数据来源：克隆攻击蚂蚁Cerapachys biroi的基因组

彼得·奥克斯利。,洛克菲勒大学

冀、鲁

英格丽德·费特·普鲁内达,洛克菲勒大学

肖恩·麦肯齐（Sean K.McKenzie）。,洛克菲勒大学

李、蔡

胡浩福

张国杰,哥本哈根大学

Daniel J.C.Kronauer。,洛克菲勒大学

2015年1月22日出版在德莱德.https://doi.org/10.5061/dryad.71nv1

引用此数据集

Oxley，Peter R.等人（2015年）。数据来源：克隆袭击蚁Cerapaches biroi的基因组【数据集】。德莱德。https://doi.org/10.5061/dryad.71nv1

摘要

群居昆虫是社会进化和行为的重要模型。然而，在许多物种中，对调节分工的重要因素（如基因型和年龄）的实验控制是有限的。此外，大多数物种都有固定的女王和工蚁等级，这使得很难在昆虫社会的标志——生殖分工的分子机制之间建立因果关系。在这里，我们展示了无女王克隆攻击蚂蚁Cerapachys biroi的基因组，这是一个强大的新研究系统，不受这些限制。利用细胞学和RAD-seq技术，我们发现，毕氏梭菌通过中心融合的自混合繁殖，杂合性丢失得非常缓慢。因此，巢友几乎是克隆相关的（r=0.996）。比罗伊梭子蟹群体的工人在繁殖和育雏之间同步轮换，年轻工人在同步队列中退出。我们表明，与其他群居昆虫劳动分工相关的基因在白纹夜蛾中是保守的，并且在群体周期中是动态调节的。凭借对个体基因型和年龄的无与伦比的实验控制，以及诱导繁殖和育雏的能力，比罗伊梭子蟹在阐明分工的分子调控方面具有巨大潜力。

使用说明

白背金龟化学感受基因、UGTs和CYPs的基因细节

表1包含来自Cerapachys biroi的所有手动注释的化学感受基因的详细信息。表2包含按分支组织的所有测序的蚂蚁UDP糖基转移酶（如Oxley等人的补充数据所述）。表3包含按分支组织的所有已测序蚂蚁细胞色素P450基因（如Oxley等人的补充数据所述）。

UGT CYP和OR基因列表.xlsx

昆虫UDP糖基转移酶的肌肉比对

含有保守特征基序的UDP糖基转移酶的比对（Mackenzie等人，药理学（1997）7255-269）。序列包括基序和100个上游和下游氨基酸。有关详细信息，请参阅Oxley等人的补充数据：UDP糖基转移酶（UGTs）。

UGTs_321.肌肉.快速

昆虫UGT最大似然树NEXUS文件

最大似然树是使用Garli 2.0（泊松+G+I进化模型；选择五次运行中的最佳树），使用此存储库中提供的对齐方式构建的。

UGTs_321.tre公司

昆虫细胞色素P450基因的肌肉比对

所有测序蚂蚁CYP和代表性双翅目、膜翅目和鳞翅目CYP的肌肉排列。手动检查所有基因是否存在保守基序（Nelson，D.Methods Mol.Biol.（2006）320，1-10）。对比对进行了进一步编辑，以删除高变非服务N端直至（但不包括）N端锚定序列，以及C螺旋和I螺旋之间的区域。更多详细信息见补充数据：Oxley等人的细胞色素P450基因。

CYPs_573.肌肉.快速

昆虫CYP最大似然树的NEXUS文件

使用该库中提供的蛋白质比对，使用Garli 2.0（泊松+G+I进化模型；选择两次运行的最佳树）构建最大似然系统发育。有关更多详细信息，请参阅Oxley等人的补充数据：细胞色素p450基因。

CYPs_573.tre公司