2023年WABI第23届: 美国德克萨斯州休斯顿
贾马尔·贝拉佐古吉 , 阿伊达·瓦朗拉乌阿 :
第23届生物信息学算法国际研讨会,2023年9月4日至6日,WABI 2023,美国德克萨斯州休斯顿。 LIPIcs公司 273, 达格斯图尔-莱布尼兹·泽特鲁姆宫(Schloss Dagstuhl-Leibniz-Zentrum für Informatik) 2023 ,国际标准图书编号 978-3-95977-294-5 -
Front Matter,目录,序言,会议组织。 0:1-0:14 特蕾莎·M·普尔兹蒂卡 :
研究癌症突变过程的算法方法(受邀演讲)。 1:1-1:2 沈成泽 , 刘灞桥 , 凯利·威廉姆斯 , 坦迪·J·沃诺 :
EMMA:将序列添加到约束对齐中,具有高精度和可伸缩性(抽象)。 2:1-2:2 埃莉诺·韦德尔 , 沈成泽 , 坦迪·J·沃诺 :
BATCH-SCAMPP:将系统发育放置方法缩放为放置多个序列(摘要)。 3:1-3:2 沙耶斯特·阿拉斯蒂 , 西瓦什·米拉拉布 :
四重奏在次二次时间内的最佳子树修剪和重绘。 4:1-4:20 戴俊彦 , 托比亚斯·鲁贝尔 , 韩云恒 , 艾琳·K·莫洛伊 :
利用约束和动态编程解决大型Dollo节约问题。 5:1-5:23 帕维尔·戈雷基 , 纳塔莉亚·鲁特卡 , 阿格尼什卡·米科维奇卡 , 雅罗斯瓦夫·帕泽克 :
重复片段的同步重建和基因种映射。 6:1-6:18 利奥·范·埃尔塞尔 , 马克·琼斯 , 埃丝特·朱利安 , 村上有彦 :
通过添加树叶创建网络果园。 7:1-7:20 韩云恒 , 艾琳·K·莫洛伊 :
四分位数可以在无偏误差和偏差模型下对细胞谱系树进行统计一致性估计(摘要)。 8:1-8:2 Mrinmoy Saha Roddur先生 , 萨吉·斯尼尔 , 穆罕默德·埃尔·凯比尔 :
推断时间一致的迁移历史记录。 9:1-9:22 尼古拉·里佐 , 曼努埃尔·卡塞雷斯 , 维利·梅基宁 :
在图中寻找最大精确匹配。 10:1-10:17 宇通球 , 沈一航(Yihang Shen) , 卡尔·金斯福德 :
重新审视图形遍历编辑距离及其变量的复杂性和算法。 11:1-11:22 Jyotshna Rajput公司 , 甘西亚姆·钱德拉 , Chirag Jain公司 :
泛基因组图上的共线性链。 12:1-12:18 亚伦·洪 , 马可·奥利瓦 , 多米尼克·科普 , 希德奥·班奈 , 克里斯蒂娜·鲍彻 , 特拉维斯·加吉 :
通过无前缀解析加速FM-Index查询。 13:1-13:16 蒂齐安·舒尔茨 , 保罗·梅德韦杰夫 :
精确的基于草图的读取映射。 14:1-14:19 蒂莫斯·鲁泽 , 伊戈尔·马尔塔扬 , 卡米尔·马歇 , Antoine Limasset公司 :
高效轻量级基因组数据绘制的分数命中集。 15:1-15:27 贾姆希德·汗 , 托比亚斯·鲁贝尔 , 拉克斯曼·杜利帕拉 , 艾琳·K·莫洛伊 , 罗伯·帕特罗 :
快速、并行和缓存友好的后缀数组构造。 16:1-16:21 阿马图·拉赫曼 , 尤安·杜弗兰 , 保罗·梅德韦杰夫 :
彩色de Bruijn图的压缩算法。 17:1-17:14 杰森·范 , 努尔·普拉塔普·辛格 , 贾姆希德·汗 , 朱利奥·埃尔曼诺·皮比里 , 罗伯·帕特罗 :
Fulgor:用于大规模匹配和颜色查询的快速紧凑的{k-mer}索引。 18:1-18:21 马特奥·格雷 , 塞巴斯蒂安·威尔 , 霍斯纳·贾巴里 :
SparseRNAFolD:稀疏RNA无假结折叠,包括悬挂。 19:1-19:18 塞奥·布里 , 亚恩·蓬蒂 , 弗拉基米尔·莱因哈兹 :
利用参数化采样技术自动探索RNA非经典几何模式的自然变异性。 20:1-20:22 新余顾 , 渊源琦 , 穆罕默德·埃尔·凯比尔 :
平衡最小自由能和密码子适应指数以进行帕累托最优RNA设计。 21:1-21:20 伦纳德·博恩卡·佩尔(Leonard Bohnenkämper) :
桥接对自然距离问题无封盖解决方案的DCJ-Indel模型的不同观点。 22:1-22:18 莫森·费尔多西 , 葛跃军 , 卡尔·金斯福德 :
机器人液体处理器规划的强化学习。 23:1-23:16