中国科学院数学与系统科学研究院(简称：数学院）主办18种学术期刊，挂靠三个一级学会。这些期刊和学会是中国数学发展历史的一个缩影，蕴含着中国几代数学家付出的心血，覆盖了数学与系统科学的各个主要领域，代表了我国数学和系统科学的最高水平，为推动我国数学研究水平和国际学术交流发挥了应有的重要作用。近些年来，随着我国科技发展由大变强，我院期刊学会对我国科技发展和学术交流的影响也更加深远。
中国科协等“卓越行动计划”入选期刊（2019-2024）
主办期刊
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数学学报
《中国1936年，是中国数学会最早的刊物，也是中国的第一个数学期刊，主要刊登纯粹数学和应用数学方面具有独创性的优秀成果性论文，例如代数，数论，分析，偏微分方程，几何，概率论等。权威的反映当今数学研究的发展。本刊为国内各核心期刊评选机构所评选的核心期刊，收录本刊的国内外权威性检索机构包括：国内各大数据库，美国数学会《数学评论》，俄罗斯《数学文摘》，英国《科学文摘》及德国《数学文摘》等。现任主编是周向宇院士。
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数学学报（原文）
《数学学报》由中国数学学会于1936年创办，是中国第一本也是最好的数学期刊。1985年，《数学学报》分为英文系列和中文系列。《英语丛书》是一份月刊，发表重要的研究论文来自纯数学和应用数学的所有分支。它提供了数学研究当前发展的权威评论。主编为马志敏教授（院士）和田刚教授（院务委员）。
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应用数学学报
《应用数学学报》是中国数学会、中科院数学与系统科学研究院主办的中国一流的数学刊物，创刊于1976年，创办人是老一辈爱国数学家华罗庚先生。《应用数学学报》为双月刊，16开，主要刊登国际、国内数学、应用数学及相关领域有关理论、方法及应用方面的研究论文，注重论文的创新性及学术水平。国内所有的核心期刊评选机构都将本刊列为核心期刊，国外数学领域有重要影响的数学文摘刊物，如美国数学会的《圣母玛利亚》、《圣母玛丽亚》《数学文摘》、英国的《南澳大利亚州》和德国《数学文摘》等也都有收录。曾获 “全国优秀科技期刊”、“中国科学院优秀科技期刊”奖、曾入选中国期刊方阵“双奖期刊”、“百种中国杰出学术期刊”等。
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应用数学学报(英文版)
《数学应用学报》（英文系列）是由中国科学院数学学会和数学与系统科学研究院创办和编辑，德国施普林格出版社出版的季刊。AMAS是一家综合性国际公司数学期刊，刊登世界各地应用数学及其相关领域所有分支的高质量原创研究论文。它旨在展示数学研究的最新成果，促进国际学术交流。
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系统科学与数学
《系统科学与数学》是国内外公开发行的学报类月刊，是国内核心期刊之一，主要刊登系统科学以及与系统科学有关的数学、交叉科学、工程应用等方面在理论和方法上具有创造性的学术论文，创造性地解决实际问题的科学技术报告，以及重要学术动态的报道。读者我觉得这是一个很好的例子刊登内容包括：系统理论与控制、系统工程与管理、统计方法及应用、信息处理和计算机数学等领域的学术论文及技术报告; 重要学术动态和学术活动信息等。
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系统科学与复杂性学报（英文版）
《系统科学与复杂性杂志》（JSSC）是一本双月刊，发表关于系统科学和复杂性科学的数学理论、方法论和应用的高质量论文。它鼓励对复杂系统和复杂性进行基础研究，并促进跨学科研究阐明自然、人工和社会系统中常见数学方法的方法。JSSC被SCI Expanded、Ei Compendex等收录，并被《中国科技期刊优秀行动计划》评选。
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计算数学
《计算数学》创刊于1979年，主办单位是中国科学院数学与系统科学研究院。《计算数学》是数值计算的理论、分析及其应用的学术性刊物。期刊主要刊登国内外科研人员在计算数学基础理论、方法和科学计算研究方面所取得的具有创造性和重大学术意义的科研成果论文。
