詹姆斯·泰勒0001 约翰霍普金斯大学生物系,美国马里兰州巴尔的摩 美国佐治亚州亚特兰大埃默里大学 https://www.taylorlab.org/people/james网站/ https://orcid.org/0000-0001-5079-840X https://www.wikidata.org/entity/Q30362443 https://www.researcherid.com/rid/F-1026-2011 詹姆斯·泰勒 詹姆斯·泰勒0002 詹姆斯·泰勒0002 ITAP,蒙彼利埃大学,INRAE,法国蒙彼利耶 英国纽卡斯尔大学农业学院 澳大利亚新南威尔士州悉尼大学农业学院 https://orcid.org/0000-0001-9709-8689 https://www.scopus.com/authid/detail.uri?authorId=55568519014 詹姆斯·泰勒0003 日本东京信息与系统研究组织
埃尼斯·阿夫根 安东·内克鲁滕科 比约恩·A·格林 丹尼尔·布兰肯伯格 杰里米·戈克斯 迈克尔·C·沙茨 亚历山大·奥斯特罗夫斯基 亚历山大·马哈茂德 安德鲁·罗尼 安娜·赛姆 安妮·福伊洛 安东尼·布雷托多 安纳普·库马尔 亚瑟·C·埃森劳尔 阿桑塔·德桑托 艾萨姆·格勒 比阿特丽斯·塞拉诺·索拉诺 贝雷尼斯·巴图特 布拉德利·兰霍斯特 布里吉特·卡尔 布莱恩·劳本诺 卡梅隆·海德 凯瑟琳·J·布罗姆黑德 克里斯托弗·巴奈特 科林·罗亚克斯 克里斯托巴尔·加拉多 丹尼尔·J·福尼卡 丹农·贝克 戴夫·鲍维尔 戴夫·金文斯 大卫·德利马·莫利斯 大卫·洛佩斯·塔伯内罗 德尔芬·拉里维埃 Engy Nasr公司 费德里科·赞贝利 弗洛里安·海尔 狐猴E.Psomopoulos 弗雷德里克·科彭斯 加雷思·普莱斯 吉安马罗·库库鲁 Gildas Le Corguillé 格雷戈里·冯·库斯特 Gulsum Gudukbay公司 海伦娜·拉什 汉斯·鲁道夫·霍茨 伊格纳西奥·埃吉诺阿 伊戈尔·马库宁 伊苏鲁·拉那瓦卡 詹姆斯·泰勒0001 贾亚德夫·乔希 詹妮弗·希尔曼·杰克逊 约翰·奇尔顿 凯万·卡马利 基思·苏德曼 克日什托夫·波特洛维奇 Yvan Le运动内衣 露西尔·洛佩兹·德利斯勒 卢克·萨金特 马德琳·E·巴塞蒂 马可·安东尼奥·坦加罗 马吕斯·范登·比克 马丁·切赫 马蒂亚斯·伯恩特 马蒂亚斯·法赫纳 穆罕默德·特克曼 梅兰妮·克里斯汀·福尔 迈克尔·克鲁索 米盖尔·隆科尼 娜塔莉·库彻 内特·科拉尔 尼古拉斯·斯托勒 尼克·罗德斯 尼古拉·索兰佐 尼科·平特 努万·古纳塞卡拉 巴勃罗·莫雷诺 巴凡库马尔·维德姆 佩特拉·梅兰妮 彼得罗·曼德雷利 普拉蒂克·贾格塔普 羌古 拉尔夫·J·M·韦伯 罗斯·拉扎罗斯 鲁本·霍德曼 萨西娅·希尔特曼 谢尔盖·戈利琴斯基 希尔帕加尔格 西蒙·布雷 西蒙·格拉德曼 西蒙·利奥 苏比纳·P·梅塔 蒂莫西·格里芬 瓦希德·贾利利 伊夫·范登布鲁克 维克托·温 维杰·纳坎帕利 文迪·A·培根 威廉·德科宁 沃尔夫冈·迈尔0003 彼得·布里格斯 用于可访问、可复制和协作生物医学分析的Galaxy平台:2022年更新。 345-351 2022 50 核酸研究。 第1周 https://doi.org/10.1093/nar/gkac247 https://www.wikidata.org/entity/Q117356136 db/journals/nar/nar50.html#AfganNGBGSOMLSF22
瓦希德·贾利利 埃尼斯·阿夫根 詹姆斯·泰勒0001 杰里米·戈克斯 云爆发星系:联合身份和访问管理。 1-9 2020 36 生物信息。 1 https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btz472 https://www.wikidata.org/entity/Q92734613 db/journals/bioinformatics/bioinformatics36.html#JaliliATG20
