数据来源：开花植物的进化根源
摘要
被子植物辐射的正确生根对于理解开花植物生理和表型特征的起源和进化既具有挑战性，又是必要的。众所周知，这个问题很难解决，因为开花植物与其他种子植物之间存在很大的遗传距离，而且基本被子植物中的分类单元采样很少。在这里，我们为叶绿体DNA序列分析中的替代模型错误指定问题提供了进一步的证据。我们表明，Amborella作为最基本被子植物谱系的唯一代表，其支持是建立在时序位点模式的基础上的，而时序位点模式在时间可逆替代模型中描述得很差。通过改进序列数据和替代模型之间的拟合，确定Trithuria、Nymphaeales和Amborela为开花植物最基本谱系的存活亲属。这一发现表明，水生和草本物种在现存最早的开花植物谱系中占主导地位。
使用说明
S1（第一阶段）
40553个位置的间隙对准长度用于产生OV对准
S2系列
第一和第二密码子位置的比对25246个位置的长度
