克·T·伯格曼 , 斯文·萨赫勒 , 克里斯托夫·齐默尔 :
COPASI中随机模型的分段参数估计。 生物信息。 32 ( 10 ) : 1586-1588 ( 2016 ) [公元17年] 蒂莫·卢比茨 , 延斯·哈恩 , 弗兰克·T·伯格曼 , Elad Noor公司 , 埃达·克利普 , 沃尔夫拉姆·利伯梅斯特 :
SBtab:系统生物学中用于数据交换的灵活表格格式。 生物信息。 32 ( 16 ) : 2559-2561 ( 2016 ) [公元16年] 达格马尔·沃尔特马 , 乔纳森·R·卡尔 , 弗兰克·T·伯格曼 , Vijayalakshmi Chelliah公司 , 迈克尔·哈卡 , 马库斯·克兰茨 , 沃尔夫拉姆·利伯梅斯特 , 柏度·文迪斯 , 克里斯·迈尔斯 , 皮纳尔·皮尔 , 贝格姆·阿拉贝奥格鲁 , 纳文·阿兰加纳桑 , 卡姆比兹·巴加利安 , 阿恩·T·比特格 , 保罗·平托·伯克 , 马蒂奥·坎塔雷利 , 尹勋洲 , 拉斐尔·科斯塔 , 约瑟夫·柯森 , 托比亚斯·查德纳 , 亚瑟·P·戈德堡 , 哈罗德·戈麦斯 , 延斯·哈恩 , 图尔·哈默里 , 丹尼尔·埃尔南德斯·加迪奥 , 丹尼斯·哈萨克维茨 , 伊利亚·基塞列夫 , 文森特·奈特·施里弗 , 克里斯蒂安·克努普费尔 , 马蒂亚斯·科尼格 , 李大元 , 奥达尔·洛特别墅 , 尼基塔·曼德里克 , J.Kyle混合泳 , 伯特兰·莫罗 , 霍贾特·纳代里·梅什金 , 苏希恩德拉·K·帕拉尼亚潘 , 丹尼尔·普列戈·埃斯皮诺萨 , 马丁·沙姆 , 马赫什·夏尔马 , 基兰·斯莫尔博内 , 娜塔莉·J·斯坦福 , Je-Hoon宋 , 汤姆·泰尔 , 米伦科·托基奇 , 纳姆拉塔·托马尔 , 瓦桑德拉·图雷 , 詹尼斯·乌伦多夫 , Thawfeek M.Varusai公司 , Leandro H.Watanabe公司 , 弗洛里安·温德兰 , 马库斯·沃尔芬恩 , 詹姆斯·尤尔科维奇 , 闫珠 , 扎地银汉藻 , 安娜·朱科娃 , 福尔克·施赖伯 :
面向全细胞建模的社区标准和软件。 IEEE传输。 生物识别。 工程师。 63 ( 10 ) : 2007-2014 ( 2016 ) [i2] 克里斯托夫·齐默尔 , 弗兰克·T·伯格曼 , 斯文·萨赫勒 :
利用分段评估和状态估计降低参数估计适应度景观中的局部极小值。 CoRR公司 abs/1601.04458 ( 2016 ) 2015 [公元15年] 弗兰克·T·伯格曼 , 乔纳森·库珀 , 尼古拉斯·勒诺维尔 , 大卫·P·尼克森 , 达格马尔·沃尔特马 :
仿真实验描述标记语言(SED-ML)1级版本2。 J.整合。 生物信息。 12 ( 2 ) ( 2015 ) [公元14年] 弗兰克·T·伯格曼 , 尼古拉斯·罗德里格斯 , 尼古拉斯·勒诺维尔 :
COMBINE存档规范第1版。 J.整合。 生物信息。 12 ( 2 ) ( 2015 ) [j13] 拉尔夫计量器 , 乌苏拉·罗斯特 , 斯文·萨赫勒 , 卡贾·温格勒 , 弗兰克·托马斯·伯格曼 :
系统生物学标记语言(SBML)3级包:布局,版本1核心。 J.整合。 生物信息。 12 ( 2 ) ( 2015 ) [公元12年] 迈克尔·哈卡 , 弗兰克·T·伯格曼 , 安德烈亚斯·德格 , 斯特凡·霍普斯 , 莎拉·基廷 , 尼古拉斯·勒诺维尔 , 克里斯·迈尔斯 , 布雷特·奥利维尔 , 斯文·萨赫勒 , 詹姆斯·沙夫 , 卢西安·史密斯 , 达格马尔·沃尔特马 , 达伦·威尔金森 :
系统生物学标记语言(SBML)第2级第5版:模型定义的结构和设施。 J.整合。 生物信息。 12 ( 2 ) ( 2015 ) [公元11年] 迈克尔·哈卡 , 弗兰克·T·伯格曼 , 斯特凡·霍普斯 , 莎拉·基廷 , 斯文·萨赫勒 , 詹姆斯·沙夫 , 卢西安·史密斯 , 达伦·威尔金森 :
系统生物学标记语言(SBML):3级版本1核心的语言规范。 J.整合。 生物信息。 12 ( 2 ) ( 2015 ) [公元10年] 布雷特·奥利维尔 , 弗兰克·T·伯格曼 :
系统生物学标记语言(SBML)3级包:通量平衡约束。 J.整合。 生物信息。 12 ( 2 ) ( 2015 ) 2014 [公元9年] 弗兰克·T·伯格曼 , 理查德·亚当斯 , 斯图亚特·穆迪 , 乔纳森·库珀 , Mihai Glont公司 , 马丁·戈勒比夫斯基 , 迈克尔·哈卡 , 卡米尔·莱布 , 安德鲁·米勒 , 大卫·P·尼克森 , 布雷特·奥利维尔 , 尼古拉斯·罗德里格斯 , 赫伯特·M·索罗 , 马丁·沙姆 , Stian Soiland眼睛 , 达格马尔·沃尔特马 , 弗洛伦特·伊冯 , 尼古拉斯·勒诺维尔 :