瓦希德·贾利利 埃尼斯·阿夫根 羌古 戴夫·金文斯 丹尼尔·布兰肯伯格 杰里米·戈克斯 詹姆斯·泰勒0001 安东·内克鲁滕科 用于可访问、可复制和协作生物医学分析的银河平台:2020年更新。 W395-W402型 2020 48 核酸研究。 Web服务器-发布 https://doi.org/10.1093/nar/gkaa434网址 https://www.wikidata.org/entity/Q96032715 db/journals/nar/nar48.html#JaliliAGCBG0N20
埃尼斯·阿夫根 安德鲁·罗尼 詹姆斯·泰勒0001 努万·古纳塞卡拉 CloudLaunch:发现和部署云应用程序。 802-810年 2019 94 未来一代。计算。系统。 https://doi.org/10.1016/j.future.2018.04.037 https://www.wikidata.org/entity/Q57002829 db/journals/fgcs/fgcs94.html#AfganLTG19
埃尼斯·阿夫根 丹农·贝克 贝雷尼斯·巴图特 马吕斯·范登·比克 戴夫·鲍维尔 马丁·切赫 约翰·奇尔顿 戴夫·金文斯 内特·科拉尔 比约恩·A·格林 艾萨姆·格勒 詹妮弗·希尔曼·杰克逊 萨西娅·希尔特曼 瓦希德·贾利利 海伦娜·拉什 尼古拉·索兰佐 杰里米·戈克斯 詹姆斯·泰勒0001 安东·内克鲁滕科 丹尼尔·布兰肯伯格 用于可访问、可复制和协作生物医学分析的Galaxy平台:2018年更新。 W537-W544型 2018 46 核酸研究。 Web服务器-发布 https://doi.org/10.1093/nar/gky379 https://www.wikidata.org/entity/Q55518659 db/journals/nar/nar46.html#AfganBBBBCCCCGG18
埃尼斯·阿夫根 瓦希德·贾利利 努万·古纳塞卡拉 詹姆斯·泰勒0001 杰里米·戈克斯 联邦星系:前沿的生物医学计算。 871-874 2018 IEEE云 https://doi.org/10.1109/CLOUD.2018.00124 https://doi.ieecomputersociety.org/10.1109/CLOUD.2018.00124 conf/IEECloud/2018 db/conf/IEEEcloud/IEEEcloud2018.html#AfganJG0G18
埃尼斯·阿夫根 安德鲁·罗尼 詹姆斯·泰勒0001 努万·古纳塞卡拉 CloudLaunch:发现和部署云应用程序。 2018 腹肌/1805.04005 CoRR公司 http://arxiv.org/abs/11805.04005 db/journals/corr/corr1805.html#abs-1805-04005
比约恩·A·格林 埃里克·拉什 鲍里斯·雷博莱多-贾拉米略 卡尔·埃伯哈特 托尔斯滕·霍瓦尔特 约翰·奇尔顿 内特·科拉尔 罗尔夫·巴科芬 詹姆斯·泰勒0001 安东·内克鲁滕科 Jupyter和Galaxy:为生物医学研究人员放宽复杂数据分析的进入壁垒。 2017 13 公共科学图书馆计算。生物。 5 https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1005425 https://www.wikidata.org/entity/Q36380048 db/journals/ploscb/ploscb13.html#GruningRREHCCBT17
埃尼斯·阿夫根 丹农·贝克 马吕斯·范登·比克 丹尼尔·布兰肯伯格 戴夫·鲍维尔 马丁·切赫 约翰·奇尔顿 戴夫·金文斯 内特·科拉尔 卡尔·埃伯哈特 比约恩·A·格林 艾萨姆·格勒 詹妮弗·希尔曼·杰克逊 格雷戈里·冯·库斯特 埃里克·拉什 尼古拉·索兰佐 尼特斯·图拉加 詹姆斯·泰勒0001 安东·内克鲁滕科 杰里米·戈克斯 用于可访问、可复制和协作生物医学分析的Galaxy平台:2016年更新。 W3-W10号机组 2016 44 核酸研究。 Web服务器-发布 https://doi.org/10.1093/nar/gkw343 https://www.wikidata.org/entity/Q34524689 db/journals/nar/nar44.html#AfganBBBBCCCCEG16
