姓名 模式 大小
.github文件 040000
R(右) 040000
安装 040000
男人 040000
测验 040000
小插曲 040000
.R生成忽略 100644 0千字节
.gitignore(.git忽略) 100644 0千字节
.svnignore(.svnignore) 100644 0千字节
.travis.yml 100644 1千字节
导管.md 100644 1千字节
出资.md 100644 4千字节
贡献者.md 100644 1千字节
描述 100644 2千字节
生成文件 100644 2千字节
NAMESPACE公司 100644 7千字节
新闻 100644 36千字节
新闻.md 100644 22千字节
自述。房间 100644 4千字节
自述.md 100644 5千字节
估价师.yml 100644 1千字节
新的bioc版本.sh 100755 1千字节
自述.md
<!-- README.md是从README生成的。房间。请编辑该文件-->#ggtree:一个可视化系统发育树及其注释数据的R包<a href=“https://yula-smu.github.io/treedata-book/“><img src=”https://raw.githubusercontent.com/Bioconductor/BiocStickers/master/ggtree/ggtree.png“height=”200“align=”right“/></a>[![平台](http://www.bioconductor.org/shields/availability/devel/ggtree.svg)](https://www.bioconductor.org/packages/devel/bico/html/ggtree.html#archives)[![](https://img.shields.io/badked/release%20version-3.4.2-绿色.svg)](https://www.bioductor.org/packages/ggtree网址)[![codecov](https://codecov.io/gh/GuangchuangYu/ggtree/branch/master/graph/bode.svg)](https://codecov.io/gh/GuanghuangYu/ggtree)[![太棒了](https://cdn.rawgit.com/sindresorhus/awesome/d7305f38d29fed78fa85652e3a63e154dd8e8829/media/bade.svg)](https://awesome-r.com/#太棒了-r图形显示)<!--[![项目状态:活动-项目已达到稳定可用状态,正在积极开发中。](http://www.repstatus.org/bodes/latest/active.svg)](http://www.repostatus.org/#active)[![生物](http://www.bioconductor.org/shields/years-in-bioc/ggtree.svg)](https://www.bioconductor.org/packages/devel/bico/html/ggtree.html#自)[![上次更改日期](https://img.shields.io/badked/last%20change-2022--09--29-绿色.svg)](https://github.com/GuangchuangYu/ggtree/commits/master网站)`r bade_devel(“广双鱼/ggtree”,“绿色”)``r徽标_bioc_download(“ggtree”,“total”,“blue”)``r徽标_bioc_download(“ggtree”,“month”,“blue”)``r徽标_bioc_download_rank(“ggtree”)`-->“ggtree”扩展了“ggplot2”绘图系统,该系统实现了图形语法。”ggtree”是为可视化和系统发育树和其他树状结构的注释它们的注释数据。##:writing_hand:作者广创裕南方医科大学基础医学院<https://yula-smu.top>[![推特](https://img.shields.io/twitter/url/http/shields.io.svg?style=social&logo=twitter)](https://twitter.com/intent/tweet?hashtags=ggtree&url=http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.111/2041-210X.12628/abstract&screen_name=guangchuangyu)[![说谢谢](https://img.shields.io/bode/say-thanks-ff69b4.svg)](https://saythanks.io/to/GuanghuangYu)[![](https://img.shields.io/badge/flowe%20me%20on(网址:https://img.shields.io/badge/flowe%20me%20on)-WeChat-green.svg)](https://guangchuangyu.github.io/blog_images/biobabble.jpg)如果使用[ggtree](http://bioconductor.org/packages/ggtree)英寸发表的研究,请引用其中最合适的论文列表:1.S Xu、L Li、X Luo、M Chen、W Tang、L Zhan、Z Dai、TT.Lam、Y Guan、,**G Yu**。Ggtree:用于可视化的序列化数据对象系统发育树和注释数据***iMeta***,2022,1(4):e56。doi:[10.1002/imt2.56](https://doi.org/10.1002/imt2.56)2.**G于**。数据集成、操作和可视化系统发育树(第1版)***查普曼和霍尔/CRC***,2022年。doi:[10.1201/9781003279242](https://doi.org/10.10201/9781003279242)3.**G于**。使用ggtree可视化树状结构上的数据。***生物信息学现行协议***,2020,69:e96。数字对象标识:[10.1002/cpbi.96](https://doi.org/10.1002/cpbi.96)-[源代码和数据用于在文章](https://github.com/GuangchuangYu/ggtree-current-protocols网站)4.**G Yu**<sup>\*</sup>,TTY Lam,H Zhu,Y Guan。两个绘制和可视化系统发育相关数据的方法使用ggtree***分子生物学与进化***,2018,35(2):3041-3043. 数字对象标识:[10.1093/molbev/msy194](https://doi.org/10.1093/molbev/msy194)-[生成补充的源代码材料](https://github.com/GuangchuangYu/plotting_tree_with_data)5.**G Yu**、DK Smith、H Zhu、Y Guan、TTY Lam。ggtree:一个用于系统发育树可视化和注释的R包及其协变量和其他相关数据***中的方法生态与进化***。2017, 8(1):28-36. 数字对象标识:[10.1111/2041-210X.12628](https://doi.org/10.1111/2041-210X.12628)<中心><a href=“https://www.routledge.com/Data-Integration-Moperation-and-Vization-of-Phylogenetic-Trees/Yu/p/book/9781032233574“><img src=”https://yula-smu.top/treedata-book/9781032233574_cover_review.png“style=”宽度:500px;边框:2px纯黑色;“/></a></中心>##:sparking_heart:贡献我们欢迎任何贡献!通过参与此项目,您同意遵守《行为](Conduct.md)。