COMBINE存档和OMEX格式:一个文件,用于共享所有信息以重现建模项目。 BMC生物信息。 15 : 369 ( 2014 ) [i1] 弗兰克·T·伯格曼 , 理查德·亚当斯 , 斯图亚特·穆迪 , 乔纳森·库珀 , Mihai Glont公司 , 马丁·戈勒比夫斯基 , 迈克尔·哈卡 , 卡米尔·莱布 , 安德鲁·米勒 , 大卫·P·尼克森 , 布雷特·奥利维尔 , 尼古拉斯·罗德里格斯 , 赫伯特·M·索罗 , 马丁·沙姆 , Stian Soiland眼睛 , 达格马尔·沃尔特马 , 弗洛伦特·伊冯 , 尼古拉斯·勒诺维尔 :
组合存档:一个文件共享所有文件。 CoRR公司 abs/1407.4992 ( 2014 ) 2012 [j8] Martijn P.van Iersel公司 , 爱丽丝·维勒(Alice Villéger) , 托比亚斯·查德纳 , 莎拉·博伊德 , 弗兰克·T·伯格曼 , 奥古斯汀·卢纳 , 埃米克·德米尔 , 安纳托利·索罗金 , 乌古尔·多格鲁什 , 松冈由纪子 , 阿基拉·福纳哈西 , Mirit I.Aladjem公司 , 怀玉蜜 , 斯图亚特·穆迪 , 北野博树 , 尼古拉斯·勒诺维尔 , 福尔克·施赖伯 :
SBGN地图的软件支持:SBGN-ML和LibSBGN。 生物信息。 28 ( 15 ) : 2016-2021 ( 2012 ) 2011 [j7] 达格马尔·沃尔特马 , 理查德·亚当斯 , 弗兰克·T·伯格曼 , 迈克尔·哈卡 , 费多尔·科尔巴科夫 , 安德鲁·米勒 , Ion I.莫拉鲁 , 大卫·P·尼克森 , 斯文·萨赫勒 , 杰基·斯诺普 , 尼古拉斯·勒诺维尔 :
SED-ML的可复制计算生物学实验——模拟实验描述标记语言。 BMC系统。 生物。 5 : 198 ( 2011 ) [j6] 达格马尔·沃尔特马 , 理查德·亚当斯 , 丹尼尔·A·比尔德 , 弗兰克·T·伯格曼 , Upinder S.Bhalla公司 , 兰德尔·布里顿 , Vijayalakshmi Chelliah公司 , Mike T.冷却 , 乔纳森·库珀 , 埃德蒙·克拉宾 , 阿兰·加里 , 斯特凡·霍普斯 , 迈克尔·哈卡 , 彼得·亨特 , 埃达·克利普 , 卡米尔·莱布 , 安德鲁·米勒 , Ion I.莫拉鲁 , 大卫·P·尼克森 , Poul M.F.尼尔森 , 马查·尼科尔斯基 , 斯文·萨赫勒 , 赫伯特·M·索罗 , 亨宁·施密特 , 杰基·斯诺普 , 多米尼克·P·托勒 , 奥拉夫·沃尔肯豪尔 , 尼古拉斯·勒诺维尔 :
关于模拟实验(MIASE)的最少信息。 公共科学图书馆计算。 生物。 7 ( 4 ) ( 2011 ) [c2] 迈克尔·哈卡 , 弗兰克·T·伯格曼 , 莎拉·基廷 , 卢西安·史密斯 :
当今SBML兼容软件简介。 电子科学研讨会 2011 : 143-150 2010 [j5] 斯元申 , 弗兰克·T·伯格曼 , 赫伯特·M·索罗 :
SBML2TikZ:支持LaTeX中的SBML渲染扩展。 生物信息。 26 ( 21 ) : 2794-2795 ( 2010 )
2000 – 2009
2009 [j4] 卢西安·史密斯 , 弗兰克·T·伯格曼 , 迪帕克·钱德兰 , 赫伯特·M·索罗 :
锑:模块化模型定义语言。 生物信息。 25 ( 18 ) : 2452-2454 ( 2009 ) 2008 [j3] 弗兰克·T·伯格曼 , 赫伯特·M·索罗 :
比较支持SBML的模拟器的仿真结果。 生物信息。 24 ( 17 ) : 1963-1965 ( 2008 ) 2006 [注2] 阿纳斯塔西亚·戴卡德 , 弗兰克·T·伯格曼 , 赫伯特·M·索罗 :
支持SBML布局扩展。 生物信息。 22 ( 23 ) : 2966-2967 ( 2006 ) 【c1】 弗兰克·T·伯格曼 , 赫伯特·M·索罗 :
SBW-系统生物学的模块化框架。 WSC公司 2006 : 1637-1645 2005 [j1] 维杰·奇卡曼 , 斯里·帕拉杜古 , 弗兰克·T·伯格曼 , 赫伯特·M·索罗 :
分支发现工具。 生物信息。 21 ( 18 ) : 3688-3690 ( 2005 )