计算数学(英文版)
《计算数学杂志》是一本涵盖数值方法、分析和应用的国际期刊。该杂志发表了现代计算数学所有分支的原创研究论文，如线性和非线性代数、数值优化、数值近似、计算几何、计算统计学和概率、蒙特卡罗方法、常微分方程的数值方法、积分方程和偏微分方程，包括正问题和反问题等。
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系统工程理论与实践
《系统工程理论与实践》是中国系统工程学会会刊，于1981年创刊，是系统工程领域创办的第一个刊物，记载和见证了中国系统科学与系统工程以及管理科学的成长和发展，具有深厚的历史积淀和人文传承。本刊为月刊，每月25日出版。主要刊登系统工程理论与方法及其在管理、信息、金融、经济、能源、环境、军事、工业、农业、教育等领域中具有重要学术影响的创新理论和具有重要应用价值的优秀成果。本刊是国家自然科学基金委员会管理科学A类级重要学术期刊，被EI、CSSCI、CSCD、Scopus、CSTPCD、北大中文核心期刊等收录，2019年入选中国科技期刊卓越行动计划， 在2020年管理科学高质量期刊推荐列表中属于T1周
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系统科学与信息学报（英）文
《系统科学与信息杂志》（Journal of Systems Science and Information，JSSI）是一份经同行评审的多学科双月刊，创刊于2003年，主要关注系统科学与系统工程、管理科学和信息科学。该杂志旨在建立一个平台，提供最新的系统科学和管理科学的研究成果，促进国内外学术交流。JSSI由CSCD、Scopus和CNKI负责，在将这些前沿理论和方法付诸实践方面做出了卓越贡献。
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代数集刊（英文）
代数学术讨论会是1994年初创办的国际数学期刊。该书由中国科学院数学与系统科学研究院与苏州大学联合编辑，每年3月、6月、9月和12月以英文出版，由世界科学出版社在除中国大陆以外的包括香港和台湾在内的所有国家和地区发行。代数座谈会由《科学引文索引扩展》（SCIE，也称为SciSearch）、《研究警报》、《计算机数学引文索引》（CMCI）、《数学科学网》等索引或文摘。
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数学译林
《数学译林》是由中国科学院数学与系统科学研究院数学研究所主办的以译文为主的综合性数学刊物，目的是介绍国内外数学的进展，普及现代数学知识，促进我国数学事业的发展和水平的提高。选题内容有综合报告、专题介绍、数学史、数学小品、人物传记、数学教育以及其他等方面。1980年以来受到广大读者的欢迎与支持。
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数学的实践与认识
《数学的实践与认识》是中国数学会会刊，创刊于1971年，是由中国科学院主管、中国科学院数学与系统科学研究院主办的学术期刊。主要刊登数学的最新理论成果及其在工业、农业、环境、军事、教育、科研、经济、金融、管理、决策等工程技术、自然科学和社会科学中的应用成果、方法和经验。主要栏目包括数学建模、管理科学、工程、应用、研究、信息科学、教学研究、数学史等。《数学的实践与认识》始终致力于为数学工作者与其他科技工作者之间的学术交流搭建良好平台，积极推动应用数学在我国的发展。
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数值计算与计算机应用
《数值计算与计算机应用》是由中国科学院数学与系统科学研究院主办的学术性刊物，季刊，1980年创刊，国内外公开发行。主要刊登应用计算机解决各种科学和工程问题的数学模型、计算方法、软件技术和重大数值模拟实践等方面所取得的创造性成果和研究报告。期刊宗旨在于促进多种学科在数值计算及其软件的理论、方法和技术方面的交叉渗透与发展。
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计量经济学报
