#更容易<img src=“vignettes/easier_logo.png”alt=“easier logo”width=“70”height=“70“align=”right“>---<!-- 徽章:开始-->[![R-CMD-检查](https://github.com/olapuentesantana/easier_devel/workflows/R-CMD-check/badge.svg)](https://github.com/olapuentesantana/easier_devel/actions网站)<!-- 徽章:结束-->##描述“更容易”的目标是使用easier从RNA-seq数据中预测抗肿瘤免疫反应。EaSIeR是一种基于肿瘤特异性免疫反应模型预测生物标记物免疫治疗的工具。模型生物标记物已在文献中通过实验验证,EaSIeR预测的性能已通过使用来自四种不同癌症类型的独立数据集以及接受抗PD1或抗PD-L1治疗的患者进行验证。这些模型通过“easierData”包提供,可以使用“get_opt_models()”进行访问。请参见[Lapunte-Santana O等人,Patterns,2021,](https://doi.org/10.1016/j.patter.2021.100293)有关EaSIeR的更多详细信息。<img src=“vignettes/assier_image.png”width=“550”alt=“easier方法”>##安装您可以使用以下工具从生物导体安装“更容易”的软件包:```第页if(!requireNamespace(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“更容易”)```此外,您可以从GitHub存储库安装开发版本:```第页库(“远程”)远程::install_github(“olapuentesantana/easier”,依赖项=真,build_vignettes=真)```##示例在小插曲中提供了更详细的管道:```第页vignette(“easier_user_manual”,package=“easier”)```##引文如果您在工作中使用此软件包,请引用原始EaSIeR研究:拉普特·桑塔纳,澳大利亚。,van Genderen,M.、Hilbers,P.、Finotello,F.和Eduati,F.(2021)可解释的系统生物标记物可预测对免疫抑制剂的反应。”Patterns(纽约),2(8),100293。https://doi.org/10.1016/j.patter.2021.100293