埃尼斯·阿夫根 安德鲁·罗尼 詹姆斯·泰勒0001 卡洛伊·斯卡拉 努旺古纳塞克拉 用于在云中部署和运行虚拟实验室的体系结构模型。 282-286 2016 MIPRO公司 https://doi.org/10.109/MIPRO.2016.7522153 conf/mipro/2016 db/conf/mipro/mipro2016.html#AfganLTSG16 克雷格·A·斯图尔特 大卫·Y·汉考克 马修·沃恩 杰里米·费舍尔 考克里尔 李黎明 Nirav C.商户 特蕾丝·米勒 约翰·迈克尔·洛 丹尼尔·斯坦齐奥内(Daniel C.Stanzione Jr.)。 詹姆斯·泰勒0001 埃德温·斯基德莫尔 Jetstream:性能、早期经验和早期结果。 22:1-22:8 2016 XSEDE公司 https://doi.org/10.1145/2949550.2949639 https://www.wikidata.org/entity/Q57539922 conf/xsede/2016年 db/conf/xsede/xsede 2016.html#StewartHVFCLMML16 努旺古纳塞克拉 安德鲁·罗尼 詹姆斯·泰勒0001 埃尼斯·阿夫根 CloudBridge:一个简单的跨云Python库。 37:1-37:8 2016 XSEDE公司 https://doi.org/10.1145/2949550.2949648 conf/xsede/2016年 db/conf/xsede/xsede 2016.html#GoonasekeraLTA16
尼特斯·图拉加 马洛里·安·弗里伯格 丹农·贝克 约翰·奇尔顿 银河队 安东·内克鲁滕科 詹姆斯·泰勒0001 银河系R/Bioconductor工具集成指南和最佳实践。 2757 2016 5 F1000研究 https://doi.org/10.12688/f1000research.9821.1 db/journals/f1000research/f1000research5.html#TuragaFBCTNT16
埃尼斯·阿夫根 内森·科拉尔 约翰·奇尔顿 丹农·贝克 詹姆斯·泰勒0001 银河队 为银河系内的生命科学实现云爆发。 4330-4343 2015 27 同意。计算。实际。支出。 16 https://doi.org/10.1002/cpe.3536 https://www.wikidata.org/entity/Q57002849 db/期刊/并发/并发27.html#AfganCCBTT15
埃尼斯·阿夫根 康斯坦蒂诺斯·克拉皮斯 努万·古纳塞卡拉 卡罗尔·斯卡拉 詹姆斯·泰勒0001 在公共和私有云上构建和提供生物信息环境。 223-228 2015 MIPRO公司 https://doi.org/10.109/MIPRO.2015.7160269 https://www.wikidata.org/entity/Q57002844 conf/mipro/2015 db/conf/mipro/mipro2015.html#AfganKGST15 克雷格·A·斯图尔特 蒂莫西·M·科克尔 伊恩·福斯特 大卫·Y·汉考克 Nirav C.商户 埃德温·斯基德莫尔 丹尼尔·斯坦齐奥内 詹姆斯·泰勒0001 史蒂文·图克 乔治·W·特纳 马修·沃恩 尼尔·I·加夫尼 Jetstream:一个自视、可扩展的科学和工程云环境。 29:1-29:8 2015 XSEDE公司 https://doi.org/10.1145/2792745.2792774 https://www.wikidata.org/entity/Q57002856 conf/xsede/2015 db/conf/xsede/xsede 2015.html#StewartCFHMSSTT15
