<!-- README.md是从README生成的。房间。请编辑该文件-->#ggtree:一个可视化系统发育树及其注释数据的R包<a href=“https://yula-smu.github.io/treedata-book/“><img src=”https://raw.githubusercontent.com/Bioconductor/BiocStickers/master/ggtree/ggtree.png“height=”200“align=”right“/></a>[![平台](http://www.bioconductor.org/shields/availability/devel/ggtree.svg)](https://www.bioconductor.org/packages/devel/bico/html/ggtree.html#archives)[![](https://img.shields.io/badked/release%20version-3.4.2-绿色.svg)](https://www.bioductor.org/packages/ggtree网址)[![codecov](https://codecov.io/gh/GuangchuangYu/ggtree/branch/master/graph/bode.svg)](https://codecov.io/gh/GuanghuangYu/ggtree)[![太棒了](https://cdn.rawgit.com/sindresorhus/awesome/d7305f38d29fed78fa85652e3a63e154dd8e8829/media/bade.svg)](https://awesome-r.com/#太棒了-r图形显示)<!--[![项目状态:活动-项目已达到稳定可用状态,正在积极开发中。](http://www.repstatus.org/bodes/latest/active.svg)](http://www.repostatus.org/#active)[![生物](http://www.bioconductor.org/shields/years-in-bioc/ggtree.svg)](https://www.bioconductor.org/packages/devel/bico/html/ggtree.html#自)[![上次更改日期](https://img.shields.io/badked/last%20change-2022--09--29-绿色.svg)](https://github.com/GuangchuangYu/ggtree/commits/master网站)`r bade_devel(“广双鱼/ggtree”,“绿色”)``r徽标_bioc_download(“ggtree”,“total”,“blue”)``r徽标_bioc_download(“ggtree”,“month”,“blue”)``r徽标_bioc_download_rank(“ggtree”)`-->“ggtree”扩展了“ggplot2”绘图系统,该系统实现了图形语法。”ggtree”是为可视化和系统发育树和其他树状结构的注释它们的注释数据。##:writing_hand:作者广创裕南方医科大学基础医学院<https://yula-smu.top>[![推特](https://img.shields.io/twitter/url/http/shields.io.svg?style=social&logo=twitter)](https://twitter.com/intent/tweet?hashtags=ggtree&url=http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.111/2041-210X.12628/abstract&screen_name=guangchuangyu)[![说谢谢](https://img.shields.io/bode/say-thanks-ff69b4.svg)](https://saythanks.io/to/GuanghuangYu)[![](https://img.shields.io/badge/flowe%20me%20on(网址:https://img.shields.io/badge/flowe%20me%20on)-WeChat-green.svg)](https://guangchuangyu.github.io/blog_images/biobabble.jpg)如果使用[ggtree](http://bioconductor.org/packages/ggtree)英寸发表的研究,请引用其中最合适的论文列表:1.S Xu、L Li、X Luo、M Chen、W Tang、L Zhan、Z Dai、TT.Lam、Y Guan、,**G Yu**。Ggtree:用于可视化的序列化数据对象系统发育树和注释数据***iMeta***,2022,1(4):e56。doi:[10.1002/imt2.56](https://doi.org/10.1002/imt2.56)2.**G于**。数据集成、操作和可视化系统发育树(第1版)***查普曼和霍尔/CRC***,2022年。doi:[10.1201/9781003279242](https://doi.org/10.10201/9781003279242)3.**G于**。使用ggtree可视化树状结构上的数据。***生物信息学现行协议***,2020,69:e96。数字对象标识:[10.1002/cpbi.96](https://doi.org/10.1002/cpbi.96)-[源代码和数据用于在文章](https://github.com/GuangchuangYu/ggtree-current-protocols网站)4.**G Yu**<sup>\*</sup>,TTY Lam,H Zhu,Y Guan。两个绘制和可视化系统发育相关数据的方法使用ggtree***分子生物学与进化***,2018,35(2):3041-3043. 数字对象标识:[10.1093/molbev/msy194](https://doi.org/10.1093/molbev/msy194)-[生成补充的源代码材料](https://github.com/GuangchuangYu/plotting_tree_with_data)5.**G Yu**、DK Smith、H Zhu、Y Guan、TTY Lam。ggtree:一个用于系统发育树可视化和注释的R包及其协变量和其他相关数据***中的方法生态与进化***。2017, 8(1):28-36. 数字对象标识:[10.1111/2041-210X.12628](https://doi.org/10.1111/2041-210X.12628)<中心><a href=“https://www.routledge.com/Data-Integration-Moperation-and-Vization-of-Phylogenetic-Trees/Yu/p/book/9781032233574“><img src=”https://yula-smu.top/treedata-book/9781032233574_cover_review.png“style=”宽度:500px;边框:2px纯黑色;“/></a></中心>##:sparking_heart:贡献我们欢迎任何贡献!通过参与此项目,您同意遵守《行为](Conduct.md)。