《计量经济学报》创刊于2021年1月，是由中国科学院主管、中国科学院数学与系统科学研究院主办的学术期刊。该刊为季刊，主要刊登计量经济学领域的原创理论和高水平应用研究成果，致力于促进计量经济学与其他学科的交叉与应用，推动中国经济学研究的高质量发展。期刊以国家重大需求为导向，从中国现实经济问题中提炼出重要的经济思想和科学问题，创新研究方法，推广定性与定量相结合的科学研究范式，并用以揭示世界百年未有之大变局下中国经济乃至世界经济的运行规律，为解决中国与世界重要现实经济问题提供理论指引和方法支撑，同时，将中国经济故事凝练、上升为现代经济学的一般命题，为现代经济学的发展贡献中国智慧。
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系统与控制纵横
《系统与控制纵横》（信息：关于系统和控制）是由中国科学院数学与系统科学研究院和中国自动化学会控制理论专业委员会联合主办的科普型刊物，主要刊登系统科学与控制科学领域知识性、趣味性、普及性的文章，旨在弘扬学科文化，梳理发展脉络，传播科学知识，宣传科研成果，服务人才培养，积极推进学科普及工作，让更多的人了解系统科学与控制科学的过去、现在和未来。本刊面向大中院校教师和学生，本领域研究生、科研人员，以及对本学科感兴趣的人士。本刊为半年刊，主要栏目包括：科学人物、学人风采、学科史林、漫谈系统控制、逸闻趣事、博文撷英、奇思异想、软硬兼施、教学交流、应用范例、专家论丛、精彩书评、难题征解、读者来信等。
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控制理论与应用
《控制理论与应用》是教育部主管、由华南理工大学和中科院数学与系统科学研究院联合主办的全国学术刊物。主要报道在系统控制科学中具有新观念、新思想的理论研究成果及其在各个领域中, 特别是在空天海洋、轨道交通、智能电网、先进制造等各个领域的应用研究成果，也重点关注新一代信息技术、高端装备、新能源汽车、新能源与节能环保等新兴产业中技术开发、技术改造中的应用成果。为控制领域的科学家和工程师们提供一个交流最新成果的平台。本刊于1984年创刊，月刊，国内外公开发行。中国科学引文数据库首批统计源期刊，中文核心期刊，被美国《工程》、《国际工程》、德国《数学文摘》、德国《SCOUPS》等国际检索系统收录。
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控制理论与技术(英文)
控制理论与技术由华南理工大学和中国科学院数学与系统科学研究院共同赞助。这是一份国际同行评议期刊，为控制科学家和工程师交流提供了一个论坛相关知识和经验。它发表关于控制理论和应用的高质量论文，特别关注系统和控制领域的新兴主题、原创方法和尖端技术。
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挂靠学会
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中国数学会
中国数学会是中国数学工作者的学术性社会团体。中国数学会的主要工作有：组织学术交流活动，编辑出版数学刊物，开展国际学术交流，举办数学竞赛，开展普及工作，组织促进数学教育改革的活动，举办培训班或讨论班等。
中国运筹学会
中国运筹学会是中国运筹学工作者的学术性群众团体，是依法成立的社团法人，是发展中国运筹学事业的一支重要社会力量，是中国科学技术协会的组成部分。在注重自身发展的同时，中国运筹学会也积极开展同国际运筹学界的交流与合作，主办了多次大型国际学术会议，并通过这些国际学术交流活动确定了中国运筹学会在整个国际运筹学界中的地位。中国运筹学会还主办《运筹学学报》和《运筹与管理》两份杂志。2013年，中国运筹学创办了新的英文期刊中国手术室学会学报（JORSC）
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中国系统工程学会
中国系统工程学会（SESC）全国一级学会。1979年由钱学森、宋健、关肇直、许国志等21名专家、学者共同倡议并筹备。1980年11月18日在北京正式成立第一届理事会理事长关肇直， 第二、三届理事长许国志，第四、五届理事长顾基发，第六、七届理事长陈光亚，第八、九届理事长汪寿阳,第十届理事长杨晓光。业务主管单位(或党建管理机关）：中国科协技术协会。分支机构35个， 公开出版刊物（9种）。
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