丹尼尔·布兰肯伯格 詹姆斯·约翰逊 银河队 詹姆斯·泰勒0001 安东·内克鲁滕科 扭曲的银河参考数据。 1917-1919 2014 30 生物信息。 13 https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btu119 https://www.wikidata.org/entity/Q30768491 db/journals/bioinformatics/bioinformatics30.html#BlankenbergJTTN14
理查德·德勒杜克(Richard D.LeDuc) 马修·沃恩 约翰·M·方纳 迈克尔·沙利文 詹姆斯·G·威廉姆斯0003 菲利普·D·血液 詹姆斯·泰勒0001 威廉·巴奈特 利用国家网络基础设施进行生物医学研究。 195-199 2014 21 美国医学信息学协会。 2 https://doi.org/10.1136/amiajnl-2013-002059 https://www.wikidata.org/entity/Q28658731 db/journals/jamia/jamia21.html#LeDucVFSWBTB14
本杰明·D·蒲柏 泰隆·瑞巴 毗湿奴·迪利普 冯岳 吴伟胜 奥尔格特·德纳斯 丹尼尔·维拉 王艳丽(Yanli Wang) R.斯科特·汉森 特蕾莎·K·坎菲尔德 罗伯特·瑟曼 永成 古恩汉·古尔西 乔纳森·丹尼斯 迈克尔·斯奈德 约翰·斯塔马托亚诺波洛斯 詹姆斯·泰勒0001 罗斯·C·哈迪逊 塔梅尔·卡维奇 冰人 大卫·M·吉尔伯特 拓扑关联域是复制定时调节的稳定单位Open。 402-405 2014 515 国家。 7527 https://doi.org/10.1038/nature13986 https://www.wikidata.org/entity/Q34448599 db/journals/nature/nature515.html#PopeRDYWDVWHCTC14
埃尼斯·阿夫根 丹农·贝克 约翰·奇尔顿 内森·科劳 詹姆斯·泰勒0001 星系团到云-大规模基因组学。 47-50 2014 GCE@SC https://doi.org/10.109/GCE.2014.13 https://doi.ieecomputersociety.org/10.109/GCE.2014.13 http://dl.acm.org/citation.cfm?id=2690899 https://www.wikidata.org/entity/Q57002870 conf/sc/2014gce db/conf/sc/gce2014.html#AfganBCCT14
盖尔·克杰蒂尔·桑德夫 安东·内克鲁滕科 詹姆斯·泰勒0001 艾文德·霍维格 可复制计算研究的十条简单规则。 2013 9 公共科学图书馆计算。生物。 10 https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1003285 https://www.wikidata.org/entity/Q28974699 db/journals/ploscb/ploscb9.html#SandveNTH13
詹姆斯·泰勒0001 安东·内克鲁滕科 内森·科拉尔 菲利普·D·血液 亚历克斯·罗普勒夫斯基 张志辉 约瑟芬·帕伦西亚 Sergiu Sanielevici公司 贾里德·亚诺维奇 罗伯特·巴登 生物计算的可持续国家门户。 32:1-32:3 2013 XSEDE公司 https://doi.org/10.1145/2484762.2484817 https://www.wikidata.org/entity/Q57002874 conf/xsede/2013 db/conf/xsede/xsede 2013.html#TaylorNCBRZPSYB13
埃尼斯·阿夫根 布拉德·查普曼 詹姆斯·泰勒0001 CloudMan作为工具、数据和分析分发的平台。 315 2012 13 BMC生物信息。 https://doi.org/10.1186/1471-2105-13-315 https://www.wikidata.org/entity/Q27496492 db/journals/bmcbi/bmcbi13.html#AfganCT12
埃尼斯·阿夫根 丹农·贝克 安东·内克鲁滕科 詹姆斯·泰勒0001 用于在虚拟化环境中部署应用程序的参考模型。 1349-1361 2012 24 同意。计算。实际。支出。 12 https://doi.org/10.1002/cpe.1836 https://www.wikidata.org/entity/Q57002885 db/期刊/并发/并发24.html#AfganBNT12
杰里米·戈克斯 银河队 安东·内克鲁滕科 詹姆斯·泰勒0001 Galaxy是一个基于网络的高通量基因组分析平台。 1-6 2012 电子科学 https://doi.org/10.109/eScience.2012.6404442 https://doi.ieecomputersociety.org/10.109/eScience.2012.6404442 https://www.wikidata.org/entity/Q57234033网址 conf/eScience/2012 db/conf/eScience/eScience2012.html#GoecksTNT12
丹尼尔·布兰肯伯格 内森·科拉尔 格雷戈里·冯·库斯特 詹姆斯·泰勒0001 安东·内克鲁滕科 将各种数据库集成到统一的分析框架中:银河方法。 2011 2011 数据库J.Biol。数据库管理 https://doi.org/10.1093/database/bar011 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3092608/ https://www.wikidata.org/entity/Q28236549 db/journals/biodb/biodb2011.html#BlankenbergCKTN11
丹尼尔·布兰肯伯格 詹姆斯·泰勒0001 安东·内克鲁滕科 使整个基因组多重比对对生物学家有用。 2426-2428 2011 27 生物信息。 17 https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btr398 https://www.wikidata.org/entity/Q28243703 db/journals/bioinformatics/bioinformatics27.html#BlankenbergTNT11
杰里米·戈克斯 李坎伟 戴夫·金文斯 银河队 詹姆斯·泰勒0001 Galaxy Track Browser:将基因组浏览器从可视化工具转换为分析工具。 39-46 2011 生物视觉 https://doi.org/10.109/BioVis.2011.6094046 https://doi.ieecomputersociety.org/10.1109/BioVis.2011.6094046 conf/biovis/2011 db/conf/biovis/biovis2011.html#GoecksLCTa11 埃尼斯·阿夫根 杰里米·戈克斯 丹农·贝克 内特·科拉尔 安东·内克鲁滕科 詹姆斯·泰勒0001 银河:电子科学工具的门户。 145-177 2011 电子科学指南 https://doi.org/10.1007/978-0-85729-439-5_6 https://www.wikidata.org/entity/Q57002897 系列/ccn/YWJ2011 db/series/ccn/YWJ2011.html#AfganGBCN011
丹尼尔·布兰肯伯格 阿萨夫·戈登 格雷戈里·冯·库斯特 内森·科劳 詹姆斯·泰勒0001 安东·内克鲁滕科 使用Galaxy操作FASTQ数据。 1783-1785 2010 26 生物信息。 14 https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btq281 https://www.wikidata.org/entity/Q28285724 db/journals/bioinformatics/bioinformatics26.html#BlankenbergGKCTNT10
埃尼斯·阿夫根 丹农·贝克 内森·科拉尔 布拉德·查普曼 安东·内克鲁滕科 詹姆斯·泰勒0001 Galaxy CloudMan:提供云计算集群。 S4系列 2010 11 BMC生物信息。 第12页 https://doi.org/10.1186/1471-2105-11-S12-S4 https://www.wikidata.org/entity/Q28302570 db/期刊/bmcbi/bmcbi11S.html#AfganBCCNT10
埃尼斯·阿夫根 Gulsum Gudukbay阿克布卢特Gulsum Gudukbay公司 罗尔夫·巴科芬 温迪·培根 丹农·贝克 克里斯托弗·巴奈特 威廉·巴奈特 马德琳·E·巴塞蒂 贝雷尼斯·巴图特 马吕斯·范登·比克 马蒂亚斯·伯恩特 丹尼尔·布兰肯伯格 菲利普·D·血液 戴夫·鲍维尔 Yvan Le运动内衣 西蒙·布雷 安东尼·布雷托多 彼得·布里格斯 凯瑟琳·J·布罗姆黑德 罗伯特·巴登 特蕾莎·K·坎菲尔德 布里吉特·卡尔 马丁·切赫 布拉德·查普曼布拉德·查普曼 永成 约翰·奇尔顿 戴夫·金文斯 考克里尔蒂莫西·M·科克尔 弗雷德里克·科彭斯 内森·科拉尔内特·科拉尔 Gildas Le Corguillé 迈克尔·克鲁索 吉安马罗·库库鲁 奥尔格特·德纳斯 乔纳森·丹尼斯 阿桑塔·德桑托 毗湿奴·迪利普 卡尔·埃伯哈特 伊格纳西奥·埃吉诺亚 亚瑟·C·埃森劳尔 马蒂亚斯·法赫纳 杰里米·费舍尔 梅兰妮·克莉丝汀·费尔 约翰·M·方纳 丹尼尔·福尼卡 伊恩·福斯特 安妮·福伊洛 马洛里·安·弗里伯格 尼尔·加夫尼尼尔·I·加夫尼 克里斯托巴尔·加拉多·阿尔巴克里斯托巴尔·加拉多 Shilpa Garg公司 大卫·M·吉尔伯特 西蒙·格拉德曼 杰里米·戈克斯 谢尔盖·戈利琴斯基 努万·古纳塞卡拉 阿萨夫·戈登 蒂莫西·格里芬 比约恩·A·格林 羌古 艾萨姆·格勒 Günhan Gülsoy先生 大卫·Y·汉考克 R.斯科特·汉森 罗斯·C·哈迪森 弗洛里安·海尔 詹妮弗·希尔曼·杰克逊 萨西娅·希尔特曼 汉斯·鲁道夫·霍茨 托尔斯滕·霍瓦尔特 艾文德·霍维格 卡梅隆·海德 普拉蒂克·贾格塔普 瓦希德·贾利利 詹姆斯·约翰逊 贾亚德夫·乔希 塔梅尔·卡维奇 凯万·卡马利 威廉·德科宁 康斯坦蒂诺斯·克拉皮斯 娜塔莉·库彻 安纳普·库马尔 格雷戈里·冯·库斯特 布拉德利·兰霍斯特 德尔芬·拉里维埃 罗斯·拉扎勒斯 理查德·德勒杜克(Richard D.LeDuc) 李黎明 西蒙·利奥 李坎伟 安德鲁·罗尼 安德鲁·罗尼 露西尔·洛佩兹·德利斯勒 约翰·迈克尔·洛 亚历山大·马哈茂德 沃尔夫冈·迈尔0003 伊戈尔·马库宁 彼得罗·曼德雷利 苏比纳·P·梅塔 佩特拉·梅兰妮 Nirav C.商户 特蕾丝·米勒 大卫·德利马·莫利斯 巴勃罗·莫雷诺 维杰·K·纳甘帕利 Engy Nasr公司 安东·内克鲁滕科 亚历山大·奥斯特罗夫斯基 约瑟芬·帕伦西亚 尼科·平特 本杰明·D·蒲柏 克日什托夫·波特洛维奇 加雷思·普莱斯 狐猴E.Psomopoulos 伊苏鲁·拉那瓦卡 埃里克·拉什 海伦娜·拉什 布莱恩·劳本诺 鲍里斯·雷博莱多-贾拉米略 冰人 尼克·罗德斯 米盖尔·隆科尼 亚历山大·罗普列夫斯基亚历克斯·罗普勒夫斯基 科林·罗亚克斯 泰隆·瑞巴 盖尔·科杰蒂尔·桑德夫 Sergiu Sanielevici公司 卢克·萨金特 迈克尔·C·沙茨 比阿特丽斯·塞拉诺·索拉诺 卡罗尔·斯卡拉 埃德温·斯基德莫尔 迈克尔·斯奈德0001迈克尔·斯奈德 尼古拉·索兰佐 约翰·斯塔马托亚诺波洛斯 丹尼尔·斯坦齐奥内(Daniel C.Stanzione Jr.)。丹尼尔·斯坦齐奥内 克雷格·A·斯图尔特 尼古拉斯·斯托勒 基思·苏德曼 迈克尔·沙利文 安娜·赛姆 大卫·洛佩斯·塔伯内罗 马可·安东尼奥·坦加罗 银河队 Mehmet Tekman公司 罗伯特·瑟曼 史蒂文·图尔克 尼特斯·图拉加 乔治·W·特纳 伊夫·范登布鲁克 马修·沃恩马修·沃恩 丹尼尔·维拉 巴凡库马尔·维德姆 鲁本·霍德曼 王艳丽(Yanli Wang) 拉尔夫·J·M·韦伯 维克托·温 詹姆斯·威廉姆斯0003 吴伟胜 贾里德·亚诺维奇 冯岳 费德里科·赞贝利